мРНК-seq (ngs) з еталонним геном
RNA-SEQ-це стандартний інструмент у житті та наук про посіви, що подорожують зазор між геномами та протеомом. Його сила полягає у виявленні нових стенограм та кількісному визначенні їх виразу в одному аналізі. Він широко використовується для порівняльних транскриптомічних досліджень, проливання світла на гени, пов'язані з різними ознаками або фенотипами, як, наприклад, порівнювати мутанти з дикими типами або виявленням експресії генів у конкретних умовах. APP BMKCLOUD (Довідка) APP інтегрує кількісне визначення експресії, диференціальний аналіз експресії (DEG) та аналіз структури послідовностей у трубопровід біоінформатики мРНК-Seq (NGS) та об'єднує сильні сторони подібного програмного забезпечення, забезпечуючи зручність та зручність користувача. Користувачі можуть завантажувати свої дані RNA-seq у хмару, де додаток пропонує всебічне, єдине місце біоінформатичного аналізу. Крім того, він надає пріоритет досвіду клієнтів, пропонуючи персоналізовані операції, пристосовані до конкретних потреб користувачів. Користувачі можуть встановлювати параметри та подавати трубопровідну місію самостійно, перевіряти інтерактивний звіт, переглядати дані/діаграми та повне видобуток даних, такі як: вибір цільових генів, функціональна кластеризація, схема тощо.
Платформа:Illumina, MGI
Стратегія:РНК
Макет: Парні, чисті дані.
Тип бібліотеки:fr-unstrand, fr-firststrand або fr-secondstrand
Довжина читання:150 bp
Тип файлу:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz або *.fq.gz. Система будеавтоматично з’єднати файли .fastq відповідно до імен файлів,наприклад *_1.fastQ в парі з *._ 2.fastQ.
Кількість зразків:Немає обмежень на числозразків, але час аналізу збільшиться як кількістьЗразки зростають.
Рекомендована кількість даних:6 г за зразок