Isı haritası
Heatmap aracı bir matris veri dosyasını giriş olarak kabul eder ve kullanıcıların verileri filtrelemesine, normalleştirmesine ve kümelenmesine olanak tanır. Isı haritaları için birincil kullanım durumu, farklı numuneler arasındaki gen ekspresyon seviyesinin küme analizidir.
Gen ek açıklama
Gen ek açıklama aracı, giriş fasta dosyalarının çeşitli veritabanlarına karşı sıra hizalamasına dayanan gen ek açıklamasını gerçekleştirir.
Temel Yerel Hizalama Arama Aracı (BLAST)
Blast Aracı, NCBI Blast'ın BMKCLOUD entegre bir sürümüdür ve BMKCLOUD hesabına yüklenen verileri kullanarak aynı işlevleri gerçekleştirmek için kullanılabilir.
CDS_UTR Tahmin
CDS_UTR tahmin aracı, bilinen protein veritabanlarına ve ORF tahmin sonuçlarına karşı patlama sonuçlarına dayanan verilen transkript sekanslarında kodlama bölgelerini (CD'ler) ve kodlayıcı olmayan bölgeleri (UTR) tahmin etmek için tasarlanmıştır.
Manhattan arsa
Manhattan arsa aracı, yüksek numune deneylerinin görüntülenmesini sağlar ve genom çapında ilişkilendirme çalışmalarında (GWAS) yaygın olarak kullanılır.
Circos Diyagramı
Circos Diyagramı aracı, genomik özelliğin genom boyunca nasıl dağıtıldığının verimli bir görüntülenmesini sağlar. Ortak özellikler arasında nicel lokus, SNP'ler, indeller, yapısal ve kopya sayısı varyantları bulunur.
Gen ontolojisi (Go) zenginleştirme
Go Zenginleştirme aracı fonksiyonel zenginleştirme analizi sağlar. Bu araçtaki birincil yazılım, diferansiyel ifade analizi, Go zenginleştirme analizi ve sonuçların görüntülenmesini içeren Topgo-Biyokondüktör paketidir.
Ağırlıklı gen birlikte ekspresyon ağı analizi (WGCNA)
WGCNA, gen birlikte ekspresyon modüllerini keşfetmek için yaygın olarak kullanılan bir veri madenciliği yöntemidir. Mikrodizi ve NGS gen ekspresyon verileri dahil olmak üzere çeşitli ifade veri kümesi için geçerlidir.
Arınan kimse
Interproscan aracı, interpro protein dizisi analizi ve sınıflandırması sağlar.
Git Kegg Zenginleştirme
GO KEGG Zenginleştirme Aracı, sağlanan bir gen setine ve karşılık gelen ek açıklamaya dayanan bir Go zenginleştirme histogramı, KEGG Enerji Histogramı ve KEGG zenginleştirme yolu oluşturmak için tasarımdır.