امپلیکن ترتیب (16s/18s/اس کے)

ایمپلیکن (16s/18s/اس) ایلومینا کے ساتھ ترتیب دینا مائکروبیل تنوع کا تجزیہ کرنے کا ایک طریقہ ہے جس میں مائکروبیل پروفائلز کو ان کے سلسلے کے مطابق شناخت کیا جاسکتا ہے اور پھر ہر نمونے میں اور نمونوں کے مابین کمیونٹی کی فراوانی اور تنوع کو سمجھنے کی کوشش کی جاتی ہے۔ بی ایم کے کلاؤڈ ایمپلیکون (این جی ایس) پائپ لائن 16s ، 18s ، آئی ٹی اور ایک سے زیادہ فعال جینوں کے تجزیہ کی اجازت دیتی ہے۔ اس کا آغاز پڑھنے کی تراشنے ، جوڑی کے آخر میں پڑھنے والی اسمبلی اور معیار کی تشخیص سے ہوتا ہے ، اس کے بعد چھ مختلف تجزیہ حصوں میں استعمال ہونے والے آپریشنل ٹیکسونومک یونٹ (OTUs) پیدا کرنے کے لئے اسی طرح کے پڑھنے کا کلسٹرنگ ہوتا ہے۔ ٹیکسنومک تشریح ہر نمونے کی نسبتا abund کثرت اور تشکیل کے بارے میں معلومات فراہم کرتی ہے ، جبکہ الفا اور بیٹا تنوع کا تجزیہ کرتے ہیں کہ نمونے کے اندر اور اس کے درمیان مائکروبیل تنوع پر بالترتیب توجہ دی جاتی ہے۔ گروپوں کے مابین مختلف تجزیہ OTUs تلاش کرتا ہے جو پیرامیٹرک اور غیر پیرامیٹرک ٹیسٹ دونوں کا استعمال کرتے ہوئے مختلف ہوتا ہے ، جبکہ ارتباط تجزیہ ان اختلافات کو ماحولیاتی عوامل سے منسلک کرتا ہے۔ آخر میں ، عملی جین کی کثرت کی پیش گوئی مارکر جین کی کثرت کی بنیاد پر کی جاتی ہے ، جو ہر نمونے میں فنکشن اور ماحولیات کی بصیرت فراہم کرتی ہے ..