یوکریوٹک ایم آر این اے تجزیہ (حوالہ پر مبنی اور ڈی نوو اختیارات دستیاب ہیں)
یہ پائپ لائن این جی ایس آر این اے سیک کے اعداد و شمار کو ان پٹ کے طور پر استعمال کرتی ہے اور متعدد بہاو تجزیوں سے نتائج پیدا کرتی ہے جس میں شامل ہے لیکن اس تک محدود نہیں ہے: ڈیٹا کوالٹی کی تشخیص کو ترتیب دینا ،ڈی نووٹرانسکرپشن سائٹ تشریح ، متغیر سپلائینگ تجزیہ ، مختلف اظہار تجزیہ ، فنکشن تشریح اور افزودگی تجزیہ۔
طویل غیر کوڈنگ آر این اے تجزیہ
لانگ نان کوڈنگ آر این اے (ایل این سی آر این اے) غیر کوڈنگ ٹرانسکرپٹ ہیں جن کی لمبائی 200 این ٹی سے زیادہ لمبی ہے اور کرومیٹن تنظیم اور ضابطے میں کردار ادا کرنے کے لئے جانا جاتا ہے۔ اعلی تھروپپٹ ترتیب دینے والی ٹیکنالوجیز اور بائیو انفارمیٹک نے ہماری تفہیم LNCRNA ترتیب اور پوزیشننگ کی معلومات کو بااختیار بنایا ہے تاکہ اہم ریگولیٹری افعال کے ساتھ LNCRNAs کی شناخت کی جاسکے۔ یہ پائپ لائن Eukaryotic mRNA تجزیہ پائپ لائن میں مذکور تجزیوں کے علاوہ LNCRNA تجزیہ فراہم کرتی ہے۔
16s/18s/اس کا امپلیکن تسلسل
مائکروبیل تنوع پروجیکٹ تجزیہ میں برسوں کے تجربے کی بنیاد پر ایمپلیکن سیکوینسی مائکروبیل تنوع تجزیہ پائپ لائن تیار کی گئی تھی۔ پائپ لائن میں معیاری بنیادی تجزیہ ہوتا ہے ، جو موجودہ مائکروبیل ریسرچ اور ذاتی نوعیت کے تجزیہ کے مرکزی دھارے میں تجزیہ کرنے والے مواد کا احاطہ کرتا ہے۔ تجزیہ کی رپورٹ متنوع ذاتی تجزیہ کرنے کا آپشن کے ساتھ بھرپور اور جامع ہے۔ مزید برآں ، اضافی تخصیص اور کنٹرول کے لئے فلائی پر نمونے اور گروہوں میں ترمیم کی جاسکتی ہے۔
شاٹگن میٹجینومکس تجزیہ
شاٹگن میٹجینومک تجزیہ پائپ لائن ماحولیاتی نمونوں سے نکالے گئے مخلوط جینومک مواد سے این جی ایس ڈیٹا کا استعمال کرتی ہے۔ شامل تجزیے ماحولیاتی عوامل کے ساتھ پرجاتیوں کے تنوع اور کثرت ، آبادی کا ڈھانچہ ، فائیلوجنیٹک تعلقات ، فنکشنل جین ، اور ارتباطی نیٹ ورک کے بارے میں تفصیلی معلومات فراہم کرتے ہیں۔
این جی ایس-ڈبلیو جی ایس مختلف تجزیہ
این جی ایس-ڈبلیو جی ایس متغیر تجزیہ ایک مربوط مختلف قسم کا پتہ لگانے والی پائپ لائن ہے جو ڈیٹا کوالٹی کنٹرول ، ترتیب سیدھ ، تشریح ، اور جین اتپریورتن تجزیہ انجام دیتی ہے۔ پائپ لائن SNP اور انڈیل کا پتہ لگانے کے لئے GATK کے بہترین طریقوں کی پیروی کرتی ہے اور ساختی مختلف کالنگ کے لئے مانٹا کا استعمال کرتی ہے۔
جینوم وسیع ایسوسی ایشن اسٹڈی (GWAS)
GWAS پائپ لائن ایک بہاو تجزیہ ہے جو پہلے سے تیار کردہ VCF فائلوں اور ان پٹ کے طور پر افراد کے ایک ساتھ مل کر فینوٹائپ ڈیٹا لیتا ہے۔ مخصوص اعدادوشمار کے طریق کار کا استعمال کرتے ہوئے ، جی ڈبلیو اے ایس کا مقصد فینوٹائپک اختلافات سے وابستہ جینوم وسیع نیوکلیوٹائڈ تغیرات کو ننگا کرنا ہے۔ یہ پودوں اور جانوروں میں پیچیدہ انسانی بیماریوں اور پیچیدہ خصلتوں سے وابستہ فنکشنل جینوں کی کھوج میں ایک اہم کردار ادا کرتا ہے۔
بلک علیحدگی تجزیہ (بی ایس اے)
بی ایس اے کے تجزیے میں الگ الگ آبادی سے انتہائی فینوٹائپک خصلتوں والے افراد کو پولنگ کرنا شامل ہے۔ پولڈ نمونوں کے مابین تفریق لوکی کا موازنہ کرکے ، یہ نقطہ نظر تیزی سے ہدف جینوں سے وابستہ قریب سے منسلک مالیکیولر مارکروں کی نشاندہی کرتا ہے۔ پودوں اور جانوروں کی جینیاتی نقشہ سازی میں بڑے پیمانے پر استعمال کیا جاتا ہے ، یہ مارکر کی مدد سے افزائش نسل کے لئے ایک قیمتی ذریعہ ہے۔
ارتقائی جینیات کا تجزیہ
ارتقائی جینیٹکس تجزیہ ورک فلو نے جینیاتی ارتقاء کے منصوبوں میں BMKGENE کے وسیع تجربے کا فائدہ اٹھایا ہے اور اس میں فائیلوجینک درختوں کی تعمیر ، تعلق سے متعلق عدم استحکام تجزیہ ، جینیاتی تنوع کی تشخیص ، انتخابی جھاڑو کی شناخت ، رشتہ دار تجزیہ ، بنیادی اجزاء کا تجزیہ ، اور آبادی کے ڈھانچے کی خصوصیات شامل ہیں۔
