16s/18S/його послідовність амплікону
Особливості обслуговування
● Платформа секвенування: Illumina Novaseq.
● Посилення коротких регіонів 16 -х, 18 -х років та його, серед інших цілей посилення.
● Гнучкий вибір амплікону.
● Попередній досвід проекту з множинними цілями посилення.
Переваги послуг
●Без ізоляції:Швидка ідентифікація мікробного складу у зразках навколишнього середовища.
●Висока роздільна здатність: У низькозабезпечених компонентах у зразках навколишнього середовища.
●Широко застосовується: Різноманітні дослідження мікробних спільнот.
●Комплексний біоінформатичний аналіз: Останній пакет QIIME2 (кількісне розуміння мікробної екології) з різноманітними аналізами з точки зору бази даних, анотації, OTU/ASV.
●Широка експертиза: З 150 тисяч проектів з послідовності амплікону, що проводяться щорічно, BMKGENE приносить понад десятиліття досвіду, висококваліфіковану команду аналізу, комплексний зміст та відмінна підтримка післяпродажних.
Технічні характеристики послуг
| Бібліотека | Стратегія послідовності | Рекомендовані дані |
| Амплікон | Illumina pe250 | 50/100/300K тегів (читайте пари) |
Вимоги до обслуговування
| Концентрація (нг/мкл) | Загальна сума (Нг) | Об'єм (мкл) |
| ≥1 | ≥200 | ≥20 |
● ґрунт/мул: 1-2 г
● Кишковий вміст-тварина: 0,5-2г
● Кишковий зміст-вставка: 0,1-0,25г
● Поверхня рослин (збагачений осад): 0,1-0,5 г
● Збагачений бульйон, збагачений бульйон): 0,1-0,5г
● Фекси (великі тварини): 0,5-2 г
● Фекси (миша): 3-5
● Легенева альвеолярна промивальна рідина: фільтрування паперу
● Вагінальний тампон: 5-6 тампони
● Шкіра/генітальна тампон/слина/пероральна м’яка тканина/глотка-мазок/ректальний тампон: 2-3 тампони
● Поверхневі мікроорганізми: фільтрування паперу
● Водне тіло/повітря/біоплівка: фільтрувальний папір
● Ендофіти: 1-2 г
● Стоматологічна нальота: 0,5-1г
РОБОТИ РОБОТА
Доставка зразків
Будівництво бібліотеки
Послідовність
Аналіз даних
Послуги після продажу
Включає такий аналіз:
- Сирий контроль якості даних
- OTU кластеризація /де-пузи (ASV)
- Анотація ОТУ
- Аналіз різноманітності альфа: кілька індексів, включаючи Шеннон, Сімпсон та Ейс.
- Аналіз різноманітності бета -версії
- Міжгруповий аналіз
- Кореляційний аналіз: між факторами навколишнього середовища та складом та різноманітністю
- 16S Функціональний прогнозування генів
Гістограма таксономічного розподілу
Таксономічна карта кластеризації тепла
Аналіз різноманітності альфа: крива розрідження
Аналіз бета -версії: NMDS
Міжгруповий аналіз: Discovery Biomarker Lefse
Дослідіть просування, спричинені службами послідовності амплікону BMKGENE з Illumina через кураторську колекцію публікацій.
Dong, C. та ін. (2022) "Збірка, ядра мікробіоти та функція ризосферної ґрунту та коридної кори та мікробіоти Eucommia ulmoides", кордони в мікробіології, 13. doi: 10.3389/fmicb.2022.85317/повна.
Лі, Ю. та ін. (2023) «Трансплантація синтетичних бактерій консорціумів для лікування бактеріального вагінозу Gardnerella vaginalis у мишей», мікробіома, 11 (1), с. 1–14. doi: 10.1186/s40168-023-01497-y
Yang, J., Fu, Y. and Liu, H. (2022) 'Мікробіома повітряного пилу, зібраних під час наземного закритого експерименту з підтримки життєдіяльності "Місячний палац 365", екологічні мікробіома, 17 (1), pp. 1–20. doi: 10.1186/S40793-022-00399-0/Фігури/8.
Інь, С. та ін. (2022) "Залежність від сировини, що залежна від функціональних генів, пов'язаних з трансформацією азоту, що контролюють втрату азоту при компостуванні", Bioresource Technology, 361, с. 127678. Doi: 10.1016/j.biortech.2022.127678.
