Maliit na pagkakasunud-sunod ng RNA-illumina
Mga tampok
● Ang paghahanda ng aklatan ay may kasamang hakbang sa pagpili ng laki
● Pagsusuri ng Bioinformatic na nakasentro sa paligid ng hula ng miRNA at ang kanilang mga target
Mga kalamangan sa serbisyo
●Komprehensibong pagsusuri ng bioinformatics:Pagpapagana ng pagkakakilanlan ng parehong kilalang at nobelang miRNAs, pagkakakilanlan ng mga target na miRNAs, at kaukulang functional annotation at pagpapayaman na may maraming mga database (KEGG, GO)
●Mahigpit na kontrol ng kalidad: Nagpapatupad kami ng mga pangunahing control point sa lahat ng mga yugto, mula sa paghahanda ng sample at library hanggang sa pagkakasunud -sunod at bioinformatics. Ang masusing pagsubaybay na ito ay nagsisiguro sa paghahatid ng patuloy na mataas na kalidad na mga resulta.
●Suporta sa Post-Sales: Ang aming pangako ay lampas sa pagkumpleto ng proyekto na may 3-buwan na panahon ng serbisyo pagkatapos ng pagbebenta. Sa panahong ito, nag-aalok kami ng follow-up ng proyekto, tulong sa pag-aayos, at mga sesyon ng Q&A upang matugunan ang anumang mga query na may kaugnayan sa mga resulta.
●Malawak na kadalubhasaan: Sa pamamagitan ng isang track record ng matagumpay na pagsasara sa maraming mga proyekto ng sRNA na sumasaklaw sa higit sa 300 species sa iba't ibang mga domain ng pananaliksik, ang aming koponan ay nagdadala ng isang kayamanan ng karanasan sa bawat proyekto.
Halimbawang mga kinakailangan at paghahatid
| Library | Platform | Inirerekumendang data | Data QC |
| Pinili ang laki | Illumina SE50 | Nagbabasa ang 10m-20m | Q30≥85% |
Mga kinakailangan sa halimbawang:
Nucleotides:
| Conc. (Ng/μl) | Halaga (μg) | Kadalisayan | Integridad |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0.5-2.5 Limitado o walang kontaminasyon ng protina o DNA na ipinapakita sa gel. | Rin≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; limitado o walang elevation ng baseline |
● Halaman:
Ugat, stem o petal: 450 mg
Dahon o binhi: 300 mg
Prutas: 1.2 g
● Hayop:
Puso o bituka: 450 mg
Viscera o utak: 240 mg
Kalamnan: 600 mg
Mga buto, buhok o balat: 1.5g
● Mga Arthropod:
Mga Insekto: 9g
Crustacea: 450 mg
● Buong dugo: 2 tubes
● Mga Cell: 106 mga cell
● Serum at plasma:6 ml
Inirerekumendang paghahatid ng sample
Lalagyan: 2 ml centrifuge tube (tin foil ay hindi inirerekomenda)
Halimbawang label: pangkat+magtiklop ng EG A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Kargamento:
1. Dry-Ice: Ang mga sample ay kailangang maimpake sa mga bag at inilibing sa dry-ice.
2. Rnastable tubes: Ang mga sample ng RNA ay maaaring matuyo sa RNA stabilization tube (EG RNastable®) at ipinadala sa temperatura ng silid.
Daloy ng trabaho sa serbisyo
Disenyo ng eksperimento
Halimbawang paghahatid
Pagkuha ng RNA
Konstruksyon ng Library
Pagkakasunud -sunod
Pagtatasa ng data
Mga serbisyo pagkatapos ng pagbebenta
Bioinformatics
● Kontrol ng kalidad ng data ng hilaw
● Pag -uuri ng sRNA
● Pag -align sa isang sangguniang genome
● Pagkilala sa kilalang at nobelang miRNA
● Pagkakaiba -iba ng pagsusuri ng expression ng miRNA
● Functional annotation ng mga target ng miRNA
Pagkilala sa miRNA: istraktura at lalim
Pagkakaiba -iba ng expression ng miRNA - Hiearchical clustering
Functional annotation ng target ng kaugalian na ipinahayag miRNAs
Galugarin ang mga pagsulong sa pananaliksik na pinadali ng mga serbisyo ng pagkakasunud -sunod ng bmkgene 'sa pamamagitan ng isang curated na koleksyon ng mga publikasyon.
Chen, H. et al. . 108038. Doi: 10.1016/j.plaphy.2023.108038.
Li, H. et al. . doi: 10.15252/yakap.202255037/suppl_file/yakap202255037-sup-0004-sdatafig4.tif.
Yu, J. et al. (2023) 'Kinokontrol ng microRNA AME-Bantam-3P . 5726. Doi: 10.3390/ijms24065726/s1.
Zhang, M. et al. . doi: 10.1159/000489649.
