lncrna

Довгі некодуючі РНК (LNCRNA) є РНК довше 200 нуклеотидів з низьким потенціалом кодування, але з критичними регуляторними функціями. Трубопровід BMKCloud LNCRNA призначений для аналізу бібліотек, що виснажується RRNA, з високоякісною, добре анотованою референтною геном, аналізуючи експресію LNCRNA та мРНК разом. Після прочитання обрізки та контролю якості читання вирівнюються до референтного геному до складання транскриптів, а подальший аналіз структури генів виявляє альтернативні сплайсингу та нові гени. Стенограми ідентифікуються як мРНК або LNCRNA, а диференціальний аналіз експресії ідентифікує диференційно експресовані LNCRNA, їх цілі та диференційно експресовані гени (DEG). Обидва DEG, і диференційно експресовані цілі LNCRNA функціонально анотуються, щоб знайти збагачені функціональні категорії.