mRNA-seq (NGS) حوالہ جینوم کے ساتھ
RNA-seq زندگی اور فصلی علوم میں ایک معیاری ٹول ہے، جو جینوم اور پروٹوم کے درمیان فرق کو ختم کرتا ہے۔ اس کی طاقت نئی نقلیں دریافت کرنے اور ایک پرکھ میں ان کے اظہار کی مقدار کو درست کرنے میں مضمر ہے۔ یہ وسیع پیمانے پر تقابلی ٹرانسکرپٹومک اسٹڈیز کے لیے استعمال ہوتا ہے، مختلف خصلتوں یا فینوٹائپس سے متعلق جینز پر روشنی ڈالنا، جیسے اتپریورتیوں کا جنگلی قسموں سے موازنہ کرنا یا مخصوص حالات میں جین کے اظہار کو ظاہر کرنا۔ BMKCloud mRNA(Reference) APP اظہار کی مقدار، تفریق اظہار تجزیہ (DEG)، اور ترتیب کے ڈھانچے کے تجزیوں کو mRNA-seq (NGS) بائیو انفارمیٹکس پائپ لائن میں ضم کرتا ہے اور اسی طرح کے سافٹ ویئر کی طاقتوں کو یکجا کرتا ہے، سہولت اور صارف دوستی کو یقینی بناتا ہے۔ صارفین اپنا RNA-seq ڈیٹا کلاؤڈ پر اپ لوڈ کر سکتے ہیں، جہاں ایپ ایک جامع، ایک سٹاپ بائیو انفارمیٹک تجزیہ حل پیش کرتی ہے۔ مزید برآں، یہ صارفین کے تجربے کو ترجیح دیتا ہے، صارفین کی مخصوص ضروریات کے مطابق ذاتی نوعیت کے آپریشنز پیش کرتا ہے۔ صارف پیرامیٹرز سیٹ کر سکتے ہیں اور پائپ لائن مشن خود جمع کر سکتے ہیں، انٹرایکٹو رپورٹ چیک کر سکتے ہیں، ڈیٹا/ڈیاگرام دیکھ سکتے ہیں اور ڈیٹا مائننگ مکمل کر سکتے ہیں، جیسے: ٹارگٹ جین کا انتخاب، فنکشنل کلسٹرنگ، ڈایاگرامنگ وغیرہ۔
پلیٹ فارم:ایلومینا، ایم جی آئی
حکمت عملی:RNA-Seq
لے آؤٹ: پیریڈ، صاف ڈیٹا۔
لائبریری کی قسم:fr-unstranded، fr-firststrand یا fr-secondstrand
لمبائی پڑھیں:150 بی پی
فائل کی قسم:*.fastq، *.fq، *.fastq.gz یا *.fq.gz۔ سسٹم کرے گا۔.fastq فائلوں کو اپنے فائل کے ناموں کے مطابق خود بخود جوڑیں،مثال کے طور پر *_1.fastq کا جوڑا *._2.fastq کے ساتھ۔
نمونوں کی تعداد:تعداد پر کوئی پابندی نہیں ہے۔نمونوں کی، لیکن تجزیہ کے وقت کی تعداد کے طور پر اضافہ ہو جائے گانمونے بڑھتے ہیں.
تجویز کردہ ڈیٹا کی مقدار:6G فی نمونہ