Exclusive Agency for Korea

条形 بینر -03

خبریں

جینوم ارتقاء ، پینجوموم

پین جینوم کیا ہے؟

جمع شواہد سے پتہ چلتا ہے کہ کسی نوع کے مختلف تناؤ کے مابین تغیر بہت بڑا ہوسکتا ہے۔ ایک ہی جینوم کافی حد سے دور ہے تاکہ کسی ایک پرجاتی کی جینیاتی معلومات کی پوری تصویر حاصل کی جاسکے۔ پین جینوم اسٹڈی کا مقصد کسی پرجاتی کا زیادہ جامع جینومک گراف حاصل کرنا ہے اور متعدد تناؤ کی جینوم ڈی نوو اسمبلی کا انعقاد کرکے خصلتوں اور جینیاتی کوڈ کے مابین تعلقات کو ڈی کوڈ کرنا ہے ، جو مختلف حالتوں کی گہری اور وسیع تر کان کنی کی اجازت دیتا ہے۔

پین جینوم اسٹڈی کے رجحانات

1

چترا 1 پین جینوم کے شائع شدہ تحقیقی مقالوں کے رجحانات۔
نوٹ: اعداد و شمار "پین جینوم" کو فطرت ، سیل اور سائنس سیریز کے جرائد میں شائع ہونے والے مضامین کے عنوانات کی تلاش کے لئے کلیدی لفظ کے طور پر لینے کا نتیجہ ظاہر کرتا ہے۔

a. متعدد نمونوں سے پڑھنے کو ایک حوالہ کے ساتھ منسلک کیا جاتا ہے اور غیر دستخط شدہ افراد کو ناول کے بارے میں جمع کیا جاتا ہے۔ ان ناول کو اصل حوالہ ترتیب میں شامل کرکے ، ایک پینجومن حوالہ تعمیر کیا جاسکتا ہے۔ ڈسپینس ایبل خطوں کا تعین تمام پڑھنے کو پینجوموم میں نقشہ سازی کی بنیاد پر کیا جاتا ہے۔

بی۔ ڈی نووو اسمبلی متعدد رسائوں کے جینومز کی اسمبلی مکمل جینوم سیدھ کے نقطہ نظر کو ڈسپینس ایبل جینومک علاقوں کی نشاندہی کرنے کی اجازت دیتی ہے۔

c پورے جینوم سیدھ سے یا ڈی نوو گراف اسمبلی سے ایک پین جینوم گراف تعمیر کیا جاسکتا ہے ، جو گراف کے ذریعے منفرد راستوں کے طور پر ڈسپنس ایبل علاقوں کی مختلف معلومات کو موثر انداز میں اسٹور کرتا ہے۔

پین جینوم کی تعمیر کیسے کریں؟

2

چترا 2 پین جینوم نقطہ نظر کا موازنہ1

a. متعدد نمونوں سے پڑھنے کو ایک حوالہ کے ساتھ منسلک کیا جاتا ہے اور غیر دستخط شدہ افراد کو ناول کے بارے میں جمع کیا جاتا ہے۔ ان ناول کو اصل حوالہ ترتیب میں شامل کرکے ، ایک پینجومن حوالہ تعمیر کیا جاسکتا ہے۔ ڈسپینس ایبل خطوں کا تعین تمام پڑھنے کو پینجوموم میں نقشہ سازی کی بنیاد پر کیا جاتا ہے۔

بی۔ ڈی نووو اسمبلی متعدد رسائوں کے جینومز کی اسمبلی مکمل جینوم سیدھ کے نقطہ نظر کو ڈسپینس ایبل جینومک علاقوں کی نشاندہی کرنے کی اجازت دیتی ہے۔

c پورے جینوم سیدھ سے یا ڈی نوو گراف اسمبلی سے ایک پین جینوم گراف تعمیر کیا جاسکتا ہے ، جو گراف کے ذریعے منفرد راستوں کے طور پر ڈسپنس ایبل علاقوں کی مختلف معلومات کو موثر انداز میں اسٹور کرتا ہے۔

حال ہی میں پان جینوم شائع ہوا

● عصمت دری پین جینومز2

3

● ٹماٹر پین جینومز 3

4

● چاول پین -گینوم4

5

● سورج مکھی پین جینوم5

6

● سویا بین پین جینوم 6

7

● چاول پین جینوم7

8

● جو پین جینوم8

9

● گندم پین جینوم9

10

● جورم پین جینوم10

11

● فائٹوپلانکٹن پین جینوم11

12

حوالہ

1۔ بائر پیئ ، گولکز اے اے ، شیبن اے ، بیٹلی جے ، ایڈورڈز ڈی پلانٹ پین جینومز ایک نیا حوالہ ہے۔ نیٹ پودے 2020 ؛ 6 (8): 914-920۔ doi: 10.1038/S41477-020-0733-0

2. گانا جے ایم ، گوان زیڈ ، ہو جے ، وغیرہ۔ آٹھ اعلی معیار کے جینوم پان جینوم فن تعمیر اور براسیکا نیپس کے ماحولیاتی تفریق کو ظاہر کرتے ہیں۔ نیٹ پودے 2020 ؛ 6 (1): 34-45۔ doi: 10.1038/S41477-019-0577-7

3. گاو ایل ، گونڈا اول ، سن ایچ ، وغیرہ۔ ٹماٹر پین جینوم نئے جینوں اور ایک نایاب ایللی کو ریگولیٹ کرنے والے پھلوں کے ذائقہ سے پردہ اٹھاتا ہے۔ نیٹ جینیٹ۔ 2019 51 51 (6): 1044-1051۔ doi: 10.1038/S41588-019-0410-2

4. ژاؤ کیو ، فینگ کیو ، لو ایچ ، وغیرہ۔ پین جینوم تجزیہ کاشت شدہ اور جنگلی چاول میں جینومک تغیر کی حد کو اجاگر کرتا ہے [NAT جینیٹ میں شائع شدہ اصلاح ظاہر ہوتی ہے۔ 2018 اگست 50 50 (8): 1196]۔ نیٹ جینیٹ۔ 2018 50 50 (2): 278-284۔ doi: 10.1038/S41588-018-0041-Z

5. ہبنر ایس ، برکووچ این ، ٹوڈیسکو ایم ، وغیرہ۔ سورج مکھی کے پین جینوم تجزیہ سے پتہ چلتا ہے کہ ہائبرڈائزیشن نے جین کے مواد اور بیماری کے خلاف مزاحمت کو تبدیل کیا ہے۔ نیٹ پودے 2019 5 5 (1): 54-62۔ doi: 10.1038/S41477-018-0329-0

6. لیو وائی ، ڈو ایچ ، لی پی ، وغیرہ۔ جنگلی اور کاشت شدہ سویا بین کا پین جین۔ سیل 2020 ؛ 182 (1): 162-176.E13۔ doi: 10.1016/j.cell.2020.05.023

7. کن پی ، لو ایچ ، ڈو ایچ ، وغیرہ۔ 33 جینیاتی طور پر متنوع چاول کے حصول کے پین جینوم تجزیہ سے پوشیدہ جینومک تغیرات کا پتہ چلتا ہے [پرنٹ سے پہلے آن لائن شائع ہوا ، 2021 مئی 25]۔ سیل 2021 ؛ S0092-8674 (21) 00581-x۔ doi: 10.1016/j.cell.2021.04.046

8. جیاکوڈی ایم ، پدمارسو ایس ، ہیبر جی ، وغیرہ۔ جو کے پین جینوم میں تغیر پزیر کی افزائش کی پوشیدہ میراث کا پتہ چلتا ہے۔ فطرت 2020 ؛ 588 (7837): 284-289۔ doi: 10.1038/S41586-020-2947-8

9. واکوویاک ایس ، گاو ایل ، موناٹ سی ، وغیرہ۔ متعدد گندم کے جینوم جدید افزائش میں عالمی تغیر کو ظاہر کرتے ہیں۔ فطرت 2020 ؛ 588 (7837): 277-283۔ doi: 10.1038/S41586-020-2961-X

10. تاؤ وائی ، لوو ایچ ، سو جے ، وغیرہ۔ کاشت شدہ اور جنگلی جورج کے پین جین کے اندر وسیع پیمانے پر تغیر [2021 مئی 2021 2021 پرنٹ سے پہلے آن لائن شائع ہوا]۔ نیٹ پودے 2021 ؛ 10.1038 / S41477-021-00925-X۔ doi: 10.1038/S41477-021-00925-X

11. فین ایکس ، کیو ایچ ، ہان ڈبلیو ، وغیرہ۔ فائٹوپلانکٹن پینجوموم نے متنوع افعال کی وسیع پروکریوٹک افقی جین کی منتقلی کا انکشاف کیا ہے۔ سائنس ایڈ. 2020 ؛ 6 (18): EABA0111۔ شائع 2020 اپریل 29. doi: 10.1126/sciadv.aba0111


پوسٹ ٹائم: جنوری -04-2022

اپنا پیغام ہمیں بھیجیں: