ہیٹ میپ
ہیٹ میپ ٹول میٹرکس ڈیٹا فائل کو ان پٹ کے طور پر قبول کرتا ہے اور صارفین کو فلٹر ، معمول پر اور کلسٹر ڈیٹا کی اجازت دیتا ہے۔ ہیٹ میپ کے لئے بنیادی استعمال کا معاملہ مختلف نمونوں کے مابین جین کے اظہار کی سطح کا کلسٹر تجزیہ ہے۔
جین تشریح
جین تشریح کا آلہ مختلف ڈیٹا بیس کے خلاف ان پٹ فاسٹا فائلوں کی ترتیب سیدھ پر مبنی جین تشریح کرتا ہے۔
بنیادی لوکل سیدھ سرچ ٹول (دھماکے)
بلاسٹ ٹول این سی بی آئی بلاسٹ کا بی ایم کے کلاؤڈ انٹیگریٹڈ ورژن ہے اور بی ایم کے کلاؤڈ اکاؤنٹ میں اپ لوڈ کردہ ڈیٹا کا استعمال کرتے ہوئے وہی افعال انجام دینے کے لئے استعمال کیا جاسکتا ہے۔
CDS_UTR کی پیشن گوئی
CDS_UTR کی پیشن گوئی کا آلہ کوڈنگ ریجنز (سی ڈی ایس) اور نان کوڈنگ ریجنز (یو ٹی آر) کی پیش گوئی کرنے کے لئے ڈیزائن کیا گیا ہے جو معلوم شدہ پروٹین ڈیٹا بیس اور او آر ایف کی پیشن گوئی کے نتائج کے خلاف دھماکے کے نتائج پر مبنی ٹرانسکرپٹ تسلسل میں دیئے گئے ہیں۔
مینہٹن پلاٹ
مینہٹن پلاٹ ٹول اعلی نمونے کے تجربات کی نمائش کے قابل بناتا ہے اور عام طور پر جینوم وسیع ایسوسی ایشن اسٹڈیز (جی ڈبلیو اے ایس) میں استعمال ہوتا ہے۔
سرکوس ڈایاگرام
سرکوس ڈایاگرام ٹول موثر تصور فراہم کرتا ہے کہ جینومک کی خصوصیت جینوم میں کس طرح تقسیم کی جاتی ہے۔ عام خصوصیات میں مقداری لوکی ، ایس این پیز ، انڈیلز ، ساختی اور کاپی نمبر کی مختلف حالتیں شامل ہیں۔
جین اونٹولوجی (جی او) افزودگی
جی او افزودگی کا آلہ فعال افزودگی تجزیہ فراہم کرتا ہے۔ اس ٹول میں بنیادی سافٹ ویئر ٹاپگو-بائیوکنڈکٹر پیکیج ہے ، جس میں امتیازی اظہار تجزیہ ، GO افزودگی تجزیہ اور نتائج کا تصور شامل ہے۔
وزنی جین شریک اظہار نیٹ ورک تجزیہ (WGCNA)
WGCNA جین کے شریک اظہار ماڈیولز کو دریافت کرنے کے لئے وسیع پیمانے پر استعمال شدہ ڈیٹا کان کنی کا طریقہ ہے۔ یہ مائکرو رے اور این جی ایس جین اظہار کے اعداد و شمار سمیت مختلف اظہار ڈیٹاسیٹ پر لاگو ہوتا ہے۔
انٹرپروسکین
انٹرپروسکن ٹول انٹر پرو پروٹین ترتیب تجزیہ اور درجہ بندی فراہم کرتا ہے۔
گو کیگ افزودگی
جی او کیگ افزودگی کا آلہ جی او افزودگی ہسٹگرام ، کیگ انرچمنٹ ہسٹوگرام اور کیگ کی افزودگی کا راستہ تیار کرنے کے لئے ڈیزائن ہے جو فراہم کردہ جین سیٹ اور اسی طرح کی تشریح پر مبنی ہے۔