Метагеноміка (NGS)

Метагеноміка рушниці з Illumina є популярним інструментом для вивчення мікробіоом шляхом безпосереднього послідовності ДНК зі складних зразків, що дозволяє вивчити як таксономічне, так і функціональне різноманіття. Метагеномний (NGS) BMKCloud (NGS) починається з контролю якості та метагенома, з якого прогнозуються гени та кластеризуються в не надмірні набори даних, які анотуються для функції та систематики, використовуючи кілька баз даних. Ця інформація використовується для аналізу всередині вибірки таксономічного різноманіття (різноманітність альфа) та різноманітності між вибіркою (різноманітність бета). Диференціальний аналіз між групами виявляє ОТУ та біологічні функції, які відрізняються між двома групами, використовуючи як параметричні, так і непараметричні тести, тоді як кореляційний аналіз стосується цих відмінностей з факторами навколишнього середовища.