Складні та змінні альтернативні ізоформи в організмах є важливими генетичними механізмами регулювання експресії генів та різноманітності білка. Точна ідентифікація транскрипційних структур є основою для поглибленого вивчення моделей регуляції експресії генів. Платформа Nanopore Sequencing успішно принесла транскриптомічне дослідження на рівень ізоформи. Ця платформа аналізу розроблена для аналізу даних RNA-SEQ, що генеруються на платформі нанопору на основі еталонного геному, яка досягає якісних та кількісних аналізів як на рівні генів, так і на рівні стенограмів.