Genom çapında ilişki analizi
İş akışı
Hizmet Avantajları
●Kapsamlı uzmanlık ve yayın kayıtları: GWAS'ta birikmiş deneyime sahip olan BMKGene, nüfus GWAS araştırmasında yüzlerce tür projesini tamamladı, araştırmacılara 100'den fazla makale yayınlamasına yardımcı oldu ve kümülatif etki faktörü 500'e ulaştı.
● Kapsamlı biyoinformatik analizi: İş akışı, bir dizi aday gen sunan SNP-özelliği ilişkilendirme analizini ve bunların karşılık gelen fonksiyonel ek açıklamalarını içerir.
●Yüksek yetenekli biyoinformatik ekibi ve kısa analiz döngüsü: Gelişmiş genomik analizinde büyük deneyime sahip olan BMKGene'nin ekibi, hızlı bir geri dönüş süresi ile kapsamlı analizler sunar.
●Satış Sonrası Desteği:Taahhüdümüz, 3 aylık satış sonrası hizmet dönemi ile projenin tamamlanmasının ötesine uzanmaktadır. Bu süre zarfında, sonuçlarla ilgili soruları ele almak için proje takibi, sorun giderme yardımı ve Soru-Cevap oturumları sunuyoruz.
Hizmet Özellikleri ve Gereksinimleri
| Sıralama türü | Önerilen Nüfus Ölçeği | Sıralama stratejisi | Nükleotit gereksinimleri |
| Bütün genom dizilimi | 200 örnek | 10x | Konsantrasyon: ≥ 1 ng/ µL Toplam miktar 30ng Sınırlı veya bozulma veya kontaminasyon |
| Spesifik lokus amplifiye edilmiş fragman (SLAF) | Etiket derinliği: 10x Etiket sayısı: <400 MB: WGS önerilir <1GB: 100k etiketler 1GB > 2GB: 300k etiketler Max 500K Etiketler | Konsantrasyon ≥ 5 ng/µL Toplam miktar ≥ 80 ng Nanodrop OD260/280 = 1.6-2.5 Agaroz jel: yok veya sınırlı bozulma veya kontaminasyon
|
Malzeme seçimi
Farklı çeşitler, alt türler, LandRaces/Genebanks/Karışık Aileler/Vahşi Kaynaklar
Farklı çeşitler, alt türler, LandRaces
Yarım Sib Ailesi/Tam Sib Ailesi/Vahşi Kaynaklar
Servis İş Akışı
Deney tasarımı
Örnek Teslimat
RNA ekstraksiyonu
Kütüphane İnşaatı
Sıralama
Veri analizi
Satış Sonrası Hizmetler
Aşağıdaki analizi içerir:
- Genom çapında ilişki analizi: LM, LMM, Emmax, Fastlmm Modeli
- Aday genlerin fonksiyonel ek açıklaması
SNP-Trait Derneği Analizi-Manhattan Arsa
SNP-trait ilişkisi analizi-QQ grafiği
BMKGene'nin de GWAS hizmetleri tarafından yapılan gelişmeleri küratörlü bir yayın koleksiyonu aracılığıyla keşfedin:
LV, L. ve ark. (2023) 'Genom çapında ilişkilendirme çalışması tarafından jilet istiridye sinonovacula daralmasında amonyak toleransının genetik temeline ilişkin içgörü',Su ürünleri yetiştiriciliği, 569, s. 739351. Doi: 10.1016/j.aquacture.2023.739351.
Li, X. ve ark. (2022) '398 Foxtay Milet Accilions'ın Çok Omik analizleri, evcilleştirme, metabolit özellikleri ve anti-enflamatuar etkilerle ilişkili genomik bölgeleri ortaya çıkarır',Moleküler bitki, 15 (8), s. 1367-1383. doi: 10.1016/j.molp.2022.07.003.
Li, J. ve ark. (2022) 'Kuraklık ortamında Hulless'in zar zor fenotiplerinin genom çapında ilişkilendirilmesi',Bitki Biliminde Sınırlar, 13, s. 924892. Doi: 10.3389/fpls.2022.924892/bibtex.
Zhao, X. ve ark. (2021) 'Bir sülfotransferaz kodlayan GMST1, soya fasulyesi mozaik virüs suşlarına karşı direnç sağlar G2 ve G3',Bitki, Hücre ve Çevre, 44 (8), s. 2777-2792. doi: 10.1111/pce.14066.
