● تسلسل کا پلیٹ فارم: پیکبیو ریویو
● ترتیب وضع: سی سی ایس (HIFI پڑھتا ہے)
hifi ہدف خطے کی وسعت کے بعد Hifi SMRT بیل لائبریری کی تیاری سے پہلے امپیلیکنز کا ٹینڈم لنک کرنا
●اعلی درجہ بندی کی قرارداد: ٹیہان شارٹ ایمپلیکن تسلسل,پرجاتیوں کی سطح پر او ٹی یو کی درجہ بندی کی اعلی شرح کو چالو کرنا۔
●انتہائی درست بیس کالنگ: پی اے سی بی آئی او سی سی ایس موڈ سیکوینسنگ (HIFI پڑھتا ہے)۔
●تنہائی سے پاک: ماحولیاتی نمونوں میں مائکروبیل ساخت کی تیزی سے شناخت۔
●وسیع پیمانے پر قابل اطلاق: متنوع مائکروبیل کمیونٹی اسٹڈیز۔
●جامع بائیو انفارمیٹک تجزیہ: ڈیٹا بیس ، تشریح ، OTU/ASV کے لحاظ سے متنوع تجزیوں کے ساتھ تازہ ترین QIIME2 پیکیج (مائکروبیل ایکولوجی میں مقداری بصیرت)۔
●وسیع مہارت: سالانہ ہزاروں امپلیکون تسلسل کے منصوبوں کے ساتھ ، بی ایم کیجن ایک دہائی کے تجربے ، ایک انتہائی ہنر مند تجزیہ ٹیم ، جامع مواد ، اور فروخت کے بعد کے بہترین معاونت لاتا ہے۔
لائبریری | ترتیب کی حکمت عملی | ڈیٹا کی سفارش کی گئی ہے |
امپلیکن | Pacbio Revio | 10/30/50 K ٹیگز (سی سی ایس) |
حراستی (NG/µL) | کل رقم (µg) | حجم (µl) |
≥5 | .30.3 | ≥20 |
مائع نائٹروجن میں نمونے 3-4 گھنٹوں کے لئے منجمد کریں اور مائع نائٹروجن یا -80 ڈگری میں طویل مدتی ریزرویشن میں اسٹور کریں۔ خشک برف کے ساتھ نمونہ شپنگ کی ضرورت ہے۔
مندرجہ ذیل تجزیہ پر مشتمل ہے:
● خام ڈیٹا کوالٹی کنٹرول
● OTU کلسٹرنگ/De-noise (ASV)
● OTU تشریح
● الفا تنوع کا تجزیہ: ایک سے زیادہ اشاریہ ، بشمول شینن ، سمپسن اور اککا۔
● بیٹا تنوع کا تجزیہ
● بین گروپ تجزیہ
releal ارتباطی تجزیہ: ماحولیاتی عوامل اور ساخت اور تنوع کے درمیان
● 16S فنکشنل جین کی پیشن گوئی
ٹیکسونومک تقسیم کا ہسٹگرام
کمیونٹی کی تقسیم فائیلوجنیٹک درخت
الفا تنوع کا تجزیہ: اککا
بیٹا تنوع کا تجزیہ: پی سی او اے
انٹرگروپ تجزیہ: انووا
اشاعتوں کے ایک مجموعہ ذخیرے کے ذریعہ پی اے بی آئی او کے ساتھ بی ایم کے جیین کی امپلیکون سیکوینسیٹنگ خدمات کے ذریعہ سہولیات کی سہولت فراہم کریں۔
جی اے او ، ایکس اور وانگ ، ایچ (2023) 'الپائن میرینو بھیڑوں میں مختلف فینولوجی (ریپرین بمقابلہ گھاس) کے مطابق رومن بیکٹیریل پروفائلز اور افعال کا تقابلی تجزیہ الپائن گھاس کا میدان میں دو بڑھتے ہوئے مراحل کے ساتھ' ، ابال ، 9 ( 1) ، پی۔ 16. doi: 10.3390/خمیر 9010016/s1.
لی ، ایس وغیرہ۔ . doi: 10.1038/S41522-023-00439-8۔
MU ، L. ET رحمہ اللہ تعالی. (2022) 'الفالفا ، چاول کے تنکے اور گندم کی چوکر کے ساتھ تیار کردہ مخلوط سایلیج کی ابال کی خصوصیات ، بیکٹیریل تنوع اور ایروبک استحکام پر فیٹی ایسڈ نمکیات کے اثرات ، جرنل آف فوڈ اینڈ ایگریکلچر کا جرنل ، 102 (4) ، پی پی 1475– 1475– 1475– 1487۔ doi: 10.1002/jsfa.11482.
یانگ ، جے۔ وغیرہ۔ (2023) 'سونچس بریچیوٹس ڈی سی سے نچوڑ کے اینٹی آکسیڈینٹ اثرات میں آکسیڈیٹیو تناؤ بائیو مارکر اور گٹ مائکرو بائیوٹا کے مابین تعامل۔ آکسازولون کی حوصلہ افزائی آنتوں میں آکسیڈیٹیو تناؤ میں بالغ زیبرا فش '، اینٹی آکسیڈینٹس 2023 ، جلد۔ 12 ، صفحہ 192 ، 12 (1) ، صفحہ۔ 192. doi: 10.3390/antiox12010192.