Аналіз еукаріотичної мРНК (доступні варіанти на основі та довіднику)
Цей трубопровід використовує дані NGS RNA-Seq як вхідні та дає результати декількох аналізів нижче за течією, включаючи, але не обмежуючись ними: послідовність оцінки якості даних,de novoАнотація сайту транскрипції, аналіз змінного сплайсингу, диференціальний аналіз експресії, анотація функцій та аналіз збагачення.
Довгий некодуючий РНК-аналіз
Довгі некодуючі РНК (LNCRNA)-це некодуючі стенограми з довжиною довше 200 нт і, як відомо, відіграють ролі в організації та регуляції хроматину. Технології та біоінформативні технології високої пропускної здатності наділимо наше розуміння послідовностей LNCRNA та позиціонування інформації для виявлення LNCRNA з вирішальними регуляторними функціями. Цей трубопровід забезпечує аналіз LNCRNA на додаток до аналізів, згаданих в трубопроводі аналізу еукаріотичної мРНК.
16S/18S/його послідовність амплікону
Конвеєр аналізу мікробних різноманіття амплікону був розроблений на основі багаторічного досвіду аналізу проектів мікробних різноманіття. Трубопровід містить стандартизований базовий аналіз, який охоплює вміст аналізу основних мікробних досліджень та персоналізованого аналізу. Звіт про аналіз є багатим та всебічним, з можливістю проведення різноманітного персонального аналізу. Крім того, зразки та групи можуть бути модифіковані на льоту для додаткового налаштування та контролю.
Аналіз метагеноміки рушниці
У трубопроводі метагеномічного аналізу рушниці використовуються дані NGS із змішаних геномних матеріалів, витягнутих із зразків навколишнього середовища. Включені аналізи надають детальну інформацію про різноманітність та чисельність видів, структуру популяції, філогенетичні залежності, функціональні гени та кореляційні мережі з факторами навколишнього середовища.
Варіантний аналіз NGS-WGS
Варіантний аналіз NGS-WGS-це інтегрований конвеєр виявлення варіанту, який виконує контроль якості даних, вирівнювання послідовностей, анотацію та аналіз мутацій генів. Трубопровід слідкує за найкращими практиками GATK для виявлення SNP та Indel і використовує ману для заклику конструкційного варіанту.
Дослідження асоціації широкого геному (GWAS)
Трубопровід GWAS - це аналіз нижче за течією, який приймає раніше генеровані файли VCF та відповідні дані фенотипу для когорти осіб як введення. Використовуючи конкретні статистичні методології, GWAS спрямований на розкриття змін нуклеотидів, пов'язаних з геномами, корельованими з фенотипічними відмінностями. Він відіграє вирішальну роль у дослідженні функціональних генів, пов'язаних зі складними захворюваннями людини, та хитромудрими ознаками рослин і тварин.
Аналіз сегрегації сегрегації (BSA)
Аналіз BSA передбачає об'єднання людей з екстремальними фенотипічними ознаками від сегрегуючого населення. Порівнюючи диференціальні локуси між об'єднаними зразками, цей підхід швидко ідентифікує тісно пов'язані молекулярні маркери, пов'язані з генами -мішенями. Широко використовується при генетичному картографуванні рослин і тварин, це цінний інструмент для розведення, що підтримує маркер.
Аналіз еволюційної генетики
Еволюційний генетичний аналіз робочого процесу використовує широкий досвід BMKGENE в проектах генетичної еволюції та включає філогенетичну побудову дерев, аналіз нерівноваги зв'язку, оцінку генетичного різноманіття, селективну ідентифікацію розгортання, аналіз споріднення, аналіз основних компонентів та характеристику структури популяції.
