Ökaryotik mRNA sekanslama-ngs
Özellikler
● Kütüphane hazırlığından önce poli mRNA'nın yakalanması
● Strand'a özgü sıralama verilerinin elde edilmesini sağlamak için isteğe bağlı yönlü mRNA kütüphanesi hazırlığı
● Gen ekspresyonunun ve transkript yapısının biyoinformatik analizi
Avantajlar
●Kapsamlı uzmanlık: Ekibimiz, BMKGENE'de hücre kültürleri, dokular ve vücut sıvıları gibi çeşitli örnek türlerini kapsayan 600.000'den fazla numuneyi işledi. Her projeye zengin bir deneyim getiriyoruz ve çeşitli araştırma alanlarında 100.000'den fazla mRNA-seq projesini başarıyla tamamladık.
●Titiz kalite kontrolü: Örnek ve kütüphane hazırlığından sekanslama ve biyoinformatiklere kadar tüm aşamalarda çekirdek kontrol noktalarını uyguluyoruz. Bu titiz izleme, projenizin güvenilir ellerde olduğunu garanti ederek sürekli yüksek kaliteli sonuçların verilmesini sağlar.
●Kapsamlı ek açıklama: Farklı olarak ifade edilen genlere (DEG) işlevsel olarak açıklamak ve karşılık gelen zenginleştirme analizlerini gerçekleştirmek için birden fazla veritabanı kullanıyoruz. Bu kapsamlı yaklaşım, transkriptom yanıtının altında yatan hücresel ve moleküler süreçler hakkında bilgi verir ve projenizin sonuçları hakkında tam olarak bilgilendirilmenizi sağlar.
●Satış Sonrası Destek: Taahhüdümüz, 3 aylık satış sonrası hizmet dönemi ile projenin tamamlanmasının ötesine uzanmaktadır. Bu süre zarfında, sonuçlarla ilgili soruları ele almak için proje takibi, sorun giderme yardımı ve Soru-Cevap oturumları sunuyoruz.
Örnek gereksinimleri ve teslimat
| Kütüphane | Sıralama stratejisi | Veriler önerilir | Kalite kontrolü |
| Poli Zengin | Illumina PE150 DNBSEQ-T7 | 6 -10 GB | S30% 85 |
Örnek gereksinimleri:
Nükleotidler:
| Conc. (Ng/μl) | Miktar (μg) | Saflık | Bütünlük | |
| Standart kütüphane | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0.5-2.5 Jel üzerinde gösterilen protein veya DNA kontaminasyonu sınırlı veya yok. | Bitkiler için: Rin≥4.0; Hayvanlar için: Rin≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; Sınırlı veya taban çizgisi yüksekliği yok |
| Yön kütüphanesi | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0.5-2.5 Jel üzerinde gösterilen protein veya DNA kontaminasyonu sınırlı veya yok. | Bitkiler için: Rin≥4.0; Hayvanlar için: Rin≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; Sınırlı veya taban çizgisi yüksekliği yok |
● Bitkiler:
Kök, gövde veya taç yaprağı: 450 mg
Yaprak veya tohum: 300 mg
Meyve: 1.2 g
●Hayvan:
Kalp veya bağırsak: 300 mg
Vissera veya Beyin: 240 mg
Kas: 450 mg
Kemikler, Saç veya Cilt: 1G
● Eklembacaklılar:
Böcekler: 6g
Kabuklua: 300 mg
● Tam kan: 1 tüp
● Hücreler: 106 hücre
Önerilen Örnek Teslimat
Konteyner: 2 mL santrifüj tüpü (kalay folyo önerilmez)
Örnek etiketleme: grup+replikasyon EG A1, A2, A3; B1, B2, B3 ... ...
Gönderi:
1. Kuru buz: Numunelerin torbalarla paketlenmesi ve kuru buzda gömülmesi gerekir.
2. RNAS Tablo Tüpleri: RNA numuneleri RNA stabilizasyon tüpünde (örn. RNastable®) kurutulabilir ve oda sıcaklığında gönderilebilir.
Servis İş Akışı
Deney tasarımı
Örnek Teslimat
RNA ekstraksiyonu
Kütüphane İnşaatı
Sıralama
Veri analizi
Satış Sonrası Hizmetler
Biyoinformatik
Ökaryotik MRNA Sıralama Analizi İş Akışı
Biyoinformatik
ØHam veri kalitesi kontrolü
ØReferans genom hizalaması
ØTranskript yapısı analizi
Øİfade niceliği
ØDiferansiyel ifade analizi
Øİşlev ek açıklama ve zenginleştirme
Referans genom hizalaması
Veri doygunluğu
Biyolojik kopyaların örnek korelasyonu ve değerlendirilmesi
Farklı şekilde ifade edilen genler (DEG'ler)
DEG'lerin fonksiyonel ek açıklaması
DEG'lerin fonksiyonel zenginleştirilmesi
BMKGene'nin ökaryotik NGS mRNA Sekanslama Hizmetleri tarafından küratörlü bir yayın koleksiyonu aracılığıyla kolaylaştırılan gelişmeleri keşfedin.
Huang, L. ve ark. (2023) 'Triclosan ve triclocarban, koku algılamasını kısıtlayarak, koku alma sinyali iletimini bozarak ve koku alma bilgisi işlemeyi rahatsız ederek akvaryum balıklarının koku alma kapasitesini zayıflatır', Water Research, 233, s. 119736. Doi: 10.1016/j.watres.2023.119736.
Jia, LJ ve ark. (2023) 'Aspergillus fumigatus, mantar içeren fagosomları ayrıştırıcı olmayan yola yönlendirmek için insan p11'i kaçırır', Hücre Konak ve Microbe, 31 (3), s. 373-388.e10. doi: 10.1016/j.chom.2023.02.002.
Jin, K. ve ark. (2022) 'Ma bambu (Dendrocalamus latiflorus munro) sürgün gelişiminde yer alan TCP transkripsiyon faktörleri', Bitki Biliminde Sınırlar, 13, s. 884443. Doi: 10.3389/fpls.2022.884443/bibtex.
Wen, X. ve ark. (2022) 'Krizantem lavandulifolyum genomu ve çeşitli kapitulum tiplerinin altında yatan moleküler mekanizma', Bahçe Bitkileri Araştırması, 9. DOI: 10.1093/saat/UHAB022.
Zhang, Yujie ve ark. (2023) 'Sinerjistik ROS arttırma ve otofaji tıkanması yoluyla kolorektal kanser üzerinde sonodinamik tedaviyi arttırmak için bir kaskad nanoreaktör', Nano Today, 49, s. 101798. Doi: 10.1016/j.nantod.2023.101798.
