ڈی نوو بیکٹیریل جینوم اسمبلی
ہم ایک مکمل بیکٹیریل جینوم اسمبلی سروس فراہم کرتے ہیں، 0 فرق کی ضمانت دیتے ہیں۔ یہ طویل پڑھی جانے والی ترتیب دینے والی ٹیکنالوجیز، جیسے نانوپور اور PacBio کو اسمبلی کے لیے اور مختصر پڑھنے کی ترتیب کو Illumina کے ساتھ اسمبلی کی توثیق اور ONT ریڈز کی غلطی کی اصلاح کے لیے مربوط کرنے سے ممکن ہے۔ ہماری سروس مخصوص تحقیقی اہداف کو پورا کرتے ہوئے اسمبلی، فنکشنل تشریح، اور جدید بائیو انفارمیٹک تجزیہ سے مکمل بایو انفارمیٹک ورک فلو فراہم کرتی ہے۔ یہ سروس مختلف جینیاتی اور جینومک اسٹڈیز کے لیے عین حوالہ جینوم کی ترقی کے قابل بناتی ہے۔ مزید برآں، یہ سٹرین آپٹیمائزیشن، جینیاتی انجینئرنگ، اور مائکروبیل ٹکنالوجی کی ترقی جیسی ایپلی کیشنز کی بنیاد بناتا ہے، جس سے قابل اعتماد اور خلا سے پاک جینومک ڈیٹا کو یقینی بنایا جاتا ہے جو سائنسی بصیرت اور بائیوٹیکنالوجیکل اختراعات کو آگے بڑھانے کے لیے اہم ہے۔
سروس کی خصوصیات
● جینوم مکمل ہونے کی مطلوبہ ڈگری کے لحاظ سے انتخاب کرنے کے لیے دو ممکنہ اختیارات کے ساتھ۔
● ڈرافٹ جینوم آپشن: Illumina NovaSeq PE150 کے ساتھ مختصر پڑھنے کی ترتیب۔
● 0 گیپ جینوم مکمل کریں۔
● جینوم اسمبلی کے لیے Nanopore PromethION 48 یا PacBio Revio پر طویل پڑھنے والی ترتیب۔
● جینوم کی توثیق اور غلطی کی اصلاح (نانوپور) یا ڈرافٹ جینوم بنانے کے لیے Illumina NovaSeq پر مختصر پڑھنے کی ترتیب۔
سروس کے فوائد
●زیرو گیپ جینوم کی گارنٹی: یہ طویل پڑھنے والی ترتیب (نانوپور یا PacBio) کے ساتھ Illumina کی ترتیب کے انضمام کی وجہ سے ہے۔
●مکمل بایو انفارمیٹکس ورک فلو:اس میں جینوم اسمبلی اور متعدد جینومک عناصر کی پیشین گوئی، فنکشنل جین تشریح، اور جینوم ویژولائزیشن جیسے سرکوس پلاٹ شامل ہیں۔
●وسیع مہارت: 20,000 سے زیادہ مائکروبیل جینومز کے جمع ہونے کے ساتھ، BMKGENE ایک دہائی سے زیادہ کا تجربہ، ایک انتہائی ہنر مند تجزیہ ٹیم، جامع مواد، اور فروخت کے بعد بہترین معاونت لاتا ہے۔
●پوسٹ سیلز سپورٹ:ہماری وابستگی 3 ماہ کے بعد فروخت سروس کی مدت کے ساتھ پراجیکٹ کی تکمیل سے آگے ہے۔ اس وقت کے دوران، ہم نتائج سے متعلق کسی بھی سوالات کو حل کرنے کے لیے پروجیکٹ کی پیروی، ٹربل شوٹنگ میں مدد، اور سوال و جواب کے سیشن پیش کرتے ہیں۔
●ایک سے زیادہ ترتیب کی حکمت عملی دستیاب ہے:مختلف تحقیقی اہداف اور جینوم کی تکمیل کے تقاضوں کے لیے۔
سروس کی وضاحتیں
| سروس | ترتیب کی حکمت عملی |
| ڈرافٹ جینوم | Illumina PE150 100x |
| 0 گیپ جینوم | Nanopore 100x + Illumina PE150 100x Or Pacbio HiFi 30x + Illumina PE150 100x (اختیاری) |
نمونہ کی ضروریات:
| ارتکاز (ng/µL) | کل رقم (µg) | حجم (µL) | OD260/280 | OD260/230 | |
| PacBio | ≥20 | ≥1.2 | ≥20 | 1.7-2.2 | ≥1.0 |
| نانوپور | ≥40 | ≥2 | ≥20 | 1.7-2.2 | 1.0-3.0 |
| Illumina | ≥1 | ≥0.06 | ≥20 | - | - |
بیکٹیریا: ≥3.5x1010 خلیات
سروس ورک فلو
نمونہ کی ترسیل
لائبریری کی تعمیر
ترتیب دینا
ڈیٹا کا تجزیہ
فروخت کے بعد کی خدمات
مندرجہ ذیل تجزیہ پر مشتمل ہے:
● ڈیٹا کوالٹی کنٹرول کو ترتیب دینا
● جینوم اسمبلی
● جینوم اجزاء کا تجزیہ: سی ڈی ایس اور متعدد جینومک عناصر کی پیشین گوئی
● متعدد عمومی ڈیٹا بیس (GO، KEGG، وغیرہ) اور جدید ڈیٹا بیس (CARD، VFDB، وغیرہ) کے ساتھ فنکشنل تشریح
● جینوم ویژولائزیشن
ہم جینوم کو آسانی سے قابل رسائی فاسٹا فارمیٹ اور جینوم تشریح فائل (gff) میں فراہم کرتے ہیں۔
جین تشریح - جاؤ
جین تشریح - CAZY کاربوہائیڈریٹ
جینوم ویژولائزیشن - سرکوس پلاٹ
BMKGene کی بیکٹیریل جینوم اسمبلی کی خدمات کے ذریعہ تیار کردہ اشاعتوں کے مجموعہ کے ذریعہ پیشرفت کو دریافت کریں۔
Dai, W. et al. (2023) 'صحت مند انسانی بڑی آنت سے السرٹیو کولائٹس کے علاج کے لیے ایک محفوظ اور نوول پروبائیوٹک بیکٹیریم کے طور پر بیکٹیرائیڈ یونیفارمس F18-22 کی دریافت'،بین الاقوامی جرنل آف مالیکیولر سائنسز، 24(19)، صفحہ۔ 14669. doi: 10.3390/IJMS241914669/S1۔
کانگ، کیو وغیرہ۔ (2021) 'ملٹی ڈرگ مزاحم پروٹیوس میرابیلیس چین میں جنگلی حیات سے blaOXA-1 اور blaNDM-1 کو الگ کرتا ہے: عوامی صحت کے خطرے میں اضافہ'،انٹیگریٹیو زولوجی، 16(6)، صفحہ 798-809۔ doi: 10.1111/1749-4877.12510۔
وانگ، ٹی ٹی وغیرہ۔ (2017) 'اینڈوفائٹ بیسیلس فلیکسس KLBMP 4941 کا مکمل جینوم تسلسل اس کے پودوں کی نشوونما کو فروغ دینے کے طریقہ کار اور نمک رواداری کے لیے جینیاتی بنیاد کو ظاہر کرتا ہے'،جرنل آف بائیوٹیکنالوجی، 260، صفحہ 38-41۔ doi: 10.1016/J.JBIOTEC.2017.09.001۔
وانگ، ایکس وغیرہ۔ (2021) 'Klebsiella کے ایک سے زیادہ ریپلیکون ریزسٹنس پلازمیڈز اینٹی مائکروبیل جینز کے وسیع پھیلاؤ میں ثالثی کرتے ہیں'،مائکرو بایولوجی میں فرنٹیئرز، 12، ص۔ 754931. doi: 10.3389/FMICB.2021.754931/BIBTEX۔
