Pacbio مکمل طوالت کا ٹرانسکرپٹوم

PacBio فل لینتھ ٹرانسکرپٹوم سیکوینسنگ، Isoseq، ٹرانسکرپٹ آئسوفارمز کی درست شناخت کے قابل بناتا ہے، متبادل پولی اڈینیلیشن اور سپلیسنگ پر روشنی ڈالتا ہے، اور زیادہ درست جین ایکسپریشن تجزیہ کا باعث بنتا ہے۔ BMKCloud PacBio فل لینتھ ٹرانسکرپٹوم پائپ لائن کو سرکلر کنسنسس سیکوینسنگ (CCS) موڈ میں ترتیب دی گئی cDNA لائبریریوں کا تجزیہ کرنے کے لیے ڈیزائن کیا گیا ہے اور فل لینتھ نان چائمرک (FLNC) سیکوینسز کی شناخت کی گئی ہے، جنہیں پھر غیر فالتو اسکرپٹ میں کلسٹر کیا جاتا ہے۔ اس کے بعد BUSCO تجزیہ ٹرانسکرپٹوم اسمبلی کی مکملیت کا اندازہ کرتا ہے۔ جمع شدہ ٹرانسکرپٹوم سے، متعدد تجزیے کیے جاتے ہیں: متبادل الگ کرنا، سادہ سیکوینس ریپیٹ (SSR)، lncRNA اور متعلقہ ٹارگٹ جینز کی پیشین گوئی، ناول جینز کی پیشین گوئی، جین فیملی تجزیہ، ٹرانسکرپشن فیکٹر کا تجزیہ، اور ٹرانسکرپٹس کی فعال تشریح۔