کم نمائندگی بیسلفائٹ تسلسل (آر آر بی)
کم نمائندگی بیسلفائٹ تسلسل (آر آر بی ایس) ڈی این اے میتھیلیشن ریسرچ میں پورے جینوم بیسلفائٹ تسلسل (ڈبلیو جی بی ایس) کے لاگت سے موثر اور موثر متبادل کے طور پر ابھری ہے۔ اگرچہ ڈبلیو جی بی ایس سنگل بیس ریزولوشن میں پورے جینوم کی جانچ کرکے جامع بصیرت فراہم کرتا ہے ، لیکن اس کی اعلی قیمت ایک محدود عنصر ہوسکتی ہے۔ آر آر بی ایس جینوم کے نمائندہ حصے کا انتخابی تجزیہ کرکے حکمت عملی کے ساتھ اس چیلنج کو کم کرتا ہے۔ یہ طریقہ کار ایم ایس پی آئی کلیویج کے ذریعہ سی پی جی جزیرے سے بھرپور علاقوں کی افزودگی پر انحصار کرتا ہے جس کے بعد 200-500/600 بی پی ایس کے ٹکڑوں کا سائز انتخاب ہوتا ہے۔ اس کے نتیجے میں ، صرف سی پی جی جزیروں کے قریب ہی خطے ترتیب دیئے جاتے ہیں ، جبکہ دور دراز سی پی جی جزیرے والے افراد کو تجزیہ سے خارج کردیا جاتا ہے۔ یہ عمل ، بیسلفائٹ تسلسل کے ساتھ مل کر ، ڈی این اے میتھیلیشن کی اعلی ریزولوشن کی کھوج کی اجازت دیتا ہے ، اور ترتیب نقطہ نظر ، PE150 ، خاص طور پر درمیانی کے بجائے داخلوں کے سروں پر مرکوز کرتا ہے ، جس سے میتھیلیشن پروفائلنگ کی کارکردگی میں اضافہ ہوتا ہے۔ آر آر بی ایس ایک انمول ٹول ہے جو لاگت سے موثر ڈی این اے میتھیلیشن ریسرچ کو قابل بناتا ہے اور ایپیجینیٹک میکانزم کے علم کو آگے بڑھاتا ہے۔
خدمت کی خصوصیات
refer ایک حوالہ جینوم کی ضرورت ہے۔
b لیمبڈا ڈی این اے بیسلفائٹ تبادلوں کی کارکردگی کی نگرانی کے لئے استعمال ہوتا ہے۔
● ایم ایس پی آئی ہاضمہ کی کارکردگی کی بھی نگرانی کی جاتی ہے۔
plant پودوں کے نمونوں کے لئے ڈبل انزائم عمل انہضام۔
ilu ایلومینا نوواسق پر ترتیب دینا۔
خدمت کے فوائد
●WGBS کا سرمایہ کاری مؤثر اور موثر متبادل: تجزیہ کو قابل بنانا کم قیمت پر اور کم نمونے کی ضروریات کے ساتھ کیا جائے۔
●مکمل پلیٹ فارم:نمونہ پروسیسنگ ، لائبریری کی تعمیر ، اور بائیو انفارمیٹکس تجزیہ کی ترتیب سے ایک اسٹاپ بہترین خدمت فراہم کریں۔
●وسیع مہارت: آر آر بی ایس کی ترتیب کے منصوبوں کے ساتھ مختلف پرجاتیوں میں کامیابی کے ساتھ مکمل کیا گیا ، بی ایم کیجن ایک دہائی کے تجربے ، ایک انتہائی ہنر مند تجزیہ ٹیم ، جامع مواد اور فروخت کے بعد کے بہترین معاونت لاتا ہے۔
خدمت کی وضاحتیں
| لائبریری | ترتیب کی حکمت عملی | تجویز کردہ ڈیٹا آؤٹ پٹ | کوالٹی کنٹرول |
| ایم ایس پی آئی ہضم اور بیسلفائٹ ٹریٹڈ لائبریری | ایلومینا PE150 | 8 جی بی | Q30 ≥ 85 ٪ بیسلفائٹ تبادلوں> 99 ٪ MSPI کاٹنے کی کارکردگی> 95 ٪ |
نمونہ کی ضروریات
| حراستی (NG/µL) | کل رقم (µg) |
| |
| جینومک ڈی این اے | ≥ 30 | ≥ 1 | محدود انحطاط یا آلودگی |
خدمت کے کام کا بہاؤ
نمونہ کی فراہمی
لائبریری کی تعمیر
ترتیب
ڈیٹا تجزیہ
فروخت کے بعد خدمات
مندرجہ ذیل تجزیہ پر مشتمل ہے:
● خام ترتیب کوالٹی کنٹرول ؛
reference جینوم کے حوالے سے نقشہ سازی ؛
5 5MC میتھلیٹیڈ اڈوں اور شکل کی شناخت کا پتہ لگانا ؛
met میتھیلیشن کی تقسیم اور نمونہ موازنہ کا تجزیہ ؛
deforty مختلف میتھلیٹڈ علاقوں (ڈی ایم آرز) کا تجزیہ ؛
D DMRs سے وابستہ جینوں کی فعال تشریح۔
کوالٹی کنٹرول: عمل انہضام کی کارکردگی (جینوم میپنگ میں)
کوالٹی کنٹرول: بیسلفائٹ تبادلوں (میتھیلیشن کی معلومات نکالنے میں)
میتھیلیشن کا نقشہ: 5MC میتھیلیشن جینوم وسیع تقسیم
نمونہ موازنہ: پرنسپل جزو تجزیہ
مختلف طور پر میتھلیٹیڈ ریجنز (ڈی ایم آر ایس) تجزیہ: ہیٹ میپ
اشاعتوں کے ایک مجموعہ مجموعہ کے ذریعہ BMKGene کی پوری جینوم بیسلفائٹ تسلسل خدمات کے ذریعہ سہولت فراہم کردہ تحقیقی پیشرفتوں کو دریافت کریں۔
لی ، زیڈ ایٹ ال۔ (2022) 'CRISPR ایکٹیویشن اور پیراکرین عوامل کے ذریعہ لیڈیگ نما خلیوں میں اعلی مخلصی کو دوبارہ پیش کرنا' ،pnas گٹھ جوڑ، 1 (4) doi: 10.1093/pnasnexus/pgac179۔
تیان ، H. ET رحمہ اللہ تعالی. (2023) 'چینی مونوزیگوٹک جڑواں بچوں میں جسمانی ساخت کا جینوم وسیع ڈی این اے میتھیلیشن تجزیہ' ،یورپی جرنل آف کلینیکل انویسٹی گیشن، 53 (11) ، صفحہ۔ E14055۔ doi: 10.1111/ECI.14055۔
وو ، Y. ET رحمہ اللہ تعالی. (2022) 'ڈی این اے میتھیلیشن اور کمر سے ہپ تناسب: چینی مونوزیگوٹک جڑواں بچوں میں ایپیگنوم وسیع ایسوسی ایشن کا مطالعہ' ،جرنل آف اینڈو کرینولوجیکل انویسٹی گیشن، 45 (12) ، پی پی 2365–2376۔ doi: 10.1007/S40618-022-01878-4۔
