DNBSEQ önceden hazırlanmış kütüphaneler
Özellikler
●Platform:MGI-DNBSEQ-T7
●Sıralama modları:PE150
●Illumina kütüphanelerinin aktarılmasıMGI:Yüksek veri hacimlerinin düşük maliyetle sıralanmasına olanak tanır.
●Sıralamadan önce kitaplıkların kalite kontrolü.
●Verilerin kalite kontrol ve teslimatının sıralanması:Q30 okumalarının çoğullaması ve filtrelenmesinden sonra QC raporunun ve ham verilerin fastq formatında teslimi.
Avantajları
●Sıralama hizmetlerinin çok yönlülüğü:müşteri şerit veya veri miktarına göre sıralamayı seçebilir.
●Yüksek veri çıkışı:1500 Gb/şerit
●Sıralama QC raporunun teslimi:sıralama projesinin kalite ölçümleri, veri doğruluğu ve genel performansı ile.
●Olgun sıralama süreci:kısa dönüş süresi ile.
●Titiz Kalite Kontrolü: Sürekli olarak yüksek kaliteli sonuçların teslimini garanti etmek için sıkı kalite kontrol gereklilikleri uyguluyoruz.
Örnek Gereksinimler
| Veri Miktarı (X) | Konsantrasyon (qPCR/nM) | Hacim | |
| Kısmi Şerit
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1nM | ≥ 25 ul |
| 10 Gb < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nm | ≥ 25 ul | |
| 50 Gb < X ≤ 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 25 ul | |
| X > 100 Gb | ≥ 4 nM | ||
| tek şerit | Şerit Başına | ≥ 1,5 nM / Kütüphane havuzu | ≥ 25 µl / Kütüphane havuzu |
Konsantrasyon ve toplam miktarın yanı sıra uygun bir pik paterni de gereklidir.
Not: Düşük çeşitlilikteki kitaplıkların şerit sıralaması, güçlü baz çağrı sağlamak için PhiX spike-in'i gerektirir.
Örnek olarak önceden havuzlanmış kitaplıkları göndermenizi öneririz. BMKGENE'nin kütüphane havuzu oluşturmasını istiyorsanız lütfen
Kısmi şerit sıralaması için kütüphane gereksinimleri.
Kütüphane Boyutu (En yüksek harita)
Ana zirve 300-450 bp arasında olmalıdır.
Kitaplıkların tek bir ana tepe noktası olmalı, adaptör kontaminasyonu olmamalı ve birincil dimerler olmamalıdır.
Hizmet İş Akışı
Kütüphane Kalite Kontrol raporu
Sıralama, kütüphane miktarının değerlendirilmesi ve parçalanma öncesinde kütüphanenin kalitesine ilişkin bir rapor sunulur.
QC raporunun sıralanması
Tablo 1. Verilerin sıralamasına ilişkin istatistikler.
| Örnek kimliği | BMKID | Ham okumalar | Ham Veri (bp) | Temiz okumalar (%) | Ç20(%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Şekil 1. Her örnekteki okumalar boyunca kalite dağılımı
Şekil 2. Temel içerik dağılımı
Şekil 3. Sıralama verilerinde okuma içeriklerinin dağılımı
