Exclusive Agency for Korea

条形 Banner-03

Ürünler

DNA/RNA Sıralama - Nanopore Sıralayıcı

ONT Sekanslama, nanoporlara dayanan tek bir molekül gerçek zamanlı elektrik sinyali dizileme teknolojisidir, her platformun sekans prensibi aynıdır. Çift sarmallı DNA/RNA, biyofilm içine gömülü nanoporöz proteine ​​bağlanır ve biyofilmin her iki tarafından voltaj farkı altında motor proteinin kurşununun altında gevşer, DNA/RNA iplikçikleri nanopore kanal proteinden geçer, nanopore kanal proteinden geçer oran. DNA/RNA ipliği üzerindeki farklı bazların kimyasal özelliklerinin farklılıkları nedeniyle, nanopore kanalından tek bir baz veya DNA molekülü geçtiğinde, farklı elektrik sinyallerinin değişmesine neden olacaktır. Bu sinyalleri tespit ederek ve buna karşılık gelen karşılık gelen baz tipleri hesaplanabilir ve dizinin gerçek zamanlı tespiti tamamlanabilir.


Hizmet Ayrıntıları

Demo sonucu

Hizmet Ayrıntıları Özellikleri

Platform

Kütüphane boyutu

Teorik veri verimi (hücre başına)

Tek tabanlı doğruluk

Başvuru

Nanopore

8KB, 10KB, 20KB, Ultralong, CDNA-PCR

70-90GB/hücre

% 85-92

SV Calling, De Novo, tam uzunlukta sekanslama, ISO-seq, gen ek açıklaması, DNA metilasyonunun tespiti

Hizmet Avantajları

● Çeşitli türlerle binlerce kapalı proje ile Pacbio Sıralama Platformunda 5 yılı aşkın deneyim.
● BMKGene, çift platform RNA/DNA sertifikası ile Oxford Nanopore'un resmi bir ortağıdır.
● Tam ekipman ve yeterli sekanslama verimi olan ana sıralama modelleri vardır.
● Nanopore platformuna dayanarak, uluslararası ünlü dergilerde 10'dan fazla hayvan ve bitki denovo araştırması yayınlanmıştır.

Örnek gereksinimleri


Örnek tipi

Miktar

Konsantrasyon (Quit®)

Hacim

Saflık

Diğerleri

Genomik DNA

Veri gereksinimine bağlı

 ≥20ng/μl

≥15μl

OD260/280 = 1.7-2.2;

OD260/230≥1.5 ;

260 nm'de net zirve , kontaminasyon yok

Konsantrasyonun kubit ve kubit/nanopore ile ölçülmesi gerekir ≤ 2

Toplam RNA

≥1.2μg

≥100μg/μl

≥15μl

OD260/280 = 1.7-2.5;

OD260/230 = 0.5-2.5 ; kontaminasyon yok

Rin değeri ≥7.5

 

Hizmet İş Akışı

Örnek Hazırlık

Örnek Hazırlık

Kütüphane Hazırlığı

Kütüphane İnşaatı

Sıralama

Sıralama

Veri analizi

Veri analizi

Örnek QC

Proje teslimatı


  • Öncesi:
  • Sonraki:

  • DNA örneğinin veri kalitesi değerlendirmesi

    Tablo 1. Temiz verilerle ilgili istatistikler.

    Bmkid

    rawseqnum

    çiğsumbaz

    cleanseqnum

    temizlik

    Cleann50Len

    Cleann90Len

    Cleanmeanlen

    CleanMaxlen

    CleanMeanqual

    DNA_BMK01

    1.218.239

    26.37

    1.121.736

    25.90

    28.014

    15.764

    23.090

    143,181

    9

    RNA örneğinin veri kalitesi değerlendirmesi

    Tablo 1. Temiz verilerle ilgili istatistikler.

    Dosya adı

    Müşteri Kirası

    Okuma

    Sazlık

    N50

    Ortalama uzunluk

    Maksimum uzunluk

    Meanqscore

    RNA_BMK001

    C2

    8,947,708

    4.047,230,083

    398

    452

    129.227

    Çeyrek

    Şekil 1. Uzunluk dağılımını okuma

    A3

    Şekil 2. Temiz verilerin kalite puanı dağılımı

    A4

    Şekil 3. Temiz verilerin uzunluğu ve kalite puanı dağılımı

    A5

    Teklif Alın

    Mesajınızı buraya yazın ve bize gönderin

    Mesajınızı bize gönderin: