T2T جینوم اسمبلی ، گیپ فری جینوم
1stچاول کے دو جینوم1
عنوان: ژیان/انڈیکا رائس کے لئے دو گیپ فری ریفرنس جینوم کی اسمبلی اور توثیق سے پلانٹ سینٹروومیر فن تعمیر میں بصیرت کا پتہ چلتا ہے
doi:https://doi.org/10.1101/2020.12.24.424073
پوسٹ ٹائم: 01 جنوری ، 2021۔
انسٹی ٹیوٹ: ہازونگ زرعی یونیورسٹی ، چین
مواد
O. Sativa ژیان/انڈیکاچاول کی اقسام 'زینشن 97 (ZS97)' اور 'منگھوئی 63 (MH63)
ترتیب کی حکمت عملی
این جی ایس پڑھتا ہے + Hifi read + Clr reads + Bionano + HI-C
ڈیٹا:
ZS97: 8.34 GB （~ 23x） Hifi read + 48.39 GB (~ 131x) CLR پڑھتا ہے + 25 GB (~ 69x) NGS + 2 Bionano IRYS خلیات
ایم ایچ 63: 37.88 جی بی (3 103x) HIFI پڑھتا ہے + 48.97 GB (2 132x) CLR پڑھتا ہے + 28 GB (~ 76x) NGS + 2 Bionano IRYS خلیات
چترا 1 چاول کے دو گیپ فری جینوم (MH63 اور ZS97)
2ndکیلے کا جینوم2
عنوان: نانوپور کی ترتیب کا استعمال کرتے ہوئے کیلے کے ٹیلومیر سے ٹیلومیر گیپلیس کروموسومس
doi:https://doi.org/10.1101/2021.04.16.440017
پوسٹ ٹائم: 17 اپریل ، 2021۔
انسٹی ٹیوٹ: یونیورسٹی پیرس ساکلے ، فرانس
مواد
ڈبل ہیپلائڈموسی اکیومیناٹاایس پی پیmalaccensis، کے لئے ، ، ، ، ، ، ، ، ، ، کے لئے ، صدیں ، ، ، ، کے لئے.DH-PHANG)
ترتیب کی حکمت عملی اور ڈیٹا:
HISEQ2500 PE250 وضع+ منین/ پرومیٹین (93GB ، ~ 200X)+ آپٹیکل نقشہ (DLE-1+ BSPQ1)
جدول 1 موسی اکیومیناٹا (ڈی ایچ-پیہنگ) جینوم اسمبلیاں کا موازنہ
چترا 2 موسی جینومز فن تعمیر کا موازنہ
3rdphaeodactylum tricornutum جینوم3
عنوان: ٹیلومیر سے ٹیلومیر جینوم اسمبلی کیP
ہیوڈکٹیلم ٹرائکورنٹم
doi:https://doi.org/10.1101/2021.05.04.442596
پوسٹ ٹائم: 04 مئی ، 2021
انسٹی ٹیوٹ: ویسٹرن یونیورسٹی ، کینیڈا
مواد
phaeodactylum tricornutum(طحالب اور پروٹوزووا سی سی اے پی 1055/1 کا ثقافت مجموعہ)
ترتیب کی حکمت عملی اور ڈیٹا:
1 آکسفورڈ نانو پور منین فلو سیل + A 2 × 75 جوڑا بنانے والا آخر مڈ آؤٹ پٹ نیکسٹسیک 550 رن
اعداد و شمار 3 ٹیلومیر سے ٹیلومیر جینوم اسمبلی کے لئے ورک فلو
4thانسانی CHM13 جینوم4
عنوان: انسانی جینوم کا مکمل تسلسل
doi:https://doi.org/10.1101/2021.05.26.445798
پوسٹ ٹائم: 27 مئی 2021
انسٹی ٹیوٹ: قومی انسٹی ٹیوٹ آف ہیلتھ (NIH) ، USA
مواد: سیل لائن CHM13
ترتیب کی حکمت عملی اور ڈیٹا:
30 × پیکبیو سرکلر اتفاق رائے کی ترتیب (HIFI) ، 120 × آکسفورڈ نانو پور الٹرا لمبی پڑھنے کی ترتیب ، 100 × ایلومینا پی سی آر فری ترتیب (ILMN) ، 70 × ایلومینا / ارمینہ جینومکس ہائ سی (ہائ-سی) ، بائونو آپٹیکل نقشہ جات ، اور اسٹرینڈ سیک
جدول 2 GRCH38 اور T2T-CHM13 انسانی جینوم اسمبلیاں کا موازنہ
حوالہ
1. سرجری نورک وغیرہ۔ انسانی جینوم کا مکمل تسلسل۔ بائیورکسیو 2021.05.26.445798 ؛ doi:https://doi.org/10.1101/2021.05.26.445798
2. کارولین بیلسر ET رحمہ اللہ تعالی. نانوپور کی ترتیب کا استعمال کرتے ہوئے کیلے کے ٹیلومیر سے ٹیلومیر گیپلیس کروموسومز۔ بائیورکسیو 2021.04.16.440017 ؛ doi:https://doi.org/10.1101/2021.04.16.440017
3. ڈینیئل جے گیگور ایٹ ال۔ ٹیلومیر ٹو ٹیلومیر جینوم اسمبلی فیوڈکٹیلم ٹرائورنوٹم کی۔ بائیورکسیو 2021.05.04.442596 ؛ doi:https://doi.org/10.1101/2021.05.04.442596
4. جیا-منگ سونگ ET رحمہ اللہ تعالی. ژیان/انڈیکا رائس کے لئے دو گیپ فری ریفرنس جینوم کی اسمبلی اور توثیق سے پودوں کے سینٹرومیئر فن تعمیر کی بصیرت کا پتہ چلتا ہے۔ بائورکسیو 2020.12.24.424073 ؛ doi:https://doi.org/10.1101/2020.12.24.424073
پوسٹ ٹائم: جنوری -06-2022