Pacbio Tam uzunlukta transkriptom

PacBio Tam Uzunlukta Transkriptom Dizileme, Isoseq, transkript izoformlarının doğru tanımlanmasını sağlar, alternatif poliadenilasyon ve birleştirmeye ışık tutar ve daha doğru gen ekspresyon analizine yol açar. BMKCloud PacBio Tam Uzunlukta Transkriptom hattı, Dairesel Konsensüs Sıralaması (CCS) modunda sıralanan cDNA kitaplıklarını analiz etmek ve daha sonra yedekli olmayan transkriptler halinde kümelenen Tam Uzunlukta Kimerik Olmayan (FLNC) dizileri tanımlamak için tasarlanmıştır. Sonraki bir BUSCO analizi, transkriptom düzeneğinin eksiksizliğini değerlendirir. Birleştirilmiş transkriptomdan çoklu analizler gerçekleştirilir: alternatif birleştirme, basit dizi tekrarı (SSR), lncRNA'nın tahmini ve karşılık gelen hedef genler, yeni genlerin tahmini, gen ailesi analizi, transkripsiyon faktörü analizi ve transkripsiyonların fonksiyonel açıklaması.