Ящик теплової карти використовується для креслення теплової карти, яка може фільтрувати, нормалізувати та кластерні дані.
Прикріплення біологічних функцій до послідовностей у файлі fasta шляхом вирівнювання послідовностей до бази даних, включаючи NR, KEGG, COG, SWISSPROT, TEMBL, KOG, PFAM.
Вибух (основний інструмент пошуку локального вирівнювання) - це алгоритм та програма для пошуку регіонів з подібними біологічними послідовностями. Він порівнює ці послідовності з базами даних послідовності та обчислює статистичну значимість. Вибух складається з чотирьох типів інструментів на основі типу послідовності: BLASTN, LASTP, BLASTX та TBLASTN.