-
میٹاجینومک سیکوینسنگ - این جی ایس
میٹاجینوم حیاتیات کی مخلوط برادری کے کل جینیاتی مواد کا مجموعہ ہے، جیسے ماحولیاتی اور انسانی میٹاجینوم۔ اس میں قابل کاشت اور ناقابل کاشت دونوں مائکروجنزموں کے جینوم ہوتے ہیں۔ NGS کے ساتھ شاٹگن میٹاجینومک ترتیب ٹیکونومک پروفائلنگ سے زیادہ فراہم کرکے ماحولیاتی نمونوں میں شامل ان پیچیدہ جینومک مناظر کے مطالعہ کو قابل بناتی ہے، جس سے انواع کے تنوع، کثرت کی حرکیات، اور آبادی کے پیچیدہ ڈھانچے کے بارے میں دانے دار بصیرت بھی ملتی ہے۔ ٹیکونومک اسٹڈیز سے ہٹ کر، شاٹگن میٹاجینومکس ایک فنکشنل جینومکس کا نقطہ نظر بھی پیش کرتا ہے، جو انکوڈ شدہ جینز کی تلاش اور ماحولیاتی عمل میں ان کے اہم کردار کو قابل بناتا ہے۔ آخر میں، جینیاتی عناصر اور ماحولیاتی عوامل کے درمیان ارتباط کے نیٹ ورکس کا قیام مائکروبیل کمیونٹیز اور ان کے ماحولیاتی پس منظر کے درمیان پیچیدہ تعامل کی مکمل تفہیم میں معاون ہے۔ آخر میں، metagenomic تسلسل متنوع مائکروبیل کمیونٹیز کی جینومک پیچیدگیوں کو کھولنے کے لیے ایک اہم آلہ کے طور پر کھڑا ہے، ان پیچیدہ ماحولیاتی نظاموں کے اندر جینیات اور ماحولیات کے درمیان کثیر جہتی تعلقات کو روشن کرتا ہے۔
پلیٹ فارمز: Illumina NovaSeq اور DNBSEQ-T7
-
میٹجینومک سیکوینسنگ-TGS
میٹاجینوم حیاتیات کی مخلوط برادری کے جینیاتی مواد کا مجموعہ ہے، جیسے ماحولیاتی اور انسانی میٹاجینوم۔ اس میں قابل کاشت اور ناقابل کاشت دونوں مائکروجنزموں کے جینوم ہوتے ہیں۔ میٹجینومک سیکوینسنگ ٹیکسونومک پروفائلنگ سے زیادہ فراہم کرکے ماحولیاتی نمونوں میں سرایت شدہ ان پیچیدہ جینومک مناظر کے مطالعہ کو قابل بناتی ہے۔ یہ انکوڈ شدہ جینوں اور ماحولیاتی عمل میں ان کے اہم کرداروں کو تلاش کرکے ایک فعال جینومکس نقطہ نظر بھی پیش کرتا ہے۔ اگرچہ Illumina کی ترتیب کے ساتھ روایتی شاٹگن کے نقطہ نظر کو میٹاجینومک مطالعات میں بڑے پیمانے پر استعمال کیا گیا ہے، نانوپور اور PacBio کی طویل پڑھنے والی ترتیب کی آمد نے میدان کو تبدیل کر دیا ہے۔ Nanopore اور PacBio ٹیکنالوجی ڈاون اسٹریم بائیو انفارمیٹک تجزیوں کو بڑھاتی ہے، خاص طور پر میٹاجینوم اسمبلی، مزید مسلسل اسمبلیوں کو یقینی بناتی ہے۔ رپورٹس بتاتی ہیں کہ نانوپور پر مبنی اور PacBio پر مبنی میٹاجینومکس نے پیچیدہ مائکرو بایوم (Moss, EL, et al., Nature Biotech, 2020) سے کامیابی کے ساتھ مکمل اور بند بیکٹیریل جینوم تیار کیے ہیں۔ نانوپور ریڈز کو ایلومینا ریڈز کے ساتھ ضم کرنا نینو پور کی موروثی کم درستگی کو کم کرتے ہوئے، غلطی کی اصلاح کے لیے ایک اسٹریٹجک نقطہ نظر فراہم کرتا ہے۔ یہ ہم آہنگی کا امتزاج ہر ترتیب سازی کے پلیٹ فارم کی طاقتوں کا فائدہ اٹھاتا ہے، ممکنہ حدوں پر قابو پانے اور میٹجینومک تجزیوں کی درستگی اور وشوسنییتا کو آگے بڑھانے کے لیے ایک مضبوط حل پیش کرتا ہے۔
پلیٹ فارم: Nanopore PromethION 48، Illumia اور PacBio Revio
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
16S اور 18S rRNA جینز، انٹرنل ٹرانسکرائبڈ اسپیسر (ITS) ریجن کے ساتھ، انتہائی محفوظ اور ہائپر متغیر خطوں کے امتزاج کی وجہ سے اہم مالیکیولر فنگر پرنٹنگ مارکر کے طور پر کام کرتے ہیں، جو انہیں پراکاریوٹک اور یوکرائیوٹک جانداروں کی خصوصیت کے لیے انمول ٹولز بناتے ہیں۔ ان خطوں کی وسعت اور ترتیب مختلف ماحولیاتی نظاموں میں مائکروبیل مرکب اور تنوع کی تحقیقات کے لیے تنہائی سے پاک نقطہ نظر پیش کرتی ہے۔ جبکہ Illumina کی ترتیب عام طور پر 16S اور ITS1 کے V3-V4 جیسے مختصر ہائپر ویری ایبل خطوں کو نشانہ بناتی ہے، یہ ظاہر کیا گیا ہے کہ 16S، 18S، اور ITS کی پوری لمبائی کو ترتیب دے کر اعلیٰ درجہ بندی کی تشریح حاصل کی جا سکتی ہے۔ اس جامع نقطہ نظر کے نتیجے میں درست درجہ بندی کی ترتیب کی اعلی فیصد ہوتی ہے، جس سے ریزولوشن کی سطح حاصل ہوتی ہے جو کہ پرجاتیوں کی شناخت تک پھیلی ہوئی ہے۔ PacBio کا سنگل مالیکیول ریئل ٹائم (SMRT) سیکوینسنگ پلیٹ فارم انتہائی درست لانگ ریڈز (HiFi) فراہم کر کے نمایاں ہے جو Illumina سیکوینسنگ کی درستگی کا مقابلہ کرتے ہوئے مکمل طوالت کے ایمپلی کنز کا احاطہ کرتا ہے۔ یہ صلاحیت محققین کو ایک بے مثال فائدہ حاصل کرنے کی اجازت دیتی ہے - جینیاتی زمین کی تزئین کا ایک خوبصورت منظر۔ توسیع شدہ کوریج پرجاتیوں کی تشریح میں ریزولیوشن کو نمایاں طور پر بلند کرتی ہے، خاص طور پر بیکٹیریل یا فنگل کمیونٹیز میں، مائکروبیل آبادی کی پیچیدگیوں کی گہرائی سے سمجھنے کے قابل بناتی ہے۔
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
ایلومینا ٹکنالوجی کے ساتھ ایمپلیکون کی ترتیب، خاص طور پر 16S، 18S، اور اس کے جینیاتی مارکروں کو نشانہ بنانا، مائکروبیل کمیونٹیز کے اندر فائیلوجنی، درجہ بندی، اور پرجاتیوں کی کثرت کو کھولنے کا ایک طاقتور طریقہ ہے۔ اس نقطہ نظر میں ہاؤس کیپنگ جینیاتی مارکر کے ہائپر ویری ایبل علاقوں کو ترتیب دینا شامل ہے۔ اصل میں کی طرف سے ایک سالماتی فنگر پرنٹ کے طور پر متعارف کرایاپریشانیاں وغیرہ1977 میں، اس تکنیک نے تنہائی سے پاک تجزیوں کو قابل بنا کر مائکرو بایوم پروفائلنگ میں انقلاب برپا کر دیا ہے۔ 16S (بیکٹیریا)، 18S (فنگس) اور انٹرنل ٹرانسکرائبڈ اسپیسر (آئی ٹی ایس، فنگس) کی ترتیب کے ذریعے، محققین نہ صرف پرچر پرجاتیوں بلکہ نایاب اور نامعلوم افراد کی بھی شناخت کر سکتے ہیں۔ ایک اہم آلے کے طور پر وسیع پیمانے پر اپنایا گیا، ایمپلی کون سیکوینسنگ متنوع ماحول، بشمول انسانی منہ، آنتیں، پاخانہ اور اس سے آگے کے مختلف ماحولوں میں تفریق مائکروبیل مرکبات کو سمجھنے میں اہم کردار ادا کر رہی ہے۔
-
بیکٹیریل اور فنگل مکمل جینوم کی دوبارہ ترتیب
بیکٹیریل اور فنگل مکمل جینوم کی دوبارہ ترتیب کے منصوبے مائکروبیل جینومس کی تکمیل اور موازنہ کو قابل بنا کر مائکروبیل جینومکس کو آگے بڑھانے کے لیے اہم ہیں۔ یہ ابال کی انجینئرنگ، صنعتی عمل کی اصلاح، اور ثانوی میٹابولزم کے راستوں کی تلاش میں سہولت فراہم کرتا ہے۔ مزید برآں، طبی، زراعت اور ماحولیاتی سائنس میں وسیع مضمرات کے ساتھ، ماحولیاتی موافقت کو سمجھنے، تناؤ کو بہتر بنانے، اور جینیاتی ارتقا کی حرکیات کو ظاہر کرنے کے لیے فنگل اور بیکٹیریا کی دوبارہ ترتیب بہت ضروری ہے۔
-
پروکیریٹک آر این اے کی ترتیب
RNA کی ترتیب مخصوص حالات کے تحت خلیوں کے اندر تمام RNA ٹرانسکرپٹس کی جامع پروفائلنگ کو بااختیار بناتی ہے۔ یہ جدید ٹیکنالوجی ایک طاقتور ٹول کے طور پر کام کرتی ہے، پیچیدہ جین ایکسپریشن پروفائلز، جین ڈھانچے، اور متنوع حیاتیاتی عمل سے وابستہ مالیکیولر میکانزم کی نقاب کشائی کرتی ہے۔ بنیادی تحقیق، طبی تشخیص، اور منشیات کی نشوونما میں وسیع پیمانے پر اپنایا گیا، آر این اے کی ترتیب سیلولر ڈائنامکس اور جینیاتی ضابطے کی پیچیدگیوں کے بارے میں بصیرت پیش کرتی ہے۔ ہماری پروکاریوٹک آر این اے نمونہ پروسیسنگ پروکیریٹک ٹرانسکرپٹوم کے لیے تیار کی گئی ہے، جس میں آر آر این اے کی کمی اور دشاتمک لائبریری کی تیاری شامل ہے۔
پلیٹ فارم: Illumina NovaSeq
-
میٹا ٹرانسکرپٹوم کی ترتیب
ایلومینا سیکوینسنگ ٹکنالوجی کا فائدہ اٹھاتے ہوئے، BMKGENE کی میٹا ٹرانسکرپٹوم سیکوینسنگ سروس مختلف قسم کے جرثوموں کے متحرک جین اظہار کی نقاب کشائی کرتی ہے، جو قدرتی ماحول جیسے مٹی، پانی، سمندر، پاخانہ اور آنت کے اندر یوکرائیوٹس سے لے کر پروکیریٹس اور وائرس تک پھیلی ہوئی ہے۔ ہماری جامع سروس محققین کو پیچیدہ مائکروبیل کمیونٹیز کے مکمل جین ایکسپریشن پروفائلز کا مطالعہ کرنے کی طاقت دیتی ہے۔ ٹیکونومک تجزیہ کے علاوہ، ہماری میٹا ٹرانسکرپٹوم سیکوینسنگ سروس فنکشنل افزودگی کی تلاش میں سہولت فراہم کرتی ہے، جس سے مختلف جینز اور ان کے کرداروں پر روشنی ڈالی جاتی ہے۔ جب آپ ان متنوع ماحولیاتی طاقوں کے اندر جین کے اظہار، درجہ بندی کے تنوع، اور فعال حرکیات کے پیچیدہ مناظر کو نیویگیٹ کرتے ہیں تو حیاتیاتی بصیرت کا خزانہ دریافت کریں۔
-
ڈی نوو فنگل جینوم اسمبلی
BMKGENE فنگل جینوم کے لیے ورسٹائل حل پیش کرتا ہے، متنوع تحقیقی ضروریات اور مطلوبہ جینوم کی تکمیل کو پورا کرتا ہے۔ اکیلے مختصر پڑھنے والے Illumina کی ترتیب کو استعمال کرنے سے ڈرافٹ جینوم کی تخلیق کی اجازت ملتی ہے۔ نانوپور یا پیکبیو کا استعمال کرتے ہوئے شارٹ ریڈز اور لمبی پڑھی جانے والی ترتیب کو لمبے کنٹیگز کے ساتھ زیادہ بہتر فنگل جینوم کے لیے ملایا جاتا ہے۔ مزید برآں، Hi-C کی ترتیب کو مربوط کرنے سے صلاحیتوں میں مزید اضافہ ہوتا ہے، جس سے کروموسوم لیول کے مکمل جینوم کا حصول ممکن ہوتا ہے۔
-
ڈی نوو بیکٹیریل جینوم اسمبلی
ہم ایک مکمل بیکٹیریل جینوم اسمبلی سروس فراہم کرتے ہیں، 0 فرق کی ضمانت دیتے ہیں۔ یہ طویل پڑھی جانے والی ترتیب سازی کی ٹیکنالوجیز، جیسے نانوپور اور PacBio کو اسمبلی کے لیے اور مختصر پڑھنے کی ترتیب کو Illumina کے ساتھ اسمبلی کی توثیق اور ONT ریڈز کی غلطی کی اصلاح کے لیے مربوط کرنے سے ممکن ہے۔ ہماری سروس مخصوص تحقیقی اہداف کو پورا کرتے ہوئے اسمبلی، فنکشنل تشریح، اور جدید بائیو انفارمیٹک تجزیہ سے مکمل بایو انفارمیٹک ورک فلو فراہم کرتی ہے۔ یہ سروس مختلف جینیاتی اور جینومک اسٹڈیز کے لیے عین حوالہ جینوم کی ترقی کے قابل بناتی ہے۔ مزید برآں، یہ سٹرین آپٹیمائزیشن، جینیاتی انجینئرنگ، اور مائکروبیل ٹکنالوجی کی ترقی جیسی ایپلی کیشنز کی بنیاد بناتا ہے، جس سے قابل اعتماد اور خلا سے پاک جینومک ڈیٹا کو یقینی بنایا جاتا ہے جو سائنسی بصیرت اور بائیوٹیکنالوجیکل اختراعات کو آگے بڑھانے کے لیے اہم ہے۔
