Heatmap çekmecesi, matris verilerini filtreleyebilen, normalleştirebilen ve kümelenebilen ısı haritası çizimi için kullanılır. Çoğunlukla farklı numuneler arasındaki gen ekspresyon seviyesinin küme analizi için kullanılır.
NR, KEGG, COG, SwissProt, Trembl, Kog, PFAM dahil olmak üzere, dizileri veritabanına hizalayarak fasta dosyasındaki dizilere biyolojik fonksiyonların eklenmesi.
BLAST (Temel Yerel Hizalama Arama Aracı), benzer biyolojik dizilere sahip bölgeleri bulmak için bir algoritma ve programdır. Bu dizileri datbazları sıralayarak karşılaştırır ve istatistiksel önemi hesaplar. BLAST, sekans tipine dayanan dört tür araçtan oluşur: Blastn, Lastp, Blastx ve Tblastn.