Exclusive Agency for Korea

条形بینر-03

مصنوعات

  • جینوم وسیع ایسوسی ایشن تجزیہ

    جینوم وسیع ایسوسی ایشن تجزیہ

    جینوم وائیڈ ایسوسی ایشن اسٹڈیز (جی ڈبلیو اے ایس) کا مقصد مخصوص خصلتوں (فینوٹائپس) سے منسلک جینیاتی تغیرات (جینوٹائپس) کی شناخت کرنا ہے۔ افراد کی ایک بڑی تعداد میں پورے جینوم میں جینیاتی مارکروں کی چھان بین کرکے، GWAS آبادی کی سطح کے شماریاتی تجزیوں کے ذریعے جینی ٹائپ-فینوٹائپ ایسوسی ایشن کو ایکسٹراپلیٹ کرتا ہے۔ یہ طریقہ کار انسانی بیماریوں کی تحقیق اور جانوروں یا پودوں میں پیچیدہ خصلتوں سے متعلق فنکشنل جینز کی تلاش میں وسیع ایپلی کیشنز تلاش کرتا ہے۔

    BMKGENE میں، ہم بڑی آبادیوں پر GWAS کے انعقاد کے لیے دو راستے پیش کرتے ہیں: ہول-جینوم سیکوینسنگ (WGS) کو ملازمت دینا یا کم نمائندگی والے جینوم سیکوینسنگ کے طریقہ کار کا انتخاب، اندرون ملک تیار کردہ Specific-Locus Amplified Fragment (SLAF)۔ جب کہ WGS چھوٹے جینوم کے مطابق ہے، SLAF طویل جینوم کے ساتھ بڑی آبادی کا مطالعہ کرنے کے لیے ایک سرمایہ کاری مؤثر متبادل کے طور پر ابھرتا ہے، مؤثر طریقے سے ترتیب کے اخراجات کو کم کرتا ہے، جبکہ اعلی جینیاتی مارکر کی دریافت کی کارکردگی کی ضمانت دیتا ہے۔

  • سنگل نیوکلی آر این اے کی ترتیب

    سنگل نیوکلی آر این اے کی ترتیب

    سنگل سیل کیپچر اور اپنی مرضی کے مطابق لائبریری کی تعمیر کی تکنیکوں کی ترقی نے، اعلی تھرو پٹ ترتیب کے ساتھ، سیل کی سطح پر جین کے اظہار کے مطالعے میں انقلاب برپا کر دیا ہے۔ یہ پیش رفت پیچیدہ خلیات کی آبادی کے گہرے اور زیادہ جامع تجزیے کی اجازت دیتی ہے، تمام خلیات پر اوسطاً جین کے اظہار سے وابستہ حدود پر قابو پا کر اور ان آبادیوں کے اندر حقیقی نسبت کو محفوظ رکھتی ہے۔ اگرچہ سنگل سیل آر این اے سیکوینسنگ (scRNA-seq) کے ناقابل تردید فوائد ہیں، لیکن اسے بعض ٹشوز میں چیلنجز کا سامنا کرنا پڑتا ہے جہاں سنگل سیل معطلی کی تخلیق مشکل ثابت ہوتی ہے اور اس کے لیے تازہ نمونوں کی ضرورت ہوتی ہے۔ BMKGene میں، ہم جدید ترین 10X جینومکس کرومیم ٹیکنالوجی کا استعمال کرتے ہوئے سنگل نیوکلئس RNA سیکوینسنگ (snRNA-seq) کی پیشکش کر کے اس رکاوٹ کو دور کرتے ہیں۔ یہ نقطہ نظر سنگل سیل کی سطح پر ٹرانسکرپٹوم تجزیہ کے قابل نمونوں کے سپیکٹرم کو وسیع کرتا ہے۔

    نیوکلی کی الگ تھلگ اختراعی 10X جینومکس کرومیم چپ کے ذریعے مکمل کی جاتی ہے، جس میں ڈبل کراسنگ کے ساتھ آٹھ چینلز کا مائیکرو فلائیڈکس سسٹم موجود ہے۔ اس نظام کے اندر، بارکوڈز، پرائمر، انزائمز، اور ایک واحد مرکزے کو شامل کرنے والے جیل موتیوں کو نانولیٹر سائز کے تیل کے قطروں میں سمیٹ کر جیل بیڈ-اِن-ایملشن (جی ای ایم) تشکیل دیا جاتا ہے۔ GEM کی تشکیل کے بعد، سیل لیسز اور بارکوڈ کی رہائی ہر GEM کے اندر ہوتی ہے۔ اس کے بعد، mRNA مالیکیولز 10X بارکوڈز اور منفرد مالیکیولر آئیڈینٹیفائرز (UMIs) کو شامل کرتے ہوئے، cDNAs میں ریورس ٹرانسکرپشن سے گزرتے ہیں۔ اس کے بعد یہ cDNAs کو معیاری ترتیب دینے والی لائبریری کی تعمیر کا نشانہ بنایا جاتا ہے، جس سے سنگل سیل کی سطح پر جین ایکسپریشن پروفائلز کی مضبوط اور جامع تلاش کی سہولت فراہم کی جاتی ہے۔

    پلیٹ فارم: 10× جینومکس کرومیم اور ایلومینا نووا سیق پلیٹ فارم

  • پلانٹ/جانوروں کے مکمل جینوم کی ترتیب

    پلانٹ/جانوروں کے مکمل جینوم کی ترتیب

    ہول جینوم سیکوینسنگ (WGS)، جسے ریسکوینسنگ بھی کہا جاتا ہے، اس سے مراد حوالہ جینوم کے ساتھ پرجاتیوں کے مختلف افراد کی پوری جینوم کی ترتیب ہے۔ اس بنیاد پر افراد یا آبادی کے جینومک فرق کی مزید نشاندہی کی جا سکتی ہے۔ WGS سنگل نیوکلیوٹائڈ پولیمورفزم (SNP)، انسرشن ڈیلیٹیشن (InDel)، ساخت میں تغیر (SV)، اور کاپی نمبر ویری ایشن (CNV) کی شناخت کو قابل بناتا ہے۔ SVs SNPs کے مقابلے میں تغیر کی بنیاد کا ایک بڑا حصہ پر مشتمل ہے اور اس کا جینوم پر زیادہ اثر پڑتا ہے، جو جانداروں کو کافی حد تک متاثر کرتا ہے۔ اگرچہ شارٹ ریڈ ریسکوینسنگ SNPs اور InDels کی شناخت میں کارگر ہے، طویل پڑھی جانے والی ریسکوینسنگ بڑے ٹکڑوں اور پیچیدہ تغیرات کی زیادہ درست شناخت کی اجازت دیتی ہے۔

  • 10x جینومکس ویزیم اسپیشل ٹرانسکرپٹوم

    10x جینومکس ویزیم اسپیشل ٹرانسکرپٹوم

    مقامی ٹرانسکرپٹومکس ایک جدید ٹیکنالوجی ہے جو محققین کو اپنے مقامی سیاق و سباق کو محفوظ رکھتے ہوئے ٹشوز کے اندر جین کے اظہار کے نمونوں کی چھان بین کرنے کی اجازت دیتی ہے۔ اس ڈومین میں ایک طاقتور پلیٹ فارم 10x جینومکس ویزیم ہے جس کے ساتھ ایلومینا سیکوینسنگ ہے۔ 10X Visium کا اصول ایک مخصوص چپ پر ہے جس میں ایک مخصوص کیپچر ایریا ہے جہاں ٹشو سیکشن رکھے گئے ہیں۔ اس کیپچر ایریا میں بار کوڈ والے دھبے ہوتے ہیں، ہر ایک ٹشو کے اندر ایک منفرد مقامی مقام کے مطابق ہوتا ہے۔ ٹشو سے پکڑے گئے RNA مالیکیولز کو پھر ریورس ٹرانسکرپشن کے عمل کے دوران منفرد مالیکیولر آئیڈینٹیفائر (UMIs) کے ساتھ لیبل لگایا جاتا ہے۔ یہ بارکوڈڈ اسپاٹس اور UMIs ایک خلیے کے ریزولوشن میں جین کے اظہار کی درست مقامی نقشہ سازی اور مقدار درست کرنے کے قابل بناتے ہیں۔ مقامی طور پر بارکوڈ شدہ نمونوں اور UMIs کا مجموعہ تیار کردہ ڈیٹا کی درستگی اور خصوصیت کو یقینی بناتا ہے۔ اس اسپیشل ٹرانسکرپٹومکس ٹیکنالوجی کا استعمال کرکے، محققین خلیات کی مقامی تنظیم اور ٹشوز کے اندر پائے جانے والے پیچیدہ مالیکیولر تعاملات کے بارے میں گہری سمجھ حاصل کر سکتے ہیں، جس میں متعدد شعبوں میں حیاتیاتی عمل کے بنیادی میکانزم کے بارے میں انمول بصیرت پیش کی جا سکتی ہے، بشمول آنکولوجی، نیورو سائنس، ترقیاتی حیاتیات، امیونولوجی۔ ، اور نباتاتی مطالعہ۔

    پلیٹ فارم: 10X جینومکس ویزیم اور ایلومینا نووا سیق

  • مکمل لمبائی ایم آر این اے سیکوینسنگ-نانوپور

    مکمل لمبائی ایم آر این اے سیکوینسنگ-نانوپور

    جب کہ NGS پر مبنی mRNA ترتیب جین کے اظہار کی مقدار کو درست کرنے کے لیے ایک ورسٹائل ٹول ہے، لیکن مختصر پڑھنے پر اس کا انحصار پیچیدہ ٹرانسکرپٹومک تجزیوں میں اس کی افادیت کو محدود کرتا ہے۔ دوسری طرف، نینو پور کی ترتیب طویل پڑھی جانے والی ٹکنالوجی کو استعمال کرتی ہے، جس سے پوری لمبائی کے mRNA ٹرانسکرپٹس کی ترتیب کو قابل بنایا جاتا ہے۔ یہ نقطہ نظر متبادل سپلائینگ، جین فیوژن، پولی ایڈنیلیشن، اور mRNA isoforms کی مقدار کو درست کرنے کی ایک جامع تلاش کی سہولت فراہم کرتا ہے۔

    نینو پور کی ترتیب، ایک ایسا طریقہ جو نینو پور سنگل مالیکیول ریئل ٹائم برقی سگنلز پر انحصار کرتا ہے، حقیقی وقت میں نتائج فراہم کرتا ہے۔ موٹر پروٹین کی رہنمائی میں، دوہرے پھنسے ہوئے ڈی این اے بائیو فلم میں سرایت شدہ نینو پور پروٹینز سے منسلک ہوتے ہیں، جب یہ وولٹیج کے فرق کے تحت نینو پور چینل سے گزرتا ہے تو کھل جاتا ہے۔ ڈی این اے اسٹرینڈ پر مختلف اڈوں سے پیدا ہونے والے مخصوص برقی سگنلز کو حقیقی وقت میں تلاش کیا جاتا ہے اور ان کی درجہ بندی کی جاتی ہے، جو درست اور مسلسل نیوکلیوٹائڈ کی ترتیب کی سہولت فراہم کرتے ہیں۔ یہ اختراعی نقطہ نظر مختصر پڑھنے کی حدود پر قابو پاتا ہے اور پیچیدہ جینومک تجزیہ کے لیے ایک متحرک پلیٹ فارم مہیا کرتا ہے، بشمول پیچیدہ ٹرانسکرپٹومک اسٹڈیز، فوری نتائج کے ساتھ۔

    پلیٹ فارم: Nanopore PromethION 48

  • مکمل لمبائی mRNA کی ترتیب -PacBio

    مکمل لمبائی mRNA کی ترتیب -PacBio

    جب کہ NGS پر مبنی mRNA کی ترتیب جین کے اظہار کی مقدار درست کرنے کے لیے ایک ورسٹائل ٹول ہے، لیکن مختصر پڑھنے پر اس کا انحصار پیچیدہ ٹرانسکرومیٹک تجزیوں میں اس کے استعمال کو محدود کرتا ہے۔ دوسری طرف، PacBio سیکوینسنگ (Iso-Seq) طویل پڑھی جانے والی ٹکنالوجی کو استعمال کرتی ہے، جس سے پوری لمبائی کے mRNA ٹرانسکرپٹس کی ترتیب کو قابل بنایا جاتا ہے۔ یہ نقطہ نظر متبادل چھڑکنے، جین فیوژن، اور پولی ایڈنیلیشن کی ایک جامع تلاش کی سہولت فراہم کرتا ہے۔ تاہم، مطلوبہ اعداد و شمار کی زیادہ مقدار کی وجہ سے جین کے اظہار کی مقدار درست کرنے کے لیے اور بھی انتخاب موجود ہیں۔ PacBio سیکوینسنگ ٹیکنالوجی سنگل مالیکیول، ریئل ٹائم (SMRT) سیکوینسنگ پر انحصار کرتی ہے، جو پوری لمبائی کے mRNA ٹرانسکرپٹس کو حاصل کرنے میں ایک الگ فائدہ فراہم کرتی ہے۔ اس اختراعی انداز میں زیرو موڈ ویو گائیڈز (ZMWs) اور مائیکرو فیبریکیٹڈ کنویں کا استعمال شامل ہے جو ترتیب کے دوران DNA پولیمریز کی سرگرمی کے حقیقی وقت کے مشاہدے کو قابل بناتے ہیں۔ ان ZMWs کے اندر، PacBio کا DNA پولیمریز DNA کے ایک تکمیلی اسٹرینڈ کی ترکیب کرتا ہے، جس سے لمبی ریڈز تیار ہوتی ہیں جو mRNA ٹرانسکرپٹس پر محیط ہوتی ہیں۔ سرکلر کنسنسس سیکوینسنگ (CCS) موڈ میں PacBio آپریشن ایک ہی مالیکیول کو بار بار ترتیب دے کر درستگی کو بڑھاتا ہے۔ تیار کردہ HiFi ریڈز میں NGS کے مقابلے کی درستگی ہے، جو پیچیدہ ٹرانسکرپٹومک خصوصیات کے جامع اور قابل اعتماد تجزیہ میں مزید تعاون کرتی ہے۔

    پلیٹ فارم: PacBio سیکوئل II؛ PacBio Revio

  • یوکریاٹک ایم آر این اے سیکوینسنگ-این جی ایس

    یوکریاٹک ایم آر این اے سیکوینسنگ-این جی ایس

    mRNA کی ترتیب، ایک ورسٹائل ٹیکنالوجی، مخصوص حالات کے تحت خلیوں کے اندر تمام mRNA ٹرانسکرپٹس کی جامع پروفائلنگ کو تقویت دیتی ہے۔ اپنے وسیع پیمانے پر ایپلی کیشنز کے ساتھ، یہ جدید ٹول پیچیدہ جین ایکسپریشن پروفائلز، جین کے ڈھانچے، اور مختلف حیاتیاتی عمل سے وابستہ مالیکیولر میکانزم کی نقاب کشائی کرتا ہے۔ بنیادی تحقیق، طبی تشخیص، اور منشیات کی نشوونما میں وسیع پیمانے پر اپنایا گیا، mRNA کی ترتیب سیلولر ڈائنامکس اور جینیاتی ضابطے کی پیچیدگیوں کے بارے میں بصیرت پیش کرتی ہے، جس سے مختلف شعبوں میں اس کی صلاحیت کے بارے میں تجسس پیدا ہوتا ہے۔

    پلیٹ فارم: Illumina NovaSeq X؛ DNBSEQ-T7

  • غیر حوالہ پر مبنی mRNA تسلسل-NGS

    غیر حوالہ پر مبنی mRNA تسلسل-NGS

    mRNA کی ترتیب مخصوص حالات کے تحت خلیوں کے اندر تمام mRNA ٹرانسکرپٹس کی جامع پروفائلنگ کو تقویت دیتی ہے۔ یہ جدید ٹیکنالوجی ایک طاقتور ٹول کے طور پر کام کرتی ہے، پیچیدہ جین ایکسپریشن پروفائلز، جین ڈھانچے، اور متنوع حیاتیاتی عمل سے وابستہ مالیکیولر میکانزم کی نقاب کشائی کرتی ہے۔ بنیادی تحقیق، طبی تشخیص، اور منشیات کی نشوونما میں وسیع پیمانے پر اپنایا گیا، mRNA کی ترتیب سیلولر ڈائنامکس اور جینیاتی ضابطے کی پیچیدگیوں کے بارے میں بصیرت پیش کرتی ہے۔

    پلیٹ فارم: Illumina NovaSeq X؛ DNBSEQ-T7

  • لانگ نان کوڈنگ سیکوینسنگ-ایلومینا۔

    لانگ نان کوڈنگ سیکوینسنگ-ایلومینا۔

    لمبے نان کوڈنگ RNAs (lncRNAs) 200 نیوکلیوٹائڈز سے زیادہ لمبے ہوتے ہیں جو کم سے کم کوڈنگ کی صلاحیت رکھتے ہیں اور نان کوڈنگ RNA کے اندر اہم عناصر ہیں۔ نیوکلئس اور سائٹوپلازم میں پائے جانے والے، یہ آر این اے ایپی جینیٹک، ٹرانسکرپشن اور پوسٹ ٹرانسکرپشن ریگولیشن میں اہم کردار ادا کرتے ہیں، جو سیلولر اور سالماتی عمل کی تشکیل میں ان کی اہمیت کو واضح کرتے ہیں۔ LncRNA کی ترتیب سیل کی تفریق، Ontogenesis، اور انسانی بیماریوں میں ایک طاقتور ٹول ہے۔

    پلیٹ فارم: Illumina NovaSeq

  • چھوٹی آر این اے سیکوینسنگ-ایلومینا۔

    چھوٹی آر این اے سیکوینسنگ-ایلومینا۔

    چھوٹے RNA (sRNA) مالیکیولز میں microRNAs (miRNAs)، چھوٹے مداخلت کرنے والے RNAs (siRNAs)، اور piwi-interacting RNAs (piRNAs) شامل ہیں۔ ان میں سے، miRNAs، تقریباً 18-25 نیوکلیوٹائڈز لمبے، خاص طور پر مختلف سیلولر عمل میں ان کے اہم ریگولیٹری کرداروں کے لیے قابل ذکر ہیں۔ ٹشو سے متعلق مخصوص اور اسٹیج سے متعلق اظہار کے نمونوں کے ساتھ، miRNAs مختلف پرجاتیوں میں اعلی تحفظ کی نمائش کرتے ہیں۔

    پلیٹ فارم: Illumina NovaSeq

  • سرک آر این اے سیکوینسنگ-ایلومینا۔

    سرک آر این اے سیکوینسنگ-ایلومینا۔

    سرکلر آر این اے سیکوینسنگ (سرکلر آر این اے سیک) سرکلر آر این اے کی پروفائل اور تجزیہ کرنا ہے، آر این اے مالیکیولز کی ایک کلاس جو غیر کینونیکل سپلائینگ واقعات کی وجہ سے بند لوپ بناتی ہے، اس آر این اے کو بڑھتی ہوئی استحکام فراہم کرتی ہے۔ جب کہ کچھ سرک آر این اے کو مائیکرو آر این اے سپنج کے طور پر کام کرتے ہوئے دکھایا گیا ہے، مائیکرو آر این اے کو الگ کرتے ہیں اور انہیں اپنے ہدف کے ایم آر این اے کو منظم کرنے سے روکتے ہیں، دوسرے سرک این اے پروٹین کے ساتھ تعامل کرسکتے ہیں، جین کے اظہار کو ماڈیول کرسکتے ہیں، یا سیلولر عمل میں کردار ادا کرسکتے ہیں۔ سرک آر این اے ایکسپریشن تجزیہ ان مالیکیولز کے ریگولیٹری کرداروں اور مختلف سیلولر پروسیسز، نشوونما کے مراحل، اور بیماری کے حالات میں ان کی اہمیت کے بارے میں بصیرت فراہم کرتا ہے، جو جین کے اظہار کے تناظر میں آر این اے ریگولیشن کی پیچیدگی کی گہرائی سے سمجھنے میں معاون ہے۔

  • مکمل ٹرانسکرپٹوم کی ترتیب - ایلومینا۔

    مکمل ٹرانسکرپٹوم کی ترتیب - ایلومینا۔

    مکمل ٹرانسکرپٹوم سیکوینسنگ متنوع آر این اے مالیکیولز، کوڈنگ (mRNA) اور نان کوڈنگ RNAs (lncRNA، circRNA، اور miRNA) کو شامل کرنے کے لیے ایک جامع نقطہ نظر پیش کرتی ہے۔ یہ تکنیک ایک مخصوص لمحے میں مخصوص خلیوں کے پورے ٹرانسکرپٹ کو پکڑتی ہے، جس سے سیلولر عمل کی مکمل تفہیم ہوتی ہے۔ اسے "ٹوٹل آر این اے سیکوینسنگ" کے نام سے بھی جانا جاتا ہے، اس کا مقصد ٹرانسکرپٹوم کی سطح پر پیچیدہ ریگولیٹری نیٹ ورکس کی نقاب کشائی کرنا ہے، جس سے گہرائی سے تجزیہ جیسے مسابقتی اینڈوجینس آر این اے (سی آر این اے) اور مشترکہ آر این اے تجزیہ کو قابل بنایا جائے۔ یہ فنکشنل خصوصیت کی طرف ابتدائی قدم کی نشاندہی کرتا ہے، خاص طور پر circRNA-miRNA-mRNA پر مبنی ceRNA تعاملات پر مشتمل ریگولیٹری نیٹ ورکس کو کھولنے میں۔

  • Chromatin Immunoprecipitation Sequencing (ChIP-seq)

    Chromatin Immunoprecipitation Sequencing (ChIP-seq)

    Chromatin Immunoprecipitation (CHIP) ایک ایسی تکنیک ہے جو ڈی این اے بائنڈنگ پروٹینز اور ان کے متعلقہ جینومکس اہداف کو منتخب طور پر افزودہ کرنے کے لیے اینٹی باڈیز کا فائدہ اٹھاتی ہے۔ این جی ایس کے ساتھ اس کا انضمام ہسٹون ترمیم، ٹرانسکرپشن عوامل، اور دیگر ڈی این اے بائنڈنگ پروٹین سے وابستہ ڈی این اے اہداف کی جینوم وسیع پروفائلنگ کو قابل بناتا ہے۔ یہ متحرک نقطہ نظر متنوع سیل اقسام، ٹشوز، یا حالات میں بائنڈنگ سائٹس کے موازنہ کو قابل بناتا ہے۔ ChIP-Seq کی ایپلی کیشنز ٹرانسکرپشن ریگولیشن اور ترقی کے راستوں کا مطالعہ کرنے سے لے کر بیماریوں کے طریقہ کار کو واضح کرنے تک پھیلی ہوئی ہیں، جو اسے جینومک ریگولیشن کے مناظر کو سمجھنے اور علاج کی بصیرت کو آگے بڑھانے کے لیے ایک ناگزیر ذریعہ بناتی ہیں۔

    پلیٹ فارم: Illumina NovaSeq

اپنا پیغام ہمیں بھیجیں: