
referans genomlu mRNA-seq (NGS)
RNA-seq, genomlar ve proteomlar arasındaki boşluğu dolduran yaşam ve mahsul bilimleri boyunca standart bir araçtır. Gücü yeni transkriptleri keşfetmek ve ifadelerini bir testte ölçmektir. Mutantları vahşi tiplerle karşılaştırmak veya belirli koşullar altında gen ekspresyonunu ortaya çıkarmak gibi çeşitli özellikler veya fenotiplerle ilgili genlere ışık tutan karşılaştırmalı transkriptomik çalışmalar için yaygın olarak kullanılır. BMKCloud mRNA (Referans) APP, ifade niceliği, diferansiyel ekspresyon analizi (DEG) ve dizi yapısı analizlerini mRNA-seq (NGS) biyoinformatik boru hattına entegre eder ve benzer yazılımların güçlü yanlarını birleştirerek kolaylık ve kullanıcı dostu olmasını sağlar. Kullanıcılar RNA-seq verilerini buluta yükleyebilir, burada uygulama kapsamlı, tek noktadan biyoinformatik bir analiz çözümü sunar. Ayrıca, kullanıcıların özel ihtiyaçlarına göre uyarlanmış kişiselleştirilmiş operasyonlar sunan müşteri deneyimine öncelik verir. Kullanıcılar parametreleri ayarlayabilir ve boru hattı görevini kendileri gönderebilir, etkileşimli raporu kontrol edebilir, veri/diyagramları görüntüleyebilir ve hedef gen seçimi, fonksiyonel kümeleme, diyagramlama vb.
Platform:Illumina, MGI
Strateji:RNA-seq
Düzen: Pariped, temiz veri.
Kütüphane Türü:FR-FRE-STREMSED, FR-STRANTRAND veya FR-SECONDSTRAND
Okuma Uzunluğu:150 bp
Dosya Türü:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz veya *.fq.gz. Sistem olacak.fastq dosyalarını otomatik olarak dosya adlarına göre eşleştirin,örneğin *_1.fastq *._ 2.fastq ile eşleştirildi.
Örnek sayısı:Numarada herhangi bir kısıtlama yokörneklerin, ancak analiz süresi sayısı olarak artacakÖrnekler büyür.
Önerilen veri miktarı:Örnek başına 6g