
CircRNA
Кільцеві РНК (цирРНК) — це некодуючі РНК, які утворюють кільцеві структури та виконують численні регуляторні ролі, включаючи конкуренцію з мікроРНК за гени-мішені та зв’язування з білками. Конвеєр BMKCloud circRNA розроблений для аналізу бібліотек, деплетованих рРНК, із добре анотованим та високоякісним еталонним геномом. Аналіз починається з обрізки зчитування та контролю якості, після чого відбувається вирівнювання зчитування за еталонним геномом і передбачення нових circRNA у поєднанні з ідентифікацією відомих circRNA з баз даних. Згодом ідентифікуються відповідні мішені мікроРНК і хазяї цирРНК. Аналіз диференціальної експресії виявляє диференціально експресовані circRNA, і відповідні господарі функціонально анотовані для виділення збагачених біологічних функцій.
Біоінформатика
