mRNA-seq (NGS) – De novo

Секвенування мРНК дозволяє профілювати всі транскрипти мРНК у клітинах за певних умов і є широко використовуваною технологією в різних областях досліджень. Конвеєр BMKCloud De novo mRNA-seq призначений для аналізу бібліотек секвенування, збагачених полі-А, коли відсутній еталонний геном. Конвеєр починається з контролю якості, а потімde novoскладання стенограми та вибір набору unigene. Аналіз одногенної структури передбачає кодуючу послідовність (CDS) і прості повтори послідовності (SSR). Згодом аналіз диференціальної експресії знаходить гени з диференціальною експресією (DEG) серед перевірених умов, а потім функціональну анотацію та збагачення DEG для отримання біологічних ідей.