-
BMKMANU S3000_Просторовий транскриптом
Просторова транскриптоміка стоїть на передньому краї наукових інновацій, надаючи дослідникам можливість досліджувати складні моделі експресії генів у тканинах, зберігаючи їх просторовий контекст. Серед різних платформ компанія BMKGene розробила чіп просторової транскрипції BMKManu S3000, який може похвалитися покращеною роздільною здатністю 3,5 мкм, охоплюючи субклітинний діапазон і забезпечуючи багаторівневі налаштування роздільної здатності. Чіп S3000, що містить приблизно 4 мільйони точок, використовує мікролунки, шаровані кульками, завантаженими зондами захоплення з просторовим штрих-кодом. Бібліотека кДНК, збагачена просторовими штрих-кодами, готується з чіпа S3000 і згодом секвенується на платформі Illumina NovaSeq. Поєднання зразків із просторовим штрих-кодом та UMI забезпечує точність і точність згенерованих даних. Чіп BMKManu S3000 є надзвичайно універсальним, пропонуючи багаторівневі налаштування роздільної здатності, які можна точно налаштувати для різних тканин і бажаного рівня деталізації. Ця адаптивність позиціонує чіп як видатний вибір для різноманітних досліджень просторової транскриптоміки, забезпечуючи точне просторове кластеризування з мінімальним шумом. Використання технології сегментації клітин із BMKManu S3000 дозволяє розмежовувати транскрипційні дані до меж клітин, що призводить до аналізу, який має пряме біологічне значення. Крім того, покращена роздільна здатність S3000 призводить до більшої кількості генів і UMI, виявлених на клітину, що дає змогу набагато точніше аналізувати моделі просторової транскрипції та кластеризацію клітин.
-
Готові бібліотеки DNBSEQ
DNBSEQ, розроблена MGI, є інноваційною технологією NGS, яка змогла ще більше знизити витрати на секвенування та збільшити пропускну здатність. Підготовка бібліотек DNBSEQ включає фрагментацію ДНК, підготовку оцДНК та ампліфікацію обертового кола для отримання нанокульок ДНК (DNB). Потім їх завантажують на тверду поверхню, а потім секвенують за допомогою комбінаторного синтезу зонда-якоря (cPAS). Технологія DNBSEQ поєднує в собі переваги низької частоти помилок посилення з використанням шаблонів помилок високої щільності з нанокульками, що забезпечує секвенування з вищою пропускною здатністю та точністю.
Наша готова служба секвенування бібліотек дає змогу клієнтам готувати бібліотеки секвенування Illumina з різних джерел (мРНК, повний геном, амплікон, бібліотеки 10x тощо), які перетворюються на бібліотеки MGI у наших лабораторіях для секвенування в DNBSEQ-T7, що дозволяє великі обсяги даних за менші витрати.
-
Взаємодія хроматину на основі Hi-C
Hi-C — це метод, розроблений для визначення геномної конфігурації шляхом поєднання взаємодії на основі зондування на основі близькості та високопродуктивного секвенування. Метод заснований на зшиванні хроматину формальдегідом з подальшим перетравленням і повторним лігуванням таким чином, що лише фрагменти, які ковалентно зв’язані, утворюють продукти лігування. Шляхом секвенування цих продуктів лігування можна вивчати тривимірну організацію геному. Hi-C дає змогу вивчати розподіл частин геному, які мають слабку упаковку (компартменти А, еухроматин) і, швидше за все, будуть транскрипційно активними, а також регіони, які упаковані щільніше (компартменти В, гетерохроматин). Hi-C також можна використовувати для точного визначення топологічно асоційованих доменів (TAD), ділянок геному, які мають складчасті структури та, ймовірно, мають схожі патерни експресії, а також для ідентифікації петель хроматину, ділянок ДНК, які з’єднані разом білками та які часто збагачений регулятивними елементами. Сервіс Hi-C секвенування BMKGene дає дослідникам можливість досліджувати просторові виміри геноміки, відкриваючи нові шляхи для розуміння регуляції генома та її наслідків для здоров’я та хвороб.
-
TGuide Smart Magnetic Plant RNA Kit
TGuide Smart Magnetic Plant RNA Kit
Очистіть високоякісну загальну РНК із рослинних тканин
-
TGuide Smart Blood/Cell/Tissue RNA Kit
TGuide Smart Blood/Cell/Tissue RNA Kit
Попередньо заповнений картридж/планшетний набір реагентів для очищення високопродуктивної, високочистої, високоякісної загальної РНК без інгібіторів із тканин/клітин/свіжої цільної крові тварин
-
Розумний магнітний набір ДНК рослин TGuide
Розумний магнітний набір ДНК рослин TGuide
Очистіть високоякісну геномну ДНК з різних рослинних тканин
-
TGuide Smart Soil/Stool DNA Kit
TGuide Smart Soil/Stool DNA Kit
Очищає вільну від інгібіторів ДНК високої чистоти та якості із зразків ґрунту та калу
-
Набір для очищення ДНК TGuide Smart
Відновлює високоякісну ДНК з продукту ПЛР або агарозних гелів.
-
TGuide Smart Blood Genomic DNA Kit
TGuide Smart Blood Genomic DNA Kit
Попередньо заповнений картридж/набір реагентів для планшетів для очищення геномної ДНК із крові та лейкоцитів
-
TGuide Smart Magnetic Tissue DNA Kit
Попередньо заповнений картридж/набір реагентів для екстракції геномної ДНК із тканин тварин
-
TGuide Smart Universal DNA Kit
Попередньо заповнений картридж/планшетний набір реагентів для очищення геномної ДНК із крові, сухої плями крові, бактерій, клітин, слини, мазків із порожнини рота, тканин тварин тощо.
-
Екстрактор нуклеїнових кислот TGuide S16
Екстрактор нуклеїнових кислот TGuide S16
Простий у використанні настільний інструмент, 1-8 або 16 зразків одночасно
Каталожний номер/упаковка
кішка немає
ID
№ преп
OSE-S16-AM
1 комплект
-
Розчин мРНК повної довжини PacBio 2+3
Хоча секвенування мРНК на основі NGS є універсальним інструментом для кількісної оцінки експресії генів, його залежність від коротких зчитувань обмежує його ефективність у складних транскриптомних аналізах. З іншого боку, секвенування PacBio (Iso-Seq) використовує технологію тривалого зчитування, що дозволяє секвенувати повнорозмірні транскрипти мРНК. Цей підхід сприяє всебічному дослідженню альтернативного сплайсингу, злиття генів і поліаденілування, хоча він не є основним вибором для кількісного визначення експресії генів. Комбінація 2+3 заповнює розрив між Illumina та PacBio, покладаючись на зчитування PacBio HiFi для ідентифікації повного набору ізоформ транскрипту та секвенування NGS для кількісного визначення ідентичних ізоформ.
Платформи: PacBio Sequel II/ PacBio Revio та Illumina NovaSeq;
