ارتقائی جینیات
خدمت کے فوائد
تاکاگی ایٹ ال۔پلانٹ جرنل، 2013
●جامع بائیو انفارمیٹک تجزیہ:جینیاتی تنوع کے تخمینے کو چالو کرنا ، جو پرجاتیوں کی ارتقائی صلاحیت کی عکاسی کرتا ہے ، اور متوازی ارتقا اور متوازی ارتقا کے کم سے کم اثر و رسوخ کے ساتھ پرجاتیوں کے مابین قابل اعتماد فائیلوجینک تعلق کو ظاہر کرتا ہے۔
●اختیاری تخصیص کردہ تجزیہ: جیسے نیوکلیوٹائڈ اور امینو ایسڈ کی سطح پر مختلف حالتوں پر مبنی موڑ کے وقت اور رفتار کا تخمینہ۔
●وسیع مہارت اور اشاعت کے ریکارڈ: BMKGENE نے 15 سال سے زیادہ عرصے سے آبادی اور ارتقائی جینیات کے منصوبوں میں بڑے پیمانے پر تجربہ جمع کیا ہے ، جس میں ہزاروں پرجاتیوں وغیرہ کا احاطہ کیا گیا ہے اور فطرت مواصلات ، سالماتی پلانٹ ، پلانٹ بائیوٹیکنالوجی جرنل وغیرہ میں شائع ہونے والے 1000 سے زیادہ اعلی سطحی منصوبوں میں حصہ لیا گیا ہے۔
● انتہائی ہنر مند بائیو انفارمیٹکس ٹیم اور مختصر تجزیہ سائیکل: جدید جینومکس تجزیہ میں زبردست تجربے کے ساتھ ، BMKGENE کی ٹیم تیز رفتار وقت کے ساتھ جامع تجزیے پیش کرتی ہے۔
● فروخت کے بعد کی حمایت:ہمارا عزم فروخت کی خدمت کے بعد 3 ماہ کے ساتھ منصوبے کی تکمیل سے آگے بڑھتا ہے۔ اس وقت کے دوران ، ہم نتائج سے متعلق کسی بھی سوالات کو حل کرنے کے لئے پروجیکٹ کی فالو اپ ، خرابیوں کا سراغ لگانا ، اور سوال و جواب کے سیشن پیش کرتے ہیں۔
خدمت کی وضاحتیں اور ضروریات
| ترتیب کی قسم | تجویز کردہ آبادی کا پیمانہ | ترتیب کی حکمت عملی | نیوکلیوٹائڈ کی ضروریات |
| جینوم کی پوری ترتیب | sub 30 افراد ، ہر سب گروپ سے 10 10 افراد کے ساتھ
| 10x | حراستی: ≥ 1 این جی/ µl کل رقم 30ng محدود یا کوئی انحطاط یا آلودگی |
| مخصوص لوکس ایمپلیفائیڈ ٹکڑا (SLAF) | ٹیگ گہرائی: 10x ٹیگز کی تعداد: <400 MB: WGS کی سفارش کی جاتی ہے <1GB: 100K ٹیگز 1 جی بی > 2 جی بی: 300K ٹیگز زیادہ سے زیادہ 500K ٹیگز | حراستی ≥ 5 این جی/µl کل رقم ≥ 80 این جی نانوڈروپ OD260/280 = 1.6-2.5 ایگرز جیل: نہیں یا محدود انحطاط یا آلودگی
|
خدمت کے کام کا بہاؤ
تجربہ ڈیزائن
نمونہ کی فراہمی
لائبریری کی تعمیر
ترتیب
ڈیٹا تجزیہ
فروخت کے بعد خدمات
خدمت میں آبادی کے ڈھانچے (فائیلوجنیٹک ٹری ، پی سی اے ، آبادی کے استحکام کا چارٹ) ، آبادی کا تنوع ، اور آبادی کا انتخاب (روابط سے متعلق عدم استحکام ، فائدہ مند سائٹوں کا انتخابی جھاڑو انتخاب) کا تجزیہ شامل ہے۔ اس خدمت میں اپنی مرضی کے مطابق تجزیہ (جیسے موڑ کا وقت ، جین کا بہاؤ) بھی شامل ہوسکتا ہے۔
*یہاں دکھائے گئے ڈیمو کے نتائج BMKGene کے ساتھ شائع ہونے والے جینوم سے ہیں
1. ارتقاء تجزیہ میں جینیاتی تغیرات پر مبنی فائیلوجنیٹک درخت ، آبادی کا ڈھانچہ اور پی سی اے کی تعمیر شامل ہے۔
فائیلوجنیٹک درخت مشترکہ آباؤ اجداد کے ساتھ پرجاتیوں کے مابین ٹیکسونومک اور ارتقائی تعلقات کی نمائندگی کرتا ہے۔
پی سی اے کا مقصد ذیلی آبادیوں کے مابین قربت کو تصور کرنا ہے۔
آبادی کا ڈھانچہ ایلیل تعدد کے لحاظ سے جینیاتی طور پر الگ الگ آبادی کی موجودگی کو ظاہر کرتا ہے۔
چن ، وغیرہ۔ al. ،pnas، 2020
2. سلیکٹیو جھاڑو
سلیکٹیو سویپ سے مراد ایک ایسا عمل ہے جس کے ذریعہ ایک فائدہ مند سائٹ کا انتخاب کیا جاتا ہے اور منسلک غیر جانبدار سائٹوں کی تعدد میں اضافہ ہوتا ہے اور غیر منسلک سائٹوں کی کمی ہوتی ہے جس کے نتیجے میں علاقائی کمی ہوتی ہے۔
منتخب سویپ علاقوں پر جینوم وسیع پتہ لگانے پر آبادی جینیاتی اشاریہ （π π ， FST ، تاجیما کی D) کا حساب کتاب کرکے کسی خاص مرحلے (10 KB) پر سلائڈنگ ونڈو (100 KB) کے اندر موجود تمام SNPs کے حساب سے کیا جاتا ہے۔
نیوکلیوٹائڈ تنوع (π）
تاجیما کی ڈی
فکسشن انڈیکس (ایف ایس ٹی)
وو ، وغیرہ۔ al. ،سالماتی پلانٹ، 2018
3. جین کا بہاؤ
وو ، وغیرہ۔ al. ،سالماتی پلانٹ، 2018
4. ڈیموگرافک تاریخ
ژانگ ، وغیرہ۔ al. ،فطرت ماحولیات اور ارتقاء، 2021
5. تغیر کا وقت
ژانگ ، وغیرہ۔ al. ،فطرت ماحولیات اور ارتقاء، 2021
اشاعتوں کے تیار کردہ ذخیرے کے ذریعہ BMKGENE کی ارتقائی جینیات کی خدمات کے ذریعہ سہولیات کی سہولیات کی تلاش کریں:
حسینیار ، اک ایٹ ال۔ (2023) 'SNP سالماتی مارکروں اور امیدوار جینوں کی دریافت جو APIS Cerana cerana cerana cerana larvae میں پوری جینوم ریسکیوینسنگ کے ذریعہ ہے ،بین الاقوامی جرنل آف مالیکیولر سائنسز، 24 (7) doi: 10.3390/IJMS24076238۔
چائی ، جے۔ وغیرہ۔ (2022) 'ایک جنگلی ، جینیاتی طور پر خالص چینی دیوہیکل سلامینڈر کی دریافت سے تحفظ کے نئے مواقع پیدا ہوتے ہیں' ،زولوجیکل ریسرچ، 2022 ، جلد 43 ، شمارہ 3 ، صفحات: 469-480 ، 43 (3) ، پی پی 469–480۔ doi: 10.24272/j.issn.2095-8137.2022.101.
ہان ، ایم وغیرہ۔ .پلانٹ سائنس میں فرنٹیئرز، 13 ، صفحہ۔ 882601. doi: 10.3389/fpls.2022.882601/bibtex.
وانگ ، جے۔ وغیرہ۔ (2022) 'کروموسوم سطح کے جینوم اسمبلی سے لانگن ارتقاء میں جینومک بصیرت اور لانگان کے لوازمات کی آبادی جینومکس' ،باغبانی کی تحقیق، 9. doi: 10.1093/hr/uhac021.
