Tüm genom bisülfit dizilimi (WGBS)
Tüm Genom Bisülfit Dizilimi (WGBS), DNA metilasyonunun, özellikle de gen ekspresyonu ve hücresel aktivitenin önemli bir düzenleyicisi olan sitozindeki (5-mC) beşinci konumun derinlemesine araştırılması için altın standart metodoloji olarak duruyor. WGBS'nin altında yatan prensip, metillenmiş sitozinleri değiştirmeden bırakırken metillenmemiş sitozinlerin urasile (C'den U'ya) dönüşümünü indükleyen bisülfit tedavisini içerir. Bu teknik, araştırmacıların metilomu kapsamlı bir şekilde araştırmasına ve başta kanser olmak üzere çeşitli durumlarla ilişkili anormal metilasyon modellerini ortaya çıkarmasına olanak tanıyan tek bazlı çözünürlük sunar. Bilim adamları, WGBS'yi kullanarak, genom çapında metilasyon manzaralarına dair benzersiz bilgiler edinebilir ve çeşitli biyolojik süreçlerin ve hastalıkların altında yatan epigenetik mekanizmaların ayrıntılı bir şekilde anlaşılmasını sağlayabilir.
Hizmet Özellikleri
● Referans genom gerektirir.
● Bisülfit dönüşüm verimliliğini izlemek için Lambda DNA eklenir.
● Illumina NovaSeq'te sıralama.
Hizmet Avantajları
●DNA Metilasyonu Araştırmasında Altın Standart: Bu olgun metilasyon dönüşüm işleme teknolojisi, yüksek doğruluk ve iyi tekrarlanabilirliğe sahiptir.
●Geniş Kapsama ve Tek Tabanlı Çözünürlük:metilasyon bölgelerinin genom çapında tespiti.
●Tam Platform:Numune işleme, kütüphane oluşturma, sıralama ve biyoinformatik analizlere kadar tek elden mükemmel hizmet sağlayın.
●Kapsamlı Uzmanlık: Çok çeşitli türlerde başarıyla tamamlanan WGBS dizileme projeleriyle BMKGENE, on yıldan fazla deneyim, yüksek vasıflı bir analiz ekibi, kapsamlı içerik ve mükemmel satış sonrası destek sunar.
●Transkriptomik Analize Katılma İmkanı: WGBS'nin RNA-seq gibi diğer omik verilerle entegre analizine olanak sağlar.
Örnek Özellikler
| Kütüphane | Sıralama Stratejisi | Önerilen veri çıkışı | Kalite kontrol |
| Bisülfitle işlenmiş | Illumina PE150 | 30x derinlik | Q30 ≥ %85 Bisülfit dönüşümü > %99 |
Örnek Gereksinimler
| Konsantrasyon (ng/μL) | Toplam miktar (μg) | Ek gereksinimler | |
| genomik DNA | ≥ 5 | ≥ 400ng | Sınırlı bozulma veya kirlenme |
Hizmet İş Akışı
Numune teslimatı
DNA ekstraksiyonu
Kütüphane inşaatı
Sıralama
Veri analizi
Veri teslimi
Aşağıdaki analizi içerir:
● Ham sıralama kalite kontrolü;
● Referans genomuna haritalama;
● 5mC metillenmiş bazların tespiti;
● Metilasyon dağılımının ve açıklamalarının analizi;
● Diferansiyel Olarak Metillenmiş Bölgelerin (DMR'ler) Analizi;
● DMR'lerle ilişkili genlerin işlevsel açıklaması.
5mC metilasyon tespiti: metillenmiş bölgelerin türleri
Metilasyon haritası. 5mC metilasyon genom çapında dağılım
Yüksek oranda metillenmiş bölgelerin açıklaması
Diferansiyel Olarak Metillenmiş Bölgeler: ilişkili genler
Diferansiyel Olarak Metillenmiş Bölgeler: ilişkili genlerin açıklaması (Gen Ontolojisi)
BMKGene'nin tüm genom bisülfit dizileme hizmetleri tarafından kolaylaştırılan araştırma ilerlemelerini, seçilmiş bir yayın koleksiyonu aracılığıyla keşfedin.
Fan, Y. ve ark. (2020) 'Tam genom bisülfit dizilimi kullanılarak koyun iskelet kası gelişimi sırasında DNA metilasyon profillerinin analizi',BMC Genomik, 21(1), s. 1–15. doi: 10.1186/S12864-020-6751-5.
Zhao, X. ve ark. (2022) 'Vinil klorüre maruz kalan işçilerde yeni deoksiribonükleik asit metilasyon bozuklukları',Toksikoloji ve Endüstriyel Sağlık, 38(7), s. 377–388. doi: 10.1177/07482337221098600
Zuo, J. ve ark. (2020) 'Domates meyvesinin olgunlaşmasında genom metilasyonu, kodlamayan RNA'ların, mRNA'ların ve metabolitlerin seviyeleri arasındaki ilişkiler',Bitki Dergisi, 103(3), s. 980–994. doi: 10.1111/TPJ.14778.
