Exclusive Agency for Korea

条形 Banner-03

Ürünler

16S/18S/Amplicon Sıralama-Ngs

Özellikle 16S, 18S ve genetik belirteçlerini hedefleyen Illumina teknolojisi ile amplikon sekanslaması, mikrobiyal topluluklar içindeki filogeni, taksonomiyi ve türlerin bolluğunu çözmek için güçlü bir yöntemdir. Bu yaklaşım, temizlik genetik belirteçlerinin hiper değişkenli bölgelerinin sıralanmasını içerir. Başlangıçta moleküler bir parmak izi olarak tanıtıldıWoeses ve ark.1977'de bu teknik, izolasyonsuz analizler sağlayarak mikrobiyom profilinde devrim yaratmıştır. 16'ların (bakteriler), 18S (mantar) ve iç kopyalanmış ara parçaların (ITS, mantarlar) dizilimi sayesinde araştırmacılar sadece bol miktarda türü değil, aynı zamanda nadir ve tanımlanamayanları da tanımlayabilirler. Çok önemli bir araç olarak yaygın olarak benimsenen amplikon dizilimi, insan ağzı, bağırsak, dışkı ve ötesi de dahil olmak üzere çeşitli ortamlarda diferansiyel mikrobiyal bileşimleri ayırt etmede etkili olmuştur.


Hizmet Ayrıntıları

Biyoinformatik

Demo sonuçları

Öne çıkan yayınlar

Hizmet Özellikleri

● Sekanslama platformu: Illumina novaseq.

● Diğer amplifikasyon hedeflerinin yanı sıra 16S, 18S ve ITS'nin kısa bölgelerinin amplifikasyonu.

● Amplikonun esnek seçenekleri.

● Çoklu amplifikasyon hedefleri ile önceki proje deneyimi.

Hizmet Avantajları

İzolsüz:Çevresel örneklerde mikrobiyal bileşimin hızlı tanımlanması.

Yüksek çözünürlük: Çevresel numunelerdeki düşük bol bileşenlerde.

Yaygın olarak uygulanabilir: Çeşitli mikrobiyal topluluk çalışmaları.

Kapsamlı biyoinformatik analiz: Veritabanı, ek açıklama, OTU/ASV açısından çeşitli analizlerle en son Qiime2 paketi (mikrobiyal ekolojiye kantitatif içgörü).

Kapsamlı uzmanlık: Yıllık 150 bin amplikon sıralama projesi ile BMKGene on yıldan fazla deneyim, yüksek vasıflı bir analiz ekibi, kapsamlı içerik ve mükemmel satış sonrası desteği getiriyor.

Hizmet Özellikleri

Kütüphane

Sıralama stratejisi

Veriler önerilir

Amplikon

Illumina PE250

50/100/300K Etiketler (çiftleri okuma)

Hizmet Gereksinimleri

Konsantrasyon (ng/µL)

Toplam miktar (ng)

Hacim (µl)

≥1

≥200

≥20

● Toprak/çamur: 1-2G
● Bağırsak İçeriği-Animal: 0.5-2G
● Bağırsak İçeriği-İnsekt: 0.1-0.25g
● Bitki yüzeyi (zenginleştirilmiş tortu): 0.1-0.5g
● Fermantasyon suyu zenginleştirilmiş tortu): 0.1-0.5g
● Dışkı (büyük hayvanlar): 0.5-2G
● Dışkı (fare): 3-5 gren
● Pulmoner alveoler lavaj sıvısı: filtre kağıdı
● Vajinal Swab: 5-6 Swab
● Cilt/genital Swab/Tükürük/Oral Yumuşak Doku/Faringeal Swab/Rektal Swab: 2-3 SWAB
● Yüzey mikroorganizmaları: filtre kağıdı
● Su gövdesi/hava/biyofilm: filtre kağıdı
● Endofitler: 1-2G
● Diş plakası: 0.5-1g

Servis İş Akışı

Örnek Teslimat

Örnek Teslimat

Kütüphane Hazırlığı

Kütüphane İnşaatı

Sıralama

Sıralama

Veri analizi

Veri analizi

Satış Sonrası Hizmetler

Satış Sonrası Hizmetler


  • Öncesi:
  • Sonraki:

  • 流程图第三版 2-01

    Aşağıdaki analizi içerir:

    • Ham veri kalitesi kontrolü
    • OTU Kümeleme /DE-GOISE (ASV)
    • OTU ek açıklaması
    • Alfa Çeşitlilik Analizi: Shannon, Simpson ve Ace dahil olmak üzere çoklu dizinler.
    • Beta Çeşitlilik Analizi
    • Gruplar arası analiz
    • Korelasyon analizi: çevresel faktörler ile kompozisyon ve çeşitlilik arasında
    • 16s fonksiyonel gen tahmini

    Taksonomik dağılımın histogramı

     

    3

     

    Taksonomik bolluk kümeleme ısı haritası

    4

     

    Alfa Çeşitlilik Analizi: Nadir Faksiyon Eğrisi

    5

     

    Beta Çeşitlilik Analizi: NMD'ler

    6

     

    Gruplar Arası Analiz: Lefse Biyomarker Keşfi

    7

     

     

     

    BMKGene'nin Amplicon Sıralama Hizmetleri tarafından Küratörlü Bir Yayın Koleksiyonu aracılığıyla Illumina ile kolaylaştırılan gelişmeleri keşfedin.

    Dong, C. ve ark. (2022) 'Montaj, Çekirdek Mikrobiyota ve Rhizosfer Toprağının ve Eucommiya Ulmoides Mikrobiyotasının Fonksiyonu', Mikrobiyolojideki Sınırlar, 13. DOI: 10.3389/fmicb.2022.855317/ful.

    Li, Y. ve ark. (2023) 'Farelerde Gardnerella vaginalis kaynaklı bakteriyel vajinoz tedavisi için sentetik bakteriyel konsorsiyum transplantasyonu', Microbiyome, 11 (1), s. 1-14. doi: 10.1186/s40168-023-01497-y

    Yang, J., Fu, Y. ve Liu, H. (2022) 'Yer tabanlı kapalı biyoregeneratif yaşam destek deneyi “Ay Palace 365”', Çevre Mikrobiyomları, 17 (1), s. 1-20. doi: 10.1186/s40793-022-00399-0/rakamlar/8.

    Yin, S. ve ark. (2022) 'Azot transformasyonu ile ilgili fonksiyonel genlerin hammaddeye bağlı bolluğu, kompostlamada kontrollü azot kaybı', Bioresource Technology, 361, s. 127678. Doi: 10.1016/j.biortech.2022.127678.

    Teklif Alın

    Mesajınızı buraya yazın ve bize gönderin

    Mesajınızı bize gönderin: