Загальногеномне дослідження асоціацій (GWAS) спрямоване на виявлення генетичних варіантів (генотипу), які асоціюються з певними ознаками (фенотипом). Дослідження GWA досліджують генетичні маркери, що перетинають весь геном великої кількості індивідуумів, і передбачають асоціації генотип-фенотип шляхом статистичного аналізу на рівні популяції. Ресеквенування повного генома потенційно може виявити всі генетичні варіанти. У поєднанні з фенотиповими даними GWAS можна обробити для ідентифікації пов’язаних з фенотипом SNPs, QTL та генів-кандидатів, що суттєво підтримує сучасне розведення тварин/рослин. SLAF — це власно розроблена спрощена стратегія секвенування генома, яка виявляє маркери, розподілені по всьому геному, SNP. Ці SNP, як молекулярно-генетичні маркери, можуть бути оброблені для досліджень асоціації з цільовими ознаками. Це економічно ефективна стратегія виявлення складних ознак, пов’язаних із генетичними варіаціями.
