Tüm transkriptom dizilimi - Illumina
Özellikler
● Tam transkriptomu sıralamak için çift kütüphane: rRNA tükenmesi ve ardından PE150 kütüphane hazırlama ve boyut seçimi ve ardından SE50 kütüphane hazırlığı
● Ayrı biyoinformatik raporlarında mRNA, lncRNA, circRNA ve miRNA'nın tam biyoinformatik analizi
● Cerna Networks analizi dahil olmak üzere birleşik bir raporda tüm RNA ekspresyonunun ortak analizi.
Hizmet Avantajları
●Düzenleyici ağların derinlemesine analizi: Cerna ağ analizi, mRNA, lncRNA, circRNA ve miRNA'nın eklem dizilimi ve kapsamlı bir biyoinformatik iş akışı ile etkinleştirilir.
●Kapsamlı ek açıklama: Farklı olarak eksprese edilen genlere (DEG) işlevsel olarak açıklamak ve ilgili zenginleştirme analizini gerçekleştirmek için birden fazla veritabanı kullanıyoruz, transkriptom yanıtının altında yatan hücresel ve moleküler süreçler hakkında bilgi veriyoruz.
●Kapsamlı uzmanlık: Çeşitli araştırma alanında 2100'den fazla transkriptom projesini başarılı bir şekilde kapatmanın bir geçmişi ile ekibimiz her projeye zengin bir deneyim getiriyor.
●Titiz kalite kontrolü: Örnek ve kütüphane hazırlığından sekanslama ve biyoinformatiklere kadar tüm aşamalarda çekirdek kontrol noktalarını uyguluyoruz. Bu titiz izleme, sürekli yüksek kaliteli sonuçların verilmesini sağlar.
●Satış Sonrası Destek: Taahhüdümüz, 3 aylık satış sonrası hizmet dönemi ile projenin tamamlanmasının ötesine uzanmaktadır. Bu süre zarfında, sonuçlarla ilgili sorguları ele almak için proje takibi, sorun giderme yardımı ve Soru-Cevap oturumları sunuyoruz
Örnek gereksinimleri ve teslimat
| Kütüphane | Sıralama stratejisi | Veriler önerilir | Kalite kontrolü |
| RRNA tükendi | Illumina PE150 | 16 GB | S30% 85 |
| Seçilen boyut | Illumina SE50 | 10-20m okuyor |
Örnek gereksinimleri:
Nükleotidler:
| Conc. (Ng/μl) | Miktar (μg) | Saflık | Bütünlük |
| ≥ 80 | ≥ 1.6 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0.5-2.5 Jel üzerinde gösterilen protein veya DNA kontaminasyonu sınırlı veya yok. | Rin≥6.0 5.0≥28S/18S≥1.0; Sınırlı veya taban çizgisi yüksekliği yok |
Önerilen Örnek Teslimat
Konteyner: 2 mL santrifüj tüpü (kalay folyo önerilmez)
Örnek etiketleme: grup+replikasyon EG A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Gönderi:
1. Kuru buz: Numunelerin torbalarla paketlenmesi ve kuru buzda gömülmesi gerekir.
2. RNastable Tüpler: RNA numuneleri RNA stabilizasyon tüpünde (örn. RNastable®) kurutulabilir ve oda sıcaklığında gönderilebilir.
Servis İş Akışı
Deney tasarımı
Örnek Teslimat
RNA ekstraksiyonu
Kütüphane İnşaatı
Sıralama
Veri analizi
Satış Sonrası Hizmetler
Biyoinformatik
RNA ifadesine genel bakış
Farklı şekilde ifade edilen genler
Cerna Analizi
Farklı şekilde ifade edilen miRNA'lar ve ilgili RNA'lar
BMKGene'nin tüm transkriptom sıralama hizmetleri tarafından düzenlenmiş bir yayın koleksiyonu aracılığıyla kolaylaştırılan araştırma gelişmelerini keşfedin.
Dai, Y. ve ark. (2022) 'RNA sekanslama ile tanımlanan Kashin-Beck hastalığında mRNA, LNCRNA ve miRNA'ların kapsamlı ekspresyon profilleri', Moleküler Omics, 18 (2), s. 154-166. doi: 10.1039/d1mo00370d.
Liu, N. Nan ve ark. (2022) 'Tam uzunlukta Transkriptomlar Kışlık döneminde Changbai Dağı'nda APIS cerana'nın soğuk dirençinin analizi.', Gene, 830, s. 146503-146503. doi: 10.1016/j.gene.2022.146503.
Wang, XJ ve ark. (2022) 'Küçük hücreli akciğer kanserinde rakip endojen RNA regülasyon ağlarının çoklu entegrasyon temelli önceliklendirilmesi: moleküler özellikler ve ilaç adayları', Onkolojide Frontiers, 12, s. 904865. Doi: 10.3389/fonc.2022.904865/bibtex.
Xu, P. ve ark. (2022) 'LncRNA/circRNA-mirna-mRNA ekspresyon profillerinin entegre analizi, fıstıktaki kök düğüm nematodlarına yanıt olarak potansiyel mekanizmalara yeni bilgiler ortaya çıkarır', BMC Genomics, 23 (1), s. 1-12. doi: 10.1186/s12864-022-08470-3/figürler/7.
Yan, Z. ve ark. (2022) 'Tam-transkriptom RNA sekanslaması, kırmızı LED ışınlama ile brokoli'de postharvest kalitesinin korunmasıyla ilişkili moleküler mekanizmaları vurgular', postharvest biyolojisi ve teknolojisi, 188, s. 111878. Doi: 10.1016/j.postharvbio.2022.111878.
