-
Останні успішні випадки нанопорового РНК-секвенування за допомогою технологій біомаркерів
Секвенування повної довжини транскриптомів на основі нанопор. Секвенування нанопорами відрізняється від інших платформ секвенування тим, що нуклеотиди зчитуються безпосередньо без синтезу ДНК і генерують довгі зчитування з десятками килобаз. Це дає можливість прямого ре...Читати далі -
Застосування повнорозмірного секвенування ампліконів у дослідженнях мікробного різноманіття
МІКРОБНА ЕКОЛОГІЯ Інтенсифікація сільського господарства зменшує складність мікробної мережі та велику кількість ключових таксонів у коренях. Повнорозмірне секвенування ампліконів (ІТ...Читати далі -
Дослідження мікробіомної спільноти та функції в ґрунті, обробленому іммобілізованими бактеріями, шляхом повнорозмірного секвенування 16S
МІКРОБІАЛЬНА Бактеріальна сумісність та іммобілізація за допомогою біовугілля покращила деградацію тебуконазолу, склад мікробіома ґрунту та функціонування Повнорозмірне секвенування ампліконів 16S | PacBio HiFi | Альфа-різноманіття | Бета ди...Читати далі -
Ефективність довгих зчитувань нанопор у метагеномних дослідженнях
МЕТАГЕНОМІКА Повні закриті бактеріальні геноми з мікробіомів за допомогою секвенування нанопор Секвенування нанопор | Метагеноміка | MAGs | Циркуляризація геному бактерій | Мікробіота кишечника...Читати далі -
Застосування повторного секвенування Nanopore для боротьби з хворобами
ГЕНОМІКА ЛЮДИНИ природа генетика Довгозчитуване секвенування ідентифікує розширення повторів GGC у NOTCH2NLC, пов’язане з хворобою нейронального внутрішньоядерного включення Повторне секвенування ONT | Illumina | Секвенування всього екзому | Цільова послідовність CRISPR-Cas9 ONT...Читати далі -
Застосування повторного секвенування на основі нанопор для ідентифікації генетичних варіантів COVID19
РЕЗЕКВЕНЦІЯ ПОВНОГО ГЕНОМА Геномний моніторинг SARS-CoV-2 виявив варіант делеції Nsp1, який модулює відповідь на інтерферон I типу Nanopore | Illumina | Повторне секвенування геному | метагеноміка | RNA-Seq | Sanger Bioma...Читати далі -
Варіанти будови китайської популяції та їх вплив на фенотипи, хвороби та адаптацію населення
РЕСЕКВЕНЦІЯ ПОВНОГО ГЕНОМА Варіанти структури в популяції Китаю та їх вплив на фенотипи, хвороби та адаптацію популяції Nanopore | PacBio | Повторне секвенування геному | Виклик структурних варіацій у цьому с...Читати далі -
Чотири теломерно-теломерні зібрані геноми тварин і рослин
ЗБІРКА ГЕНОМА T2T, ГЕНОМ БЕЗ ПРОБИВ 1-й два геноми рису1 Назва: Збірка та перевірка двох еталонних геномів без прогалин для рису Сіань/індика розкриває розуміння архітектури центромери рослин Doi: https://doi.org/10.1101/2020.12.24.424073 Повідомлення ...Читати далі -
Послідовності геному виявляють глобальні шляхи поширення та припускають конвергентні генетичні адаптації в еволюції морського коника
ЕВОЛЮЦІЯ ГЕНОМА природа КОМУНІКАЦІЇ Послідовності геному виявляють глобальні шляхи поширення та пропонують конвергентні генетичні адаптації в еволюції морського коника PacBio | Illumina | Привіт-C | WGS | Генетичне різноманіття | Демографічна історія | Gene Flow Th...Читати далі -
Високоякісна збірка геному висвітлює геномні характеристики жита та агрономічно важливі гени
ЕВОЛЮЦІЯ ГЕНОМА природа генетика Високоякісний збір генома підкреслює геномні характеристики жита та агрономічно важливі гени PacBio | Illumina | Оптична карта Bionano | Збірка геному Hi-C | Генетична карта | Вибіркові розгортки | РНК...Читати далі -
Складання хромосомного масштабу та аналіз геному біомаси культур Miscanthus lutarioriparius
ГЕНОМ Складання в хромосомному масштабі та аналіз геному біомаси культур Miscanthus lutarioriparius Секвенування нанопор | Illumina | Привіт-C | РНК-секвенування | Філогенез У цьому дослідженні Biomarker Techno...Читати далі -
Геном Nautilus pompilius висвітлює еволюцію очей і біомінералізацію
ЕВОЛЮЦІЯ ГЕНОМА Геном Nautilus pompilius висвітлює еволюцію ока та біомінералізацію. Секвенування PacBio | Illumina | Філогенетичний аналіз | Секвенування РНК | SEM | Протеоміка ...Читати далі -
Порівняльний аналіз геному висвітлює опосередковане транспозоном розширення геному та еволюційну архітектуру тривимірного геномного згортання бавовни
ЕВОЛЮЦІЯ ГЕНОМА Порівняльний аналіз геному висвітлює опосередковане транспозоном розширення геному та еволюційну архітектуру тривимірного згортання генома в секвенуванні нанопор бавовни | Привіт-C | PacBio ...Читати далі