Genom çapında ilişki çalışması (GWAS), spesifik özelliklerle (fenotip) ilişkili genetik varyantları (genotip) tanımlamayı amaçlamaktadır. GWA çalışmaları, genetik belirteçleri çok sayıda bireyin çapraz genomunu araştırmakta ve popülasyon düzeyinde istatistiksel analizle genotip-fenotip ilişkilerini öngörmektedir. Tüm genom yeniden güçlendirme potansiyel olarak tüm genetik varyantları keşfedebilir. Fenotipik verilerle birleşen GWAS, modern hayvan/bitki üremesini güçlü bir şekilde destekleyen fenotip ilişkili SNP'leri, QTL'leri ve aday genleri tanımlamak için işlenebilir. SLAF, genom çapında dağıtılmış belirteçleri, SNP'yi keşfeden kendi kendini geliştiren basitleştirilmiş bir genom dizileme stratejisidir. Bu SNP'ler, moleküler genetik belirteçler olarak, hedefli özelliklerle ilişkilendirme çalışmaları için işlenebilir. Karmaşık özelliklerle ilişkili genetik varyasyonların belirlenmesinde uygun maliyetli bir stratejidir.
