Pasifik Biosciences (PacBio) izoform sekanslama verilerini girdi olarak alarak, bu uygulama tam uzunlukta transkript dizilerini (montajsız) tanımlayabilir. Tam uzunlukta sekansları referans genomla eşleştirerek, transkriptler bilinen genler, transkriptler, kodlama bölgeleri vb. Tarafından optimize edilebilir. Bu durumda, alternatif birleştirme vb. MRNA yapılarının daha doğru bir şekilde tanımlanması sağlanabilir. NGS transkriptom sekanslama verileri ile ortak analiz, transkript düzeyinde ekspresyonda daha kapsamlı ek açıklama ve daha doğru niceleme sağlar, bu da aşağı akış diferansiyel ekspresyonuna ve fonksiyonel analize büyük fayda sağlar.
