Ang mga maliliit na RNA ay uri ng maikling di-coding RNA na may average na haba ng 18-30 nt, kabilang ang miRNA, siRNA at pIRNA. Ang mga maliliit na RNA na ito ay malawakang naiulat na kasangkot sa iba't ibang mga biological na proseso tulad ng pagkasira ng mRNA, pagsugpo sa pagsasalin, pagbuo ng heterochromatin, atbp. Ang sequencing analysis platform ay binubuo ng karaniwang pagsusuri at advanced na pagmimina ng data. Sa base ng data ng RNA-seq, ang pamantayang pagsusuri ay maaaring makamit ang pagkakakilanlan at hula ng miRNA, hula ng target na miRNA na hula, annotation at expression analysis. Pinapayagan ng Advanced na Pagtatasa ang na -customize na miRNA paghahanap at pagkuha, henerasyon ng venn diagram, miRNA at target na gusali ng network ng gene.