CircRNA Sekanslama-Ilumina
Özellikler
● RRNA tükenmesinin ardından yönlü kütüphane hazırlığı, iplik spesifik sıralama verilerini sağlayan.
● Biyoinformatik iş akışı, circRNA tahmini ve ekspresyon nicelemesini sağlar
Hizmet Avantajları
●Daha kapsamlı RNA kütüphaneleri:Kütüphane öncesi preparatımızda doğrusal RNA tükenmesi yerine rRNA tükenmesi kullanıyoruz, sekans verilerinin sadece circRNA'yı değil, aynı zamanda mRNA ve lncRNA'yı da içermesini sağlayarak, bu veri kümelerinin eklem analizini sağlayarak
●Rekabetçi endojen RNA (Cerna) ağlarının isteğe bağlı analizi: Hücresel düzenleyici mekanizmalar hakkında daha derin bilgiler sağlamak
●Kapsamlı uzmanlık: BMKGENE'de 20.000'den fazla numune işleme kaydıyla, çeşitli örnek türlerini ve lncRNA projelerini kapsayan ekibimiz, her projeye zengin bir deneyim getiriyor.
●Titiz kalite kontrolü: Örnek ve kütüphane hazırlığından sekanslama ve biyoinformatiklere kadar tüm aşamalarda çekirdek kontrol noktalarını uyguluyoruz. Bu titiz izleme, sürekli yüksek kaliteli sonuçların verilmesini sağlar.
● Satış sonrası desteği: Taahhüdümüz, 3 aylık satış sonrası hizmet dönemi ile projenin tamamlanmasının ötesine uzanmaktadır. Bu süre zarfında, sonuçlarla ilgili soruları ele almak için proje takibi, sorun giderme yardımı ve Soru-Cevap oturumları sunuyoruz.
Örnek gereksinimleri ve teslimat
| Kütüphane | Platform | Önerilen veriler | Veri QC |
| RRNA tükenmiş yön kütüphanesi | Illumina PE150 | 16-20 GB | S30% 85 |
Örnek gereksinimleri:
Nükleotidler:
| Conc. (Ng/μl) | Miktar (μg) | Saflık | Bütünlük |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0.5-2.5 Jel üzerinde gösterilen protein veya DNA kontaminasyonu sınırlı veya yok. | Rin≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; Sınırlı veya taban çizgisi yüksekliği yok |
● Bitkiler:
Kök, gövde veya taç yaprağı: 450 mg
Yaprak veya tohum: 300 mg
Meyve: 1.2 g
● Hayvan:
Kalp veya bağırsak: 450 mg
Vissera veya Beyin: 240 mg
Kas: 600 mg
Kemikler, saç veya cilt: 1.5g
● Eklembacaklılar:
Böcekler: 9g
Kabuklu: 450 mg
● Tam kan:2 Tüp
● Hücreler: 106 hücre
● Serum ve plazma: 6 ml
Önerilen Örnek Teslimat
Konteyner: 2 mL santrifüj tüpü (kalay folyo önerilmez)
Örnek etiketleme: grup+replikasyon EG A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Gönderi:
1. Kuru buz: Numunelerin torbalarla paketlenmesi ve kuru buzda gömülmesi gerekir.
2. RNastable Tüpler: RNA numuneleri RNA stabilizasyon tüpünde (örn. RNastable®) kurutulabilir ve oda sıcaklığında gönderilebilir.
Servis İş Akışı
Deney tasarımı
Örnek Teslimat
RNA ekstraksiyonu
Kütüphane İnşaatı
Sıralama
Veri analizi
Satış Sonrası Hizmetler
Biyoinformatik
CircRNA tahmini: kromozomal dağılım
Farklı olarak ifade edilen Circrnas - Volkan arsası
Farklı olarak ifade edilen circrnalar - hiyerarşik kümeleme
CircRNA'nın konak genlerinin fonksiyonel zenginleştirilmesi
BMKGene 'CircRNA Sekanslama Hizmetleri tarafından küratörlü bir yayın koleksiyonu aracılığıyla kolaylaştırılan araştırma gelişmelerini keşfedin.
Wang, X. ve ark. (2021) 'CPSF4, hepatoselüler karsinomda circRNA oluşumunu ve mikroRNA aracılı gen susturulmasını düzenler', Onkogen 2021 40:25, 40 (25), s. 4338-4351. doi: 10.1038/s41388-021-01867-6.
Xia, K. ve ark. (2023) 'X OO-duyarlı transkriptom, pirinçte osarab ekspresyonunu düzenleyerek hastalık direncindeki dairesel RNA133'ün rolünü ortaya çıkarır', Phytopatoloji Araştırması, 5 (1), s. 1-14. doi: 10.1186/s42483-023-00188-8/rakamlar/6.
Y, H. ve ark. (2023) 'CPSF3, hepatoselüler karsinomdaki dairesel ve doğrusal transkriptlerin dengesini modüle eder'. doi: 10.21203/rs.rs-2418311/v1.
Zhang, Y. ve ark. (2023) 'Karaciğer transplantasyonundan önce ve sonra sirhotik kardiyomiyopatide circrnaların kapsamlı değerlendirilmesi', Uluslararası İmmünofarmakoloji, 114, s. 109495. DOI: 10.1016/j.Intimp.2022.109495.
