-
Biomarker Teknolojileri ile Nanopore RNA Dizilemesinde en son başarılı vakalar
Nanopore Tabanlı Tam Uzunlukta Transkriptom Dizileme Nanopore dizileme, nükleotidlerin DNA sentezi olmadan doğrudan okunması ve onlarca kilobazda uzun okumalar üretmesi açısından kendisini diğer dizileme platformlarından ayırır. Bu doğrudan yönlendirmeyi güçlendirir ...Devamını oku -
Mikrobiyal çeşitlilik çalışmalarında tam uzunlukta amplikon dizilemenin uygulanması
MİKROBİYAL EKOLOJİ Tarımsal yoğunlaştırma, mikrobiyal ağ karmaşıklığını ve köklerdeki kilit taşı taksonlarının bolluğunu azaltır. Tam Uzunlukta Amplikon Dizileme (IT...Devamını oku -
Tam uzunlukta 16S dizilimi ile hareketsizleştirilmiş bakterilerle işlenmiş toprakta mikrobiyom topluluğunun ve fonksiyonunun araştırılması
MİKROBİYAL Biyokömür ile bakteriyel uyumluluk ve immobilizasyon, geliştirilmiş tebukonazol bozunması, toprak mikrobiyomu bileşimi ve işleyişi Tam uzunlukta 16S amplikon dizilimi | PacBio HiFi | Alfa çeşitliliği | Beta di...Devamını oku -
Metagenomik çalışmalarda nanopore uzun okumalarının performansı
METAGENOMİKLER Nano gözenek dizilimi kullanılarak mikrobiyomlardan eksiksiz, kapalı bakteri genomları Nano gözenek dizilimi | Metagenomik | MAG'ler | Bakteriyel genomun döngüselleştirilmesi | Bağırsak mikrobiyotası...Devamını oku -
Hastalıklarla mücadelede Nanopore uzun okumalı yeniden sıralamanın uygulanması
İNSAN GENOMİĞİ doğa genetiği Uzun süre okunan dizileme, nöronal intranükleer inklüzyon hastalığı ONT yeniden dizilimi ile ilişkili NOTCH2NLC'deki GGC tekrar genişlemelerini tanımlar | Illumina | Tüm ekzom dizilimi | CRISPR-Cas9 ONT hedefli dizi...Devamını oku -
Nanopore bazlı yeniden sıralamanın COVID19 genetik varyantlarının tanımlanmasında uygulanması
BÜTÜN GENOMUN YENİDEN DÜZENLENMESİ SARS-CoV-2'nin genomik izlemesi, tip I interferon tepkisini modüle eden bir Nsp1 delesyon varyantını ortaya çıkarıyor Nanopore | Illumina | Tüm genomun yeniden dizilenmesi | metagenomik | RNA-Sırası | Sanger Bioma...Devamını oku -
Çin popülasyonundaki yapı değişkenleri ve bunların fenotipler, hastalıklar ve popülasyon adaptasyonu üzerindeki etkileri
BÜTÜN GENOMUN YENİDEN DÜZENLENMESİ Çin popülasyonundaki yapı değişkenleri ve bunların fenotipler, hastalıklar ve popülasyon adaptasyonu üzerindeki etkileri Nanopore | PacBio | Tüm genomun yeniden dizilenmesi | Yapısal çeşitlilik çağrısı Bu alanda ...Devamını oku -
Dört telomerden telomere birleştirilmiş hayvan ve bitki genomu
T2T GENOM BİRLİĞİ, GAP SERBEST GENOM 1. İki Pirinç Genomu1 Başlık: Xian/indica Pirinci için İki Boşluksuz Referans Genomunun Birleştirilmesi ve Doğrulanması, Bitki Centromere Mimarisine İlişkin İçgörüleri Ortaya Çıkarıyor Doi: https://doi.org/10.1101/2020.12.24.424073 Gönderi ...Devamını oku -
Genom dizileri küresel dağılım yollarını ortaya koyuyor ve denizatı evriminde yakınsak genetik adaptasyonlar öneriyor
GENOM EVRİMİ doğa İLETİŞİM Genom dizileri küresel dağılım yollarını ortaya koyuyor ve denizatı evriminde yakınsak genetik adaptasyonları öne sürüyor PacBio | Illumina | Merhaba-C | WGS | Genetik Çeşitlilik | Demografik Tarih | Gen Akışı...Devamını oku -
Yüksek kaliteli bir genom derlemesi, çavdarın genomik özelliklerini ve tarımsal açıdan önemli genleri vurgular
GENOM EVRİMİ doğa genetiği Yüksek kaliteli bir genom derlemesi, çavdarın genomik özelliklerini ve tarımsal açıdan önemli genleri vurgular PacBio | Illumina | Bionano Optik Haritası | Hi-C Genom Düzeneği | Genetik Harita | Seçici Süpürmeler | RNA...Devamını oku -
Biyokütle mahsulü Miscanthus lutarioriparius genomunun kromozom ölçekli montajı ve analizi
GENOM Biyokütle mahsulünün kromozom ölçekli montajı ve analizi Miscanthus lutarioriparius genomu Nano gözenek dizilimi | Illumina | Merhaba-C | RNA dizilimi | Filogeni Bu çalışmada Biomarker Techno...Devamını oku -
Nautilus pompilius'un genomu göz evrimini ve biyomineralizasyonu aydınlatıyor
GENOM EVRİMİ Nautilus pompilius'un genomu göz evrimini ve biyomineralizasyonu aydınlatıyor PacBio dizilimi | Illumina | Filogenetik analiz | RNA dizilimi | SEM | Proteomik...Devamını oku -
Karşılaştırmalı genom analizleri, transpozon aracılı genom genişlemesini ve pamukta 3 boyutlu genomik katlanmanın evrimsel mimarisini vurgulamaktadır
GENOM EVRİMİ Karşılaştırmalı genom analizleri, transpozon aracılı genom genişlemesini ve pamukta 3 boyutlu genomik katlanmanın evrimsel mimarisini vurgulamaktadır. Nanopore dizilimi | Merhaba-C | PacBio...Devamını oku