Buong transcriptome na pagkakasunud -sunod - Illumina
Mga tampok
● Dual Library sa Sequence Ang kumpletong transcriptome: pag -ubos ng rRNA na sinusundan ng paghahanda ng PE150 library at pagpili ng laki na sinusundan ng paghahanda ng library ng SE50
● Kumpletuhin ang pagsusuri ng bioinformatics ng mRNA, lncRNA, circRNA, at miRNA sa magkahiwalay na mga ulat ng bioinformatics
● Pinagsamang pagsusuri ng lahat ng expression ng RNA sa isang pinagsamang ulat, kabilang ang pagsusuri sa CERNA Networks.
Mga kalamangan sa serbisyo
●Malalim na pagsusuri ng mga network ng regulasyon: Ang pagsusuri sa network ng CERNA ay pinagana ng magkasanib na pagkakasunud -sunod ng mRNA, lncRNA, circRNA, at miRNA at sa pamamagitan ng isang kumpletong bioinformatic workflow.
●Komprehensibong anotasyon: Gumagamit kami ng maraming mga database upang gumana na i -annotate ang mga kaugalian na ipinahayag na mga gen (DEGS) at isinasagawa ang kaukulang pagsusuri ng pagpapayaman, na nagbibigay ng mga pananaw sa mga proseso ng cellular at molekular na pinagbabatayan ng tugon ng transcriptome.
●Malawak na kadalubhasaan: Sa pamamagitan ng isang track record ng matagumpay na pagsasara ng higit sa 2100 buong mga transcriptome na proyekto sa iba't ibang domain ng pananaliksik, ang aming koponan ay nagdadala ng isang kayamanan ng karanasan sa bawat proyekto.
●Mahigpit na kontrol ng kalidad: Nagpapatupad kami ng mga pangunahing control point sa lahat ng mga yugto, mula sa paghahanda ng sample at library hanggang sa pagkakasunud -sunod at bioinformatics. Ang masusing pagsubaybay na ito ay nagsisiguro sa paghahatid ng patuloy na mataas na kalidad na mga resulta.
●Suporta sa Post-Sales: Ang aming pangako ay lampas sa pagkumpleto ng proyekto na may 3-buwan na panahon ng serbisyo pagkatapos ng pagbebenta. Sa panahong ito, nag-aalok kami ng follow-up ng proyekto, tulong sa pag-aayos, at mga sesyon ng Q&A upang matugunan ang anumang mga query na may kaugnayan sa mga resulta
Halimbawang mga kinakailangan at paghahatid
| Library | Diskarte sa pagkakasunud -sunod | Inirerekomenda ang data | KONTROL CONTROL |
| Nabigo ang rRNA | Illumina PE150 | 16 GB | Q30≥85% |
| Pinili ang laki | Illumina SE50 | 10-20m Reads |
Mga kinakailangan sa halimbawang:
Nucleotides:
| Conc. (Ng/μl) | Halaga (μg) | Kadalisayan | Integridad |
| ≥ 80 | ≥ 1.6 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0.5-2.5 Limitado o walang kontaminasyon ng protina o DNA na ipinapakita sa gel. | Rin≥6.0 5.0≥28S/18S≥1.0; limitado o walang elevation ng baseline |
Inirerekumendang paghahatid ng sample
Lalagyan: 2 ml centrifuge tube (tin foil ay hindi inirerekomenda)
Halimbawang label: pangkat+magtiklop ng EG A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Kargamento:
1. Dry-Ice: Ang mga sample ay kailangang maimpake sa mga bag at inilibing sa dry-ice.
2. Rnastable tubes: Ang mga sample ng RNA ay maaaring matuyo sa RNA stabilization tube (EG RNastable®) at ipinadala sa temperatura ng silid.
Daloy ng trabaho sa serbisyo
Disenyo ng eksperimento
Halimbawang paghahatid
Pagkuha ng RNA
Konstruksyon ng Library
Pagkakasunud -sunod
Pagtatasa ng data
Mga serbisyo pagkatapos ng pagbebenta
Bioinformatics
Pangkalahatang -ideya ng expression ng RNA
Naiiba ang ipinahayag na mga gene
Pagtatasa ng CERNA
Naiiba ang ipinahayag na mga miRNA at mga kaugnay na RNA
Galugarin ang mga pagsulong sa pananaliksik na pinadali ng buong serbisyo ng pagkakasunud -sunod ng bmkgene 'sa pamamagitan ng isang curated na koleksyon ng mga publikasyon.
Dai, Y. et al. . doi: 10.1039/d1mo00370d.
Liu, N. Nan et al. . doi: 10.1016/j.gene.2022.146503.
Wang, XJ et al. . 904865. Doi: 10.3389/fonc.2022.904865/bibtex.
Xu, P. et al. . doi: 10.1186/s12864-022-08470-3/figure/7.
Yan, Z. et al. . 111878. Doi: 10.1016/j.postharvbio.2022.111878.
