Exclusive Agency for Korea

条形banner-03

Mga produkto

Buong genome bisulfite sequencing (WGBS)

企业微信截图_17374388013932

Ang Whole Genome Bisulfite Sequencing (WGBS) ay tumatayo bilang gold-standard na pamamaraan para sa malalim na paggalugad ng DNA methylation, partikular ang ikalimang posisyon sa cytosine (5-mC), isang pivotal regulator ng gene expression at cellular activity. Ang prinsipyong pinagbabatayan ng WGBS ay nagsasangkot ng paggamot ng bisulfite, na nag-uudyok sa conversion ng mga unmethylated cytosines sa uracil (C to U), habang iniiwan ang mga methylated cytosine na hindi nagbabago. Ang diskarteng ito ay nag-aalok ng solong-base na resolusyon, na nagpapahintulot sa mga mananaliksik na komprehensibong mag-imbestiga sa methylome at mag-alis ng mga abnormal na pattern ng methylation na nauugnay sa iba't ibang mga kondisyon, lalo na ang cancer. Sa pamamagitan ng paggamit ng WGBS, ang mga siyentipiko ay makakakuha ng walang kapantay na mga insight sa genome-wide methylation landscape, na nagbibigay ng isang nuanced na pag-unawa sa mga mekanismo ng epigenetic na sumasailalim sa magkakaibang biological na proseso at sakit.


Mga Detalye ng Serbisyo

Bioinformatics

Mga Resulta ng Demo

Itinatampok na mga publikasyon

Mga Tampok ng Serbisyo

● Nangangailangan ng reference na genome.

● Idinagdag ang Lambda DNA upang subaybayan ang kahusayan ng conversion ng bisulfite.

● Sequencing sa Illumina NovaSeq.

Mga Kalamangan sa Serbisyo

Gold Standard para sa DNA Methylation Research: Ang teknolohiyang ito sa pagpoproseso ng mature na methylation conversion ay may mataas na katumpakan at mahusay na reproducibility.

Malawak na Saklaw at Single-base na Resolusyon:pagtuklas ng mga site ng methylation sa antas ng genome-wide.

Kumpletong Platform:magbigay ng one-stop na mahusay na serbisyo mula sa sample processing, library construction, sequencing sa bioinformatics analysis.

Malawak na Dalubhasa: kasama ang mga proyekto sa pagkakasunud-sunod ng WGBS na matagumpay na nakumpleto sa iba't ibang hanay ng mga species, ang BMKGENE ay nagdadala ng higit sa isang dekada ng karanasan, isang mahusay na pangkat ng pagsusuri, komprehensibong nilalaman, at mahusay na suporta pagkatapos ng pagbebenta.

Posibilidad na Sumali sa Transcriptomics Analysis: nagpapahintulot para sa pinagsamang pagsusuri ng WGBS sa iba pang data ng omics tulad ng RNA-seq.

Mga Pagtutukoy ng Sample

Library

Diskarte sa Pagsunod-sunod

Inirerekomendang output ng data

Kontrol sa kalidad

Ginagamot ang bisulfite

Illumina PE150

30x ang lalim

Q30 ≥ 85%

Bisulfite conversion > 99%

Mga Sample na Kinakailangan

 

Konsentrasyon (ng/µL)

Kabuuang halaga (µg)

Mga karagdagang kinakailangan

Genomic DNA

≥ 5

≥ 400 ng

Limitadong pagkasira o kontaminasyon

Daloy ng Trabaho ng Serbisyo

paghahatid ng sample

Paghahatid ng sample

Eksperimento ng piloto

Pagkuha ng DNA

Paghahanda sa Aklatan

Paggawa ng aklatan

Pagsusunod-sunod

Pagsusunod-sunod

Pagsusuri ng datos

Pagsusuri ng datos

数据上传-01

Paghahatid ng data


  • Nakaraan:
  • Susunod:

  • 流程图 羽4-01

    Kasama ang sumusunod na pagsusuri:

    ● Raw sequencing quality control;

    ● Pagmamapa upang sumangguni sa genome;

    ● Detection ng 5mC methylated base;

    ● Pagsusuri ng pamamahagi at anotasyon ng methylation;

    ● Pagsusuri ng Differentially Methylated Regions (DMRs);

    ● Functional na anotasyon ng mga gene na nauugnay sa mga DMR.

    5mC methylation detection: mga uri ng methylated site

     

    图片79

     

    Mapa ng methylation. 5mC methylation genome-wide distribution

     

    图片80

     

    Anotasyon ng mga highly methylated na rehiyon

    图片81

    Differentially Methylated Rehiyon: nauugnay na mga gene

     

    图片82

     

    Differentially Methylated Rehiyon: anotasyon ng nauugnay na mga gene (Gene Ontology)

     

    图片83

     

    Galugarin ang mga pagsulong sa pananaliksik na pinadali ng buong genome bisulfite sequencing na serbisyo ng BMKGene sa pamamagitan ng na-curate na koleksyon ng mga publikasyon.

    Fan, Y. et al. (2020) 'Pagsusuri ng mga profile ng DNA methylation sa panahon ng pag-unlad ng kalamnan ng kalansay ng tupa gamit ang buong-genome bisulfite sequencing',BMC Genomics, 21(1), pp. 1–15. doi: 10.1186/S12864-020-6751-5.

    Zhao, X. et al. (2022) 'Novel deoxyribonucleic acid methylation perturbations sa mga manggagawang nalantad sa vinyl chloride',Toxicology at Industrial Health, 38(7), pp. 377–388. doi: 10.1177/07482337221098600

    Zuo, J. et al. (2020) 'Mga ugnayan sa pagitan ng genome methylation, mga antas ng non-coding RNAs, mRNAs at metabolites sa ripening tomato fruit',Ang Plant Journal, 103(3), pp. 980–994. doi: 10.1111/TPJ.14778.

    kumuha ng quote

    Isulat ang iyong mensahe dito at ipadala ito sa amin

    Ipadala ang iyong mensahe sa amin: