Еукаріотичні мРНК-послідовності-NGS
Особливості
● Захоплення полі мРНК до підготовки бібліотеки
● Необов’язкова підготовка бібліотеки мРНК, що дозволяє отримати дані, що стосуються специфічної ланцюга
● Біоінформатичний аналіз експресії генів та структури стенограми
Переваги
●Широка експертиза: Наша команда обробляла понад 600 000 зразків на BMKGENE, що охоплює різноманітні типи зразків, такі як клітинні культури, тканини та рідини для тіла. Ми пропонуємо багатий досвід у кожному проекті та успішно завершили понад 100 000 проектів мРНК-Seq у різних дослідницьких областях.
●Суворий контроль якості: Ми впроваджуємо основні контрольні точки на всіх етапах, від вибірки та підготовки бібліотеки до послідовності та біоінформатики. Цей ретельний моніторинг забезпечує надання постійно якісних результатів, запевняючи вас, що ваш проект знаходиться в надійних руках.
●Комплексна анотація: Ми використовуємо кілька баз даних для функціонального анотації диференційно експресованих генів (DEG) та проведення відповідних аналізів збагачення. Цей всебічний підхід дає уявлення про клітинні та молекулярні процеси, що лежать в основі реакції транскрипту, гарантуючи, що ви повністю поінформовані про результати проекту.
●Підтримка після продажу: Наше зобов’язання виходить за рамки завершення проекту з 3-місячним післяпродажним періодом. За цей час ми пропонуємо подальше спостереження за проектами, допомогу у вирішенні несправностей та сесії запитань та запитань для вирішення будь-яких запитів, пов'язаних з результатами.
Зразки вимог та доставки
| Бібліотека | Стратегія послідовності | Рекомендовані дані | Контроль якості |
| Полі збагачений | Illumina pe150 DNBSEQ-T7 | 6 -10 Гб | Q30≥85% |
Вимоги до вибірки:
Нуклеотиди:
| Конц. (Ng/мкл) | Кількість (мкг) | Чистота | Цілісність | |
| Стандартна бібліотека | ≥ 10 | ≥ 0,2 | OD260/280 = 1,7-2,5 OD260/230 = 0,5-2,5 Обмежене або відсутність білка або забруднення ДНК, показаного на гелі. | Для рослин: rin≥4,0; Для тварин: rin≥4,5; 5,0≥28S/18S≥1,0; обмежена або відсутність базової висоти |
| Спрямована бібліотека | ≥ 10 | ≥ 0,2 | OD260/280 = 1,7-2,5 OD260/230 = 0,5-2,5 Обмежене або відсутність білка або забруднення ДНК, показаного на гелі. | Для рослин: rin≥4,0; Для тварин: rin≥4,5; 5,0≥28S/18S≥1,0; обмежена або відсутність базової висоти |
● Рослини:
Корінь, стебло або пелюстка: 450 мг
Лист або насіння: 300 мг
Плід: 1,2 г
●Тварина:
Серце чи кишечник: 300 мг
Вісцера або мозок: 240 мг
М'яз: 450 мг
Кістки, волосся або шкіра: 1г
● членистоноги:
Комахи: 6G
Раковина: 300 мг
● Цільна кров: 1 трубка
● Клітини: 106 клітини
Рекомендована доставка зразків
Контейнер: 2 мл центрифугової трубки (олов'яна фольга не рекомендується)
Маркування зразків: група+повторення, наприклад, A1, A2, A3; B1, B2, B3 ... ...
Відвантаження:
1. Сухий погляд: зразки потрібно упакувати в мішках і закопувати в сухий льоду.
2. Трубки РНК: Зразки РНК можна висушити в трубці стабілізації РНК (наприклад, RNASTABLE®) та відправляти в кімнатну температуру.
РОБОТИ РОБОТА
Дизайн експерименту
Доставка зразків
Екстракція РНК
Будівництво бібліотеки
Послідовність
Аналіз даних
Послуги після продажу
Біоінформатика
Еукаріотичний МРНК -послідовність аналізу робочого процесу
Біоінформатика
ØСирий контроль якості даних
ØПосилання на вирівнювання геному
ØАналіз структури стенограми
ØКількісне визначення виразів
ØДиференціальний аналіз експресії
ØАнотація функцій та збагачення
Посилання на вирівнювання геному
Насичення даних
Вибірка кореляція та оцінка біологічних реплік
Диференційно експресовані гени (DEG)
Функціональна анотація DEG
Функціональне збагачення DEG
Дослідіть просування, спричинені еукаріотичними службами секвенування мРНК BMKGENE через кураторну колекцію публікацій.
Хуанг, Л. та ін. (2023) "Триклозан і трикрокарбан послаблюють нюхову здатність золотих риб, обмежуючи розпізнавання паху, порушуючи трансдукцію нюхового сигналу та тривожну обробку нюхової інформації", дослідження води, 233, с. 119736. Doi: 10.1016/j.watres.2023.119736.
Jia, LJ та ін. (2023) 'Aspergillus fumigatus викрадає людину p11 для перенаправлення грибкових фагосом на недеградативний шлях', комірка-хост і мікроб, 31 (3), с. 373-388.e10. doi: 10.1016/j.chom.2023.02.002.
Джин, К. та ін. (2022) 'фактори транскрипції TCP, що беруть участь у розробці стрілянини бамбука MA (Dendrocalamus latiflorus munro)', кордони в науці про рослин, 13, с. 884443. Doi: 10.3389/fpls.2022.884443/bibtex.
Wen, X. та ін. (2022) "Геном хризантеми лавандуліфолій та молекулярний механізм, що лежить в основі різноманітних типів капітулумів", дослідження садівництва, 9. doi: 10.1093/hr/uhab022.
Чжан, Юджі та ін. (2023) "Каскадний нанореактор для посилення сонодинамічної терапії на колоректальний рак за допомогою синергетичного збільшення ROS та блокування аутофагії", Nano сьогодні, 49, с. 101798. Doi: 10.1016/j.nantod.2023.101798.
