Metagenomik (NGS)

Illumina ile av tüfeği metagenomisi, karmaşık örneklerden DNA'yı doğrudan dizileyerek mikrobiyomları incelemek için popüler bir araçtır ve hem taksonomik hem de fonksiyonel çeşitliliğin incelenmesine olanak tanır. BMKCloud metagenomik (NGS) hattı, genlerin tahmin edildiği ve birden fazla veri tabanı kullanılarak işlev ve taksonomi açısından açıklamalı, yedekli olmayan veri kümeleri halinde kümelendiği kalite kontrol ve metagenom derlemesi ile başlar. Bu bilgi, numune içi taksonomik çeşitliliği (alfa çeşitliliği) ve numuneler arası çeşitliliği (beta çeşitliliği) analiz etmek için kullanılır. Gruplar arasındaki diferansiyel analiz, hem parametrik hem de parametrik olmayan testler kullanılarak iki grup arasında farklılık gösteren OTU'ları ve biyolojik işlevleri bulurken, korelasyon analizi bu farklılıkları çevresel faktörlerle ilişkilendirir.