mRNA-seq (NGS) - ڈی نوو

mRNA کی ترتیب مخصوص حالات میں خلیوں میں تمام mRNA ٹرانسکرپٹس کی پروفائلنگ کی اجازت دیتی ہے اور یہ مختلف تحقیقی شعبوں میں وسیع پیمانے پر استعمال ہونے والی ٹیکنالوجی ہے۔ BMKCloud De novo mRNA-seq پائپ لائن کو پولی-A افزودہ ترتیب والی لائبریریوں کا تجزیہ کرنے کے لیے ڈیزائن کیا گیا ہے جب کوئی حوالہ جینوم دستیاب نہ ہو۔ پائپ لائن کوالٹی کنٹرول کے ساتھ شروع ہوتی ہے، اس کے بعدڈی نووٹرانسکرپٹ اسمبلی اور یونیجین سیٹ سلیکشن۔ یونیجین سٹرکچر کا تجزیہ کوڈنگ سیکوینس (CDS) اور سادہ سیکوینس ریپیٹس (SSR) کی پیش گوئی کرتا ہے۔ اس کے بعد، امتیازی اظہار کے تجزیے میں آزمائشی حالات کے درمیان امتیازی طور پر اظہار شدہ جین (DEGs) کا پتہ چلتا ہے، جس کے بعد حیاتیاتی بصیرت کو نکالنے کے لیے ڈی ای جی کی فنکشنل تشریح اور افزودگی ہوتی ہے۔