یوکریاٹک ایم آر این اے سیکوینسنگ-این جی ایس
خصوصیات
● لائبریری کی تیاری سے پہلے پولی mRNA کی گرفتاری
● اسٹرینڈ کے لیے مخصوص ترتیب والے ڈیٹا کو حاصل کرنے کے لیے اختیاری دشاتمک mRNA لائبریری کی تیاری
● جین کے اظہار اور نقل کی ساخت کا بایو انفارمیٹک تجزیہ
فوائد
●وسیع مہارت: ہماری ٹیم نے BMKgene میں 600,000 سے زیادہ نمونوں پر کارروائی کی ہے، جس میں مختلف نمونوں کی اقسام جیسے سیل کلچر، ٹشوز، اور جسمانی رطوبتیں پھیلی ہوئی ہیں۔ ہم ہر پروجیکٹ کے لیے کافی تجربہ لاتے ہیں اور مختلف ریسرچ ڈومینز میں 100,000 mRNA-Seq پروجیکٹس کو کامیابی سے مکمل کر چکے ہیں۔
●سخت کوالٹی کنٹرول: ہم نمونے اور لائبریری کی تیاری سے لے کر ترتیب اور بایو انفارمیٹکس تک تمام مراحل میں بنیادی کنٹرول پوائنٹس کو نافذ کرتے ہیں۔ یہ محتاط نگرانی مسلسل اعلیٰ معیار کے نتائج کی فراہمی کو یقینی بناتی ہے، آپ کو یقین دلاتی ہے کہ آپ کا پروجیکٹ قابل اعتماد ہاتھوں میں ہے۔
●جامع تشریح: ہم ایک سے زیادہ ڈیٹا بیس کا استعمال کرتے ہیں تاکہ ڈیفرنشیلی ایکسپریسڈ جینز (DEGs) کو فعال طور پر تشریح کریں اور متعلقہ افزودگی کے تجزیے انجام دیں۔ یہ جامع نقطہ نظر ٹرانسکرپٹوم ردعمل کے تحت سیلولر اور سالماتی عمل کے بارے میں بصیرت فراہم کرتا ہے، اس بات کو یقینی بناتا ہے کہ آپ کو اپنے پروجیکٹ کے نتائج کے بارے میں مکمل طور پر آگاہ کیا جائے۔
●پوسٹ سیلز سپورٹ: ہماری وابستگی 3 ماہ کے بعد فروخت سروس کی مدت کے ساتھ پراجیکٹ کی تکمیل سے آگے ہے۔ اس وقت کے دوران، ہم نتائج سے متعلق کسی بھی سوالات کو حل کرنے کے لیے پروجیکٹ کی پیروی، ٹربل شوٹنگ میں مدد، اور سوال و جواب کے سیشن پیش کرتے ہیں۔
نمونے کی ضروریات اور ترسیل
| لائبریری | ترتیب کی حکمت عملی | ڈیٹا تجویز کیا گیا۔ | کوالٹی کنٹرول |
| پولی اے افزودہ | Illumina PE150 DNBSEQ-T7 | 6 -10 جی بی | Q30≥85% |
نمونہ کی ضروریات:
نیوکلیوٹائڈز:
| Conc.(ng/μl) | رقم (μg) | طہارت | سالمیت | |
| معیاری لائبریری | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 محدود یا کوئی پروٹین یا ڈی این اے آلودگی جیل پر دکھائی نہیں دیتی۔ | پودوں کے لیے: RIN≥4.0؛ جانوروں کے لیے: RIN≥4.5؛ 5.0≥28S/18S≥1.0; محدود یا کوئی بنیادی بلندی نہیں۔ |
| دشاتمک لائبریری | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 محدود یا کوئی پروٹین یا ڈی این اے آلودگی جیل پر دکھائی نہیں دیتی۔ | پودوں کے لیے: RIN≥4.0؛ جانوروں کے لیے: RIN≥4.5؛ 5.0≥28S/18S≥1.0; محدود یا کوئی بنیادی بلندی نہیں۔ |
● پودے:
جڑ، تنا یا پنکھڑی: 450 ملی گرام
پتی یا بیج: 300 ملی گرام
پھل: 1.2 گرام
●جانور:
دل یا آنت: 300 ملی گرام
ویزرا یا دماغ: 240 ملی گرام
پٹھوں: 450 ملی گرام
ہڈیاں، بال یا جلد: 1 گرام
● آرتھروپوڈس:
کیڑے: 6 گرام
کرسٹیسیا: 300 ملی گرام
● پورا خون: 1 ٹیوب
● خلیات:106 خلیات
تجویز کردہ نمونے کی ترسیل
کنٹینر: 2 ملی لیٹر سینٹرفیوج ٹیوب (ٹن ورق کی سفارش نہیں کی جاتی ہے)
نمونہ لیبلنگ: گروپ + نقل جیسے A1، A2، A3؛ B1, B2, B3...
کھیپ:
1. خشک برف: نمونوں کو تھیلے میں پیک کرنے اور خشک برف میں دفن کرنے کی ضرورت ہے۔
2. RNAs ٹیبل ٹیوب: RNA کے نمونے RNA سٹیبلائزیشن ٹیوب (جیسے RNAstable®) میں خشک کیے جا سکتے ہیں اور کمرے کے درجہ حرارت پر بھیجے جا سکتے ہیں۔
سروس ورک فلو
تجربہ ڈیزائن
نمونہ کی ترسیل
آر این اے نکالنا
لائبریری کی تعمیر
ترتیب دینا
ڈیٹا کا تجزیہ
فروخت کے بعد کی خدمات
بایو انفارمیٹکس
یوکریوٹک ایم آر این اے سیکوینسنگ تجزیہ ورک فلو
بایو انفارمیٹکس
Øخام ڈیٹا کوالٹی کنٹرول
Øحوالہ جینوم سیدھ
Øنقل کی ساخت کا تجزیہ
Øاظہار کی مقدار
Øامتیازی اظہار کا تجزیہ
Øفنکشن تشریح اور افزودگی
حوالہ جینوم سیدھ
ڈیٹا سیچوریشن
حیاتیاتی نقلوں کا نمونہ ارتباط اور تشخیص
مختلف اظہار شدہ جین (DEGs)
ڈی ای جی کی فنکشنل تشریح
ڈی ای جی کی فنکشنل افزودگی
BMKGene کی یوکرائیوٹک NGS mRNA کی ترتیب دینے والی خدمات کے ذریعے تیار کردہ اشاعتوں کے مجموعے کے ذریعے پیشرفت کو دریافت کریں۔
ہوانگ، L. et al. (2023) 'ٹرائکلوسان اور ٹرائکلو کاربن بدبو کی پہچان کو روک کر سنہری مچھلی کی ولفیٹری صلاحیت کو کمزور کرتے ہیں، ولفیٹری سگنل کی نقل و حمل میں خلل ڈالتے ہیں، اور ولفیٹری انفارمیشن پروسیسنگ میں خلل ڈالتے ہیں'، واٹر ریسرچ، 233، صفحہ۔ 119736. doi: 10.1016/J.WATRES.2023.119736.
جیا، ایل جے وغیرہ۔ (2023) 'Aspergillus fumigatus انسانی p11 کو ہائی جیک کرتا ہے تاکہ فنگل پر مشتمل فگوسومز کو غیر انحطاط پذیر راستے پر بھیج دیا جائے'، سیل ہوسٹ اینڈ مائکروب، 31(3)، pp. 373-388.e10۔ doi: 10.1016/J.CHOM.2023.02.002۔
جن، کے وغیرہ۔ (2022) 'TCP ٹرانسکرپشن فیکٹرز انولڈ ان شوٹ ڈیولپمنٹ آف ما بانس (Dendrocalamus latiflorus Munro)'، فرنٹیئرز ان پلانٹ سائنس، 13، صفحہ۔ 884443. doi: 10.3389/FPLS.2022.884443/BIBTEX۔
وین، ایکس وغیرہ۔ (2022) 'Chrysanthemum lavandulifolium genome and the molecular mechanism underlying diverse capitulum type', Horticulture Research, 9. doi: 10.1093/HR/UHAB022۔
ژانگ، یوجی وغیرہ۔ (2023) 'سنرجسٹک ROS اضافہ اور آٹوفجی بلاکیج کے ذریعے کولوریکٹل کینسر پر سونوڈینامک تھراپی کو بڑھانے کے لئے ایک جھرنا۔'، نینو ٹوڈے، 49، صفحہ۔ 101798. doi: 10.1016/J.NANTOD.2023.101798.
