mRNA-seq (NGS) – De novo

mRNA dizilimi, hücrelerdeki tüm mRNA transkriptlerinin belirli koşullar altında profillenmesine olanak tanır ve çeşitli araştırma alanlarında yaygın olarak kullanılan bir teknolojidir. BMKCloud De novo mRNA-seq ardışık düzeni, referans genom mevcut olmadığında poli-A ile zenginleştirilmiş sıralama kitaplıklarını analiz etmek için tasarlanmıştır. Boru hattı kalite kontrolüyle başlar ve bunu takip eder.yenitranskript derlemesi ve tekdüze küme seçimi. Tekgen yapı analizi, kodlama dizisini (CDS) ve basit dizi tekrarlarını (SSR) tahmin eder. Daha sonra diferansiyel ekspresyon analizi, test edilen koşullar arasında diferansiyel olarak eksprese edilen genleri (DEG'ler) bulur ve ardından biyolojik bilgiler elde etmek için DEG'lerin fonksiyonel açıklaması ve zenginleştirilmesi yapılır.