10x جینومکس ویزیم مقامی ٹرانسکرپٹوم
تکنیکی اسکیم
خصوصیات
● قرارداد: 100 µm
● اسپاٹ قطر: 55 µm
sps دھبوں کی تعداد: 4992
● گرفتاری کا علاقہ: 6.5 x 6.5 ملی میٹر
● ہر بارکوڈڈ اسپاٹ 4 سیکشنوں پر مشتمل پرائمر سے بھری ہوئی ہے:
- ایم آر این اے پرائمنگ اور سی ڈی این اے ترکیب کے لئے پولی (ڈی ٹی) دم
- عمومی تعصب کو درست کرنے کے لئے انوکھا سالماتی شناخت کنندہ (UMI)
- مقامی بارکوڈ
- جزوی پڑھیں 1 ترتیب پرائمر کا پابند تسلسل
sections حصوں کا H&E داغ
فوائد
●ایک اسٹاپ سروس: تمام تجربے اور مہارت پر مبنی اقدامات کو مربوط کرتا ہے ، بشمول کریو سیکشننگ ، داغدار ، ٹشو کی اصلاح ، مقامی بارکوڈنگ ، لائبریری کی تیاری ، ترتیب اور بائیو انفارمیٹکس۔
● انتہائی ہنر مند تکنیکی ٹیم: 250 سے زیادہ ٹشو اقسام اور 100+ پرجاتیوں میں تجربے کے ساتھ بشمول انسانی ، ماؤس ، ستنداری ، مچھلی اور پودوں۔
●پورے پروجیکٹ پر ریئل ٹائم اپ ڈیٹ: تجرباتی پیشرفت کے مکمل کنٹرول کے ساتھ۔
●جامع معیاری بائیو انفارمیٹکس:پیکیج میں 29 تجزیے اور 100+ اعلی معیار کے اعداد و شمار شامل ہیں۔
●اپنی مرضی کے مطابق ڈیٹا تجزیہ اور تصور: تحقیق کی مختلف درخواستوں کے لئے دستیاب ہے۔
●سنگل سیل ایم آر این اے تسلسل کے ساتھ اختیاری مشترکہ تجزیہ
وضاحتیں
| نمونہ کی ضروریات | لائبریری | ترتیب کی حکمت عملی | ڈیٹا کی سفارش کی گئی ہے | کوالٹی کنٹرول |
| اکتوبر سے منسلک کریو نمونے (زیادہ سے زیادہ قطر: تقریبا 6x6x6 ملی میٹر) فی نمونہ 2 بلاکس | 10x ویزیم سی ڈی این اے لائبریری | ایلومینا PE150 | 50K PE فی جگہ پڑھتا ہے (60 جی بی) | rin> 7 |
نمونہ کی تیاری کی رہنمائی اور خدمت کے ورک فلو کے بارے میں مزید تفصیلات کے لئے ، براہ کرم بلا جھجھک a سے بات کریںbmkgene ماہر
سروس ورک فلو
نمونے کی تیاری کے مرحلے میں ، ایک ابتدائی بلک آر این اے نکالنے کا مقدمہ چلایا جاتا ہے تاکہ یہ یقینی بنایا جاسکے کہ اعلی معیار کا آر این اے حاصل کیا جاسکتا ہے۔ ٹشو کی اصلاح کے مرحلے میں حصوں کو داغ اور تصور کیا جاتا ہے اور ٹشو سے ایم آر این اے کی رہائی کے ل per پیریمیبلائزیشن کی شرائط کو بہتر بنایا جاتا ہے۔ اس کے بعد لائبریری کی تعمیر کے دوران بہتر پروٹوکول کا اطلاق ہوتا ہے ، اس کے بعد ترتیب اور ڈیٹا تجزیہ ہوتا ہے۔
مکمل خدمت کے ورک فلو میں حقیقی وقت کی تازہ کاریوں اور کلائنٹ کی تصدیق شامل ہوتی ہے تاکہ وہ ایک جوابی تاثرات لوپ کو برقرار رکھ سکے ، جس سے ہموار منصوبے پر عمل درآمد کو یقینی بنایا جاسکے۔
مندرجہ ذیل تجزیہ پر مشتمل ہے:
ڈیٹا کوالٹی کنٹرول:
o ڈیٹا آؤٹ پٹ اور کوالٹی اسکور کی تقسیم
o جین کا پتہ لگانا فی جگہ
o ٹشو کوریج
اندرونی نمونہ تجزیہ:
اے جین کی دولت
o اسپاٹ کلسٹرنگ ، بشمول کم طول و عرض تجزیہ
o کلسٹرز کے مابین مختلف اظہار تجزیہ: مارکر جینوں کی شناخت
o مارکر جینوں کی فنکشنل تشریح اور افزودگی
بین گروپ تجزیہ
o دونوں نمونوں (جیسے بیمار اور کنٹرول) اور دوبارہ کلسٹر سے جگہوں کا دوبارہ امتزاج
o ہر کلسٹر کے لئے مارکر جینوں کی شناخت
o مارکر جینوں کی فنکشنل تشریح اور افزودگی
o گروپوں کے مابین ایک ہی کلسٹر کا مختلف اظہار
اندرونی نمونہ تجزیہ
اسپاٹ کلسٹرنگ
مارکر جینوں کی شناخت اور مقامی تقسیم
بین گروپ تجزیہ
دونوں گروپوں اور دوبارہ کلسٹر سے ڈیٹا کا مجموعہ
نئے کلسٹرز کے مارکر جین
ان نمایاں اشاعتوں میں 10x ویزیم کے ذریعہ BMKGene کی مقامی ٹرانسکرومکس سروس کے ذریعہ سہولت فراہم کردہ پیشرفتوں کو دریافت کریں:
چن ، ڈی وغیرہ۔ .ریاستہائے متحدہ امریکہ کی نیشنل اکیڈمی آف سائنسز کی کارروائی، 120 (30) ، صفحہ۔ E2303462120۔ doi: /10.1073/pnas.2303462120
چن ، Y. ET رحمہ اللہ تعالی. (2023) 'اسٹیل اسپیٹیوٹیمپورل ٹرانسکرومیٹک ڈیٹا کی اعلی ریزولوشن کی وضاحت کو قابل بناتا ہے' ،بائیو انفارمیٹکس میں بریفنگ، 24 (2) ، پی پی 1-10۔ doi: 10.1093/BIB/BBAD068۔
لیو ، سی وغیرہ۔ (2022) 'آرکڈ پھولوں کی نشوونما میں آرگوجینیسیس کا ایک اسپیٹیوٹیمپلل اٹلس' ،نیوکلیک ایسڈ کی تحقیق، 50 (17) ، پی پی 9724–9737۔ doi: 10.1093/NAR/GKAC773۔
وانگ ، جے۔ وغیرہ۔ (2023) 'مقامی ٹرانسکرومکس اور سنگل نیوکلیس آر این اے کی ترتیب کو مربوط کرنا یوٹیرن لیومیوما کے لئے ممکنہ علاج معالجے کی حکمت عملیوں کو ظاہر کرتا ہے' ،حیاتیاتی علوم کا بین الاقوامی جریدہ، 19 (8) ، پی پی 2515–2530۔ doi: 10.7150/IJBS.83510۔
